Descifrar la arquitectura genética de las enfermedades autoinmunes

RESUMEN:

El objetivo de esta propuesta es investigar los orígenes genómicos de la heterogeneidad tanto en el riesgo como en el fenotipo específico de las enfermedades autoinmunes, con un énfasis particular en comprender y abordar las disparidades de salud de estas enfermedades. Las enfermedades autoinmunes, especialmente el lupus eritematoso sistémico (LES), se manifiestan a una edad más temprana y tienen peores resultados clínicos en individuos de ascendencia no europea. Del mismo modo, las variantes genéticas inmunológicas muestran una evolución diferencial basada en la presión patógena geográfica; Casi el 13 por ciento de los loci para LES, sin incluir antígenos de leucocitos humanos (HLA), muestran signos de selección natural. Por lo tanto, investigar la genómica de la autoinmunidad a nivel mundial y en las poblaciones no europeas es crucial para comprender estas observaciones.

La prevalencia de enfermedades autoinmunes en Perú es difícil de estimar, ya que los diagnósticos requieren serologías a las que no son accesibles, pero se estima que hay una gran proporción de casos no diagnosticados o no tratados en el país. Algunos estudios realizados en América Latina y los Estados Unidos informan que la población de Mestizo presenta LES a una edad más temprana, con una participación más sistémica que las poblaciones europeas. Es necesario reconocer que existe una brecha significativa en los estudios genómicos realizados en el campo de las enfermedades autoinmunes, revelando una subrepresentación grave en las poblaciones indígenas de América del Norte y del Sur. En respuesta a esta necesidad crítica, se han establecido colaboraciones entre los médicos en diferentes áreas de Perú y América Latina para estudiar la arquitectura genómica de la autoinmunidad en los pueblos indígenas en América del Sur, llevando a cabo los estudios genómicos de vanguardia en esta población bajo y alta población de riesgo y evaluando las variantes genéticas específicas de la población que pueden contribuir con la identificación de la causa causal. incluyendo codificación o cambios estructurales. Proponemos llevar a cabo estudios genómicos de vanguardia en poblaciones de diferentes áreas de Perú (Amazon, Andes, Costa) para describir la arquitectura genómica en esta población previamente no estudiada.

Objetivo general:

El objetivo general de este proyecto es utilizar estrategias genómicas para evaluar la base molecular de las enfermedades autoinmunes humanas, representantes de las poblaciones peruanas. La diversificación en estudios genómicos es necesaria para alcanzar la medicina personalizada y la colaboración con líderes comunitarios e investigadores locales garantizarán la participación de la comunidad y la participación individual, así como las actividades de capacitación y educación.

Objetivos específicos:

Objetivo específico 1: identificar marcadores genéticos asociados con el riesgo genético de enfermedades autoinmunes en la población indígena de Perú.

Objetivo específico 2: evaluar la multiómica integradora (genómica, epigenómica y exposición) del contexto ambiental asociado con la autoinmunidad en Perú.

Objetivo específico 3: Caracterizar el microbioma en pacientes con autoinmunidad en Perú.

Punto final primario:

El reclutamiento exitoso y la secuenciación del genoma completo de al menos 20 familias multiplex con una alta carga de autoinmunidad familiar, permitiendo la identificación y la anotación preliminar de variantes genéticas raras o novedosas potencialmente vinculadas a la susceptibilidad a la enfermedad autoinmune.