Genekspressionsprofilering og genetisk analyse af væv fra patienter med brystkræft

PRIMÆRE MÅL:

1. For at bestemme, om amplifikation og/eller overekspression af erbB-2 er forbundet med enten yderligere eller mindre fordele ved at øge doser af doxorubicin eller fire cyklusser af paclitaxel.
2. For at bestemme, om abnormiteter i p53 (mutationer, deletioner, proteinstabilisering) er forbundet med enten yderligere eller mindre fordele ved at øge doser af doxorubicin eller fire cyklusser af paclitaxel.
3. At sammenligne analysemetoder for erbB-2 og p53 ved at bruge de mest almindelige metoder til analyse for disse biomarkører for at bestemme, om en metode er mere forudsigelig for klinisk udfald end en anden, eller om metoderne er komplementære.
4. At identificere biomarkører, der kan bruges til individuelt at skræddersy brugen af ​​adjuverende dosistæt terapi.
5. At identificere grupper af patienter, der har en dårlig prognose, på trods af adjuverende kemoterapi, som prospektivt bør målrettes for nye tilgange til adjuverende behandling.
6. At identificere biomarkører, der kan bruges til individuelt at skræddersy brugen af ​​adjuverende paclitaxelbehandling.
7. At identificere grupper af patienter, der har en dårlig prognose på trods af adjuverende kemoterapi, som prospektivt bør målrettes for nye tilgange til adjuverende behandling.
8. For at bestemme, om den iboende undertype, som bestemt ved PAM50-assay, er forbundet med gavn af paclitaxel (C9344) og fra dosistæt kemoterapi (C9741) uanset status for klinisk østrogenreceptor (ER) og human epidermal vækstfaktor receptor 2 (HER2).
9. For at bestemme, om den iboende undertype er forbundet med fordele ved paclitaxel og fra dosistæt kemoterapi i den HER2-negative undergruppe, som defineret af vævsmikroarray-analysen (TMA) af HER2 gennemført i afsnit B2 og B3 i denne protokol.
10. For at bestemme om tilbagefaldsscore, som bestemt ved PAM50-assay, er forbundet med fordele ved paclitaxel og fra dosistæt kemoterapi uanset klinisk ER- og HER2-status.
11. For at bestemme, om tilbagefaldsscore er forbundet med fordel ved paclitaxel og fra dosistæt kemoterapi i den HER2-negative undergruppe.
12. At evaluere sammenhængen mellem en PAM50-defineret spredningsscore og drage fordel af paclitaxel og fra dosistæt kemoterapi.
13. For at evaluere, om patienter identificeret som havende basal brystcancer ved PAM50-analysen har gavn af paclitaxel.

SEKUNDÆRE MÅL:

1. At sammenligne ydeevnen af ​​de PAM50-definerede iboende undertyper med undertypediagnoserne bestemt af antistofpanelet, udviklet i afsnit B2 og B3 i denne protokol, til at forudsige fordele ved paclitaxel og fra dosistæt kemoterapi i den HER2-negative undergruppe.
2. At evaluere den prognostiske værdi af den PAM50-definerede tilbagefaldsscore hos patienter, der ikke modtager paclitaxelbehandling (C9344).
3. At undersøge ydeevnen af ​​en multivariat model, herunder proliferationsscore og risiko for tilbagefald ved forudsigelse af fordele ved paclitaxel og fra dosistæt kemoterapi.

OMRIDS:

Formalinfikserede, paraffinindlejrede vævsblokke analyseres for amplifikation og/eller overekspression af erbB-2 (HER-2/neu) og for mutationer eller deletioner af p53 ved fluorescerende in situ hybridisering (FISH) og immunhistokemi.