Dechiffrer den genetiske arkitektur af autoimmune sygdomme

OVERSIGT:

Målet med dette forslag er at undersøge de genomiske oprindelser af heterogenitet i både risiko og specifik fænotype af autoimmune sygdomme med særlig vægt på forståelse og adressering af sundhedsmæssige forskelle i disse sygdomme. Autoimmune sygdomme, især systemisk lupus erythematosus (SLE), manifesterer sig i en tidligere alder og har dårligere kliniske resultater hos individer af ikke-europæisk aner. Ligeledes viser immunologiske genetiske varianter en differentiel udvikling baseret på geografisk patogent tryk; Næsten 13 procent af loci for SLE, der ikke inkluderer humane leukocytantigener (HLA), viser tegn på naturlig selektion. Derfor er det afgørende for at forstå genomikken for autoimmunitet globalt og i ikke-europæiske populationer afgørende for at forstå disse observationer.

Forekomsten af ​​autoimmune sygdomme i Peru er vanskelig at estimere, da diagnoser kræver serologier, der ikke er tilgængelige, men det anslås, at der er en stor del af udiagnostiserede eller ubehandlede tilfælde i landet. Nogle undersøgelser udført i Latinamerika og USA rapporterer, at Mestizo -befolkningen præsenterer SLE i en tidligere alder med mere systemisk involvering end europæiske befolkninger. Det er nødvendigt at erkende, at der er et betydeligt hul i genomiske undersøgelser udført inden for autoimmune sygdomme, hvilket afslører en alvorlig underrepræsentation i de oprindelige populationer i Nord- og Sydamerika. Som svar på dette kritiske behov er der etableret samarbejde mellem læger i forskellige områder af Peru og Latinamerika for at studere den genomiske arkitektur af autoimmunitet i oprindelige mennesker i Sydamerika, hvilket udfører avancerede genomiske undersøgelser i denne underudforskede og højrisikopopulation og evaluering af populationsspecifikke genetiske varianter, der kan bidrage til identificeringen af ​​årsagsgener. inklusive kodning eller strukturelle ændringer. Vi foreslår at udføre avancerede genomiske studier i populationer fra forskellige områder af Peru (Amazon, Andes, kyst) for at beskrive den genomiske arkitektur i denne tidligere ustudierede befolkning.

Generelt mål:

Det generelle mål med dette projekt er at bruge genomiske strategier til at evaluere det molekylære grundlag for humane autoimmune sygdomme, der er repræsentative for peruanske populationer. Diversificering i genomiske undersøgelser er nødvendig for at nå personaliseret medicin og samarbejde med samfundsledere og lokale forskere vil sikre samfundsdeltagelse og individuelt engagement samt uddannelses- og uddannelsesaktiviteter.

Specifikke mål:

Specifikt mål 1: At identificere genetiske markører forbundet med genetisk risiko for autoimmune sygdomme i den oprindelige population af Peru.

Specifikt mål 2: At evaluere den integrerende multiomik (genomik, epigenomik og eksposom) af miljømæssig kontekst forbundet med autoimmunitet i Peru.

Specifikt mål 3: At karakterisere mikrobiomet hos patienter med autoimmunitet i Peru.

Primært slutpunkt:

Succesfuld rekruttering og helgenomsekventering af mindst 20 multiplexfamilier med høj familiær autoimmunitetsbelastning, hvilket muliggør identifikation og foreløbig annotation af sjældne eller nye genetiske varianter, der potentielt er knyttet til autoimmun sygdoms følsomhed.