Ikke-invasiv screening af føtal trisomi 21 ved digital PCR (dPNI-T21)

I Frankrig, som i mange lande i verden, er trisomi 21 eller Downs syndrom (DS) genstand for en prænatal screening baseret på en risikoberegning (R), herunder analyse af biokemiske markører i moderens blod, og måling af en føtal ultralydsparameter (nukal translucens). I populationen af ​​gravide kvinder, der siges at have høj risiko (R> 1/250), bekræftes diagnosen DS ved invasiv prøveudtagning (trofoblastbiopsi eller fostervandsprøve), som muliggør etablering af føtal karyotype. Ud over begrænset følsomhed (80 til 85 % afhængigt af teknikkerne) er denne screening en angstfaktor (8 % falske positive) og aborter af euploide fostre (normal karyotype) i 1 % af tilfældene (invasive procedurer).

En gravid kvindes plasma indeholder en blanding af frit DNA af maternel (90 %) og føtal oprindelse (cffDNA for cellefrit føtalt DNA) (ca. 10 %, men denne andel stiger i tilfælde af føtal trisomi 21. Andelen af ​​cffDNA er tilstrækkelig til kvalitativt og kvantitativt at studere specifikke genetiske markører for et par kromosomer. Det er derfor muligt at evaluere mængden af ​​markørkromosomer af interesse i forhold til en referencekromosommarkør og at beregne et markør/markørforhold af interesse, teoretisk identisk for alle autosomer (kromosom 1 til 22) under euploid graviditet. I tilfælde af føtal aneuploidi (f.eks. trisomi 21) er dette forhold ubalanceret for det involverede kromosompar.

Fremskridt inden for teknologi, såsom high-throughput massesekventering (MPS) og digital PCR (dPCR), gør det nu muligt at overveje diagnosticering af føtal maternel DS gennem undersøgelse af cffDNA. Adskillige hold har allerede publiceret om dette emne med MPS-teknikken, anvendt direkte på frit DNA fra moderens plasma, eller efter et cffDNA-isoleringstrin. Dette involverer sekventering af DNA-fragmenterne, der er til stede i prøven, og anbringelse af dem tilbage på deres oprindelige kromosom. I tilfælde af trisomi 21 føtal, søger man at påvise et overskud af sekvenser fra kromosom 21. Disse teknikker kræver dyrt udstyr (sequencer, bioinformatisk platform, servere) og en teknisk tid og vigtig analyse (ofte flere dage for en enkelt kørsel). Med hensyn til forskning i aneuploidier ved digital PCR (dPCR), skyldes få publikationer i dag fraværet af tilstrækkeligt kraftige instrumenter indtil for nylig. DPCR er billigere.