A magzati triszómia 21 non-invazív szűrése digitális PCR-rel (dPNI-T21)

Franciaországban, akárcsak a világ számos országában, a 21-es triszómiát vagy a Down-szindrómát (DS) egy kockázatszámításon (R) alapuló születés előtti szűrésnek vetik alá, amely magában foglalja az anyai vérben található biokémiai markerek vizsgálatát és a magzati ultrahang paraméter (nuchális áttetszőség). A magas kockázatnak kitett terhes nők populációjában (R> 1/250) a DS diagnózisának megerősítése invazív mintavétellel (trofoblaszt biopszia vagy amniocentézis) történik, amely lehetővé teszi a magzati kariotípus megállapítását. A korlátozott érzékenység mellett (a technikáktól függően 80-85%) ez a szűrés szorongásos tényező (8% hamis pozitív), és az esetek 1%-ában euploid magzatok vetélése (normál kariotípus) (invazív eljárások).

A terhes nők plazmája anyai (90%) és magzati eredetű szabad DNS (sejtmentes magzati DNS cffDNS) keverékét tartalmazza (kb. 10%, de ez az arány növekszik a 21-es magzati triszómia esetén). A cffDNS aránya elegendő egy kromoszómapár specifikus genetikai markereinek minőségi és kvantitatív vizsgálatához. Ezért lehetséges a kérdéses marker kromoszóma mennyiségének értékelése egy referencia kromoszóma markerhez viszonyítva, és kiszámítható egy érdekes marker/marker arány, amely elméletileg azonos minden autoszómára (1-22 kromoszóma) euploid terhesség alatt. Magzati aneuploidia (például 21-es triszómia) esetén ez az arány az érintett kromoszómapárra nézve kiegyensúlyozatlan.

A technológia fejlődése, mint például a nagy áteresztőképességű tömegszekvenálás (MPS) és a digitális PCR (dPCR), mára lehetővé teszi a magzati anyai DS diagnosztizálását a cffDNS tanulmányozása révén. Több csapat publikált már ebben a témában az MPS technikával, amelyet közvetlenül anyai plazmából szabadított DNS-re alkalmaztak, vagy cffDNS izolálási lépés után. Ez magában foglalja a mintában lévő DNS-fragmensek szekvenálását és visszahelyezését az eredeti kromoszómájukba. A magzati 21-es triszómia esetében a 21-es kromoszómából származó szekvenciák feleslegét próbálják bizonyítani. Ezek a technikák drága berendezéseket (szekvenáló, bioinformatikai platform, szerverek) és technikai időt és fontos elemzést igényelnek (egyetlen futtatáshoz gyakran több nap). Az aneuploidiák digitális PCR-rel (dPCR) történő kutatásával kapcsolatban ma kevés publikáció született, mivel a közelmúltig nem álltak rendelkezésre kellően erős eszközök. A DPCR olcsóbb.