Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Identifikation af prognostiske biomarkører for progression af invasivt planocellulært karcinom

9. oktober 2025 opdateret af: Dennis Wigle, Mayo Clinic
Undersøgelsen vil anvende både retrospektiv og prospektiv dataindsamling fra patienter, der allerede har fået foretaget en bronkoskopi og lungeresektion eller vil have en bronkoskopi og lungeresektion for planocellulært karcinom. Efterforskerne planlægger prospektivt at indsamle 5 bronkoskopiske biopsier, 10 ml blod og en tumor og tilstødende normale prøver fra 200 kvalificerede patienter, der opfylder undersøgelseskriterierne.

Studieoversigt

Detaljeret beskrivelse

Undersøgelsen vil anvende både retrospektiv og prospektiv dataindsamling fra patienter, der allerede har fået foretaget en bronkoskopi og lungeresektion eller vil få foretaget en bronkoskopi og lungeresektion for planocellulært karcinom. Efterforskerne planlægger prospektivt at indsamle 5 bronkoskopiske biopsier, 10 ml blod og en tumor og tilstødende normale prøver fra 200 kvalificerede patienter, der opfylder undersøgelseskriterierne. Hvis en patient allerede har fået foretaget en bronkoskopi og har givet samtykke til at få prøver opbevaret til forskning på Mayo Clinic Rochester, vil vi få adgang til dem til forskningsundersøgelsen, hvis de er tilgængelige. Ellers, hvis patienten allerede er blevet opereret, og væv ikke er blevet opbevaret til forskning, vil efterforskerne give patienterne tilladelse til at bruge deres kliniske prøver til forskningsstudiet. Efterforskerne vil derefter ekstrahere DNA fra vævssnit og blod og bruge et tilpasset målrettet sekventeringspanel af 23 cancerdrivergener med betydelige mutationer i planocellulært karcinom, som de har udviklet for at finde de prognostiske biomarkører. DNA'et vil blive brugt i en PCR-reaktion til at generere amplikoner til biblioteksforberedelse ved hjælp af Illumina Nextera XT biblioteksforberedelsesprotokol og målrettet sekventering på Illumina Hiseq-sequenceren. Aflæsningerne vil blive justeret til HG19 ved hjælp af BWA aligner og variantdetektion udført med Agilent SureCall og GATK analytiske værktøjer.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Faktiske)

22

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

    • Minnesota
      • Rochester, Minnesota, Forenede Stater, 55905
        • Mayo Clinic in Rochester

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år og ældre (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Mayo Clinic Thoracic Surgery Patienter

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • kendt eller mistænkt planocellulært karcinom i lungen
  • i stand til at give samtykke
  • kunne allerede have fået en bronkoskopi eller kirurgisk resektion med væv gemt på Mayo Clinic Rochester
  • vil gennemgå en bronkoskopi og have en kirurgisk resektion på Mayo Clinic Rochester

Ekskluderingskriterier:

  • ude af stand til at give samtykke
  • gravid

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Observationsmodeller: Kun etui
  • Tidsperspektiver: Fremadrettet

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Vævssamling
Vi planlægger prospektivt at indsamle 5 bronkoskopiske biopsier, 3 ml blod og en tumor og tilstødende normale prøver fra 200 kvalificerede patienter, der opfylder undersøgelseskriterierne. Hvis en patient allerede har fået foretaget en bronkoskopi og har prøver til rådighed, som tidligere blev indsamlet og opbevaret til forskning på Mayo Clinic, vil vi bruge disse prøver.
Vi vil derefter udtrække DNA fra vævssnit og blod og bruge et tilpasset målrettet sekventeringspanel af 23 cancerdrivergener med signifikante mutationer i planocellulært karcinom, som vi har udviklet for at finde de prognostiske biomarkører. DNA'et vil blive brugt i en PCR-reaktion til at generere amplikoner til biblioteksforberedelse ved hjælp af Illumina Nextera XT biblioteksforberedelsesprotokol og målrettet sekventering på Illumina Hiseq-sequenceren. Aflæsningerne vil blive justeret til HG19 ved hjælp af BWA aligner og variantdetektion udført med Agilent SureCall og GATK analytiske værktøjer.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Antal og typer af tilbagevendende genomiske ændringer evalueret af et brugerdefineret målrettet sekventeringspanel.
Tidsramme: 2 år
Formålet med denne undersøgelse er at identificere og karakterisere tilbagevendende genomisk ændring fundet i invasivt planocellulært carcinom, som er til stede i precursor-luftvejsepitelvævet, men fraværende i normalt væv undersøgt fra prøver taget under en lungeprocedure.
2 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Dennis Wigle, MD, PhD, Mayo Clinic

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Hjælpsomme links

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

8. april 2015

Primær færdiggørelse (Faktiske)

23. april 2020

Studieafslutning (Faktiske)

23. april 2020

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

10. september 2015

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

11. september 2015

Først opslået (Anslået)

15. september 2015

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Anslået)

14. oktober 2025

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

9. oktober 2025

Sidst verificeret

1. oktober 2025

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Karcinom, pladecelle

Kliniske forsøg med DNA-ekstraktion

Abonner