Nye analyser til påvisning af influenzavirus
Evaluering af nye molekylære analyser til påvisning af influenzavirus
Sæsonbestemt influenzavirus forårsager anslået 0,3-0,6 millioner dødsfald om året. Fugleinfluenzavirus H5N1, H7N9 og H5N6 har en dødelighed på over 30 %. Svineinfluenzavirus fra svin har også inficeret mennesker.
Molekylære assays bruges nu rutinemæssigt til påvisning af influenzavirus. M-genet bruges ofte som mål for alle influenza A-vira, fordi nukleotidsekvensen af dette gen er relativt konserveret blandt alle influenza A-vira. Verdenssundhedsorganisationen og de amerikanske centre for sygdomskontrol og -forebyggelse (CDC) har offentliggjort protokoller til molekylær påvisning af influenza A-virus M-gen.
Nylige undersøgelser har imidlertid vist, at mutationer i M-genet har ført til en reduceret følsomhed af RT-PCR-assay rettet mod dette gen. Derfor er det vigtigt at bruge alternative konserverede gener som mål for RT-PCR. I denne undersøgelse er vores mål at evaluere to nye RT-PCR-assays, der er baseret på PB2- og NS-gensegment.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
I. Baggrund
- Sæsonbestemt influenzavirus forårsager anslået 0,3-0,6 millioner dødsfald om året. Fugleinfluenzavirus H5N1, H7N9 og H5N6 har en dødelighed på over 30 %. Svineinfluenzavirus fra svin har også inficeret mennesker.
- Molekylære assays bruges nu rutinemæssigt til påvisning af influenzavirus. M-genet bruges ofte som mål for alle influenza A-vira, fordi nukleotidsekvensen af dette gen er relativt konserveret blandt alle influenza A-vira. Verdenssundhedsorganisationen og de amerikanske centre for sygdomskontrol og -forebyggelse (CDC) har offentliggjort protokoller til molekylær påvisning af influenza A-virus M-gen.
- Nylige undersøgelser har imidlertid vist, at mutationer i M-genet har ført til en reduceret følsomhed af RT-PCR-assay rettet mod dette gen. Derfor er det vigtigt at bruge alternative konserverede gener som mål for RT-PCR. I denne undersøgelse er vores mål at evaluere to nye RT-PCR-assays, der er baseret på PB2- og NS-gensegmentet
II. Studiemål - At evaluere sensitiviteten og specificiteten af 2 nye RT-PCR-assays
III. Overordnet studiedesign
Efterforskerne vil tilfældigt hente arkiverede nasopharyngeal- og spytprøver, der tidligere er blevet testet for influenza A-virus ved hjælp af kommercielt tilgængelige analyser i vores laboratorium, testet for influenza A-virus på Public Health Laboratory Service Branch i Hong Kong. Disse prøver vil blive testet for influenza A-virus med 4 forskellige RT-PCR-assays som angivet nedenfor:
- Vores nye RT-PCR-assay rettet mod PB2-genet
- Vores nye RT-PCR-assay rettet mod NS-gen
- M-gen RT-PCR udgivet af Verdenssundhedsorganisationen
M-gen RT-PCR udgivet af US CDC
Sensitivitet, specificitet, positiv prædiktiv værdi og negativ prædiktiv værdi vil blive bestemt.
IV. Nukleinsyreekstraktion og revers transkription-polymerase-kædereaktion (RT-PCR) i realtid for influenza A-virus
- Spyt og nasopharyngeale prøver vil blive udsat for total nukleinsyre (TNA) ekstraktion med NucliSENS easyMAG (BioMerieux, Boxtel, Holland).
- Monoplex real-time RT-PCR-assays for influenza A-virus vil blive udført. Primerne og proberne for M-genet RT-PCR er blevet offentliggjort af WHO og US CDC.
V. Prøvestørrelse:
- Efterforskerne vil udføre alle 4 RT-PCR-assays på i alt 320 prøver, inkl.
- 80 nasopharyngeale prøver, som testede positive for influenza A ved kommercielt tilgængelige molekylære analyser eller ved test udført på Public Health Laboratory Services Branch i Hong Kong
- 80 nasopharyngeale prøver, som testede negative for influenza A ved kommercielt tilgængelige molekylære analyser eller ved test udført på Public Health Laboratory Services Branch i Hong Kong
- 80 spytprøver, der testede positive for influenza A ved kommercielt tilgængelige molekylære analyser
- 80 spytprøver, der testede negative for influenza A ved kommercielt tilgængelige molekylære analyser
Undersøgelsestype
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
-
Hong Kong, Hong Kong
- Queen Mary Hospital
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Nasopharyngeale eller spytprøver fra patienter på Queen Mary Hospital i Hong Kong
- Testet for influenza A-virus ved hjælp af et kommercielt tilgængeligt assay eller af Public Health Laboratory Services Branch i Hong Kong
Ekskluderingskriterier:
- Utilstrækkelig prøvevolumen
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
NPA positiv
NPA-prøver, der er testet positive for influenza A-virus ved kommercielt tilgængelig assay eller af Public Health Laboratory Services Branch of Hong Kong
|
PB2-gen RT-PCR: RT-PCR rettet mod PB2-genet fra influenza A-virus NS-gen RT-PCR: RT-PCR rettet mod NS-genet fra influenza A-virus
|
|
NPA negativ
NPA-prøver, der er testet negative for influenza A-virus ved kommercielt tilgængelig assay eller af Public Health Laboratory Services Branch of Hong Kong
|
PB2-gen RT-PCR: RT-PCR rettet mod PB2-genet fra influenza A-virus NS-gen RT-PCR: RT-PCR rettet mod NS-genet fra influenza A-virus
|
|
Spyt positiv
Spytprøver, der er testet positive for influenza A-virus ved kommercielt tilgængelig assay eller af Public Health Laboratory Services Branch of Hong Kong
|
PB2-gen RT-PCR: RT-PCR rettet mod PB2-genet fra influenza A-virus NS-gen RT-PCR: RT-PCR rettet mod NS-genet fra influenza A-virus
|
|
Spyt negativ
Spytprøver, der er testet negative for influenza A-virus ved kommercielt tilgængelig assay eller af Public Health Laboratory Services Branch of Hong Kong
|
PB2-gen RT-PCR: RT-PCR rettet mod PB2-genet fra influenza A-virus NS-gen RT-PCR: RT-PCR rettet mod NS-genet fra influenza A-virus
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
RT-PCR resultat
Tidsramme: Gennem studieafslutning i gennemsnit 2 måneder
|
Resultatet af RT-PCR kan være positivt eller negativt
|
Gennem studieafslutning i gennemsnit 2 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Cyklus tærskelværdi
Tidsramme: Gennem studieafslutning i gennemsnit 2 måneder
|
Cyklustærsklen er et surrogat for viral belastning
|
Gennem studieafslutning i gennemsnit 2 måneder
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Kelvin To, MD, The University of Hong Kong
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Forventet)
Primær færdiggørelse (Forventet)
Studieafslutning (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- FluA_20190110
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .