Ikke-invasiv screening av føtal trisomi 21 ved digital PCR (dPNI-T21)

I Frankrike, som i mange land i verden, er trisomi 21 eller Downs syndrom (DS) gjenstand for en prenatal screening basert på en risikoberegning (R) inkludert analyse av biokjemiske markører i mors blod, og måling av en føtal ultralydparameter (nukal translucens). I populasjonen av gravide kvinner som sies å ha høy risiko (R> 1/250), bekreftes diagnosen DS ved invasiv prøvetaking (trofoblastbiopsi eller fostervannsprøve), som tillater etablering av fosterkaryotype. I tillegg til begrenset følsomhet (80 til 85 % avhengig av teknikkene), er denne screeningen en angstfaktor (8 % falske positive), og spontanaborter hos euploide fostre (normal karyotype) i 1 % av tilfellene (prosedyrer invasive).

Plasmaet til en gravid kvinne inneholder en blanding av fritt DNA av mors (90 %) og føtal opprinnelse (cffDNA for cellefritt føtalt DNA) (ca. 10 %, men denne andelen øker i tilfeller av føtal trisomi 21. Andelen cffDNA er tilstrekkelig til å kvalitativt og kvantitativt studere spesifikke genetiske markører for et par kromosomer. Det er derfor mulig å evaluere mengden av markørkromosomer av interesse i forhold til en referansekromosommarkør, og å beregne et markør/markørforhold av interesse, teoretisk identisk for alle autosomer (kromosom 1 til 22) under euploid graviditet. Ved føtal aneuploidi (for eksempel trisomi 21), er dette forholdet ubalansert for kromosomparet som er involvert.

Fremskritt innen teknologi, som høykapasitets massesekvensering (MPS) og digital PCR (dPCR), gjør det nå mulig å vurdere diagnosen føtal maternal DS gjennom studiet av cffDNA. Flere team har allerede publisert om dette emnet med MPS-teknikken, brukt direkte på fritt DNA fra mors plasma, eller etter et cffDNA-isoleringstrinn. Dette innebærer å sekvensere DNA-fragmentene som er tilstede i prøven og plassere dem tilbake på det opprinnelige kromosomet. Ved føtal trisomi 21 søker man å påvise et overskudd av sekvenser fra kromosom 21. Disse teknikkene krever dyrt utstyr (sekvenser, bioinformatisk plattform, servere) og en teknisk tid og viktig analyse (ofte flere dager for en enkelt kjøring). Når det gjelder forskning på aneuploider ved digital PCR (dPCR), er det få publikasjoner som i dag skyldes fraværet av tilstrekkelig kraftige instrumenter inntil nylig. DPCR er rimeligere.