Udvikling af mikrobielle til at bekæmpe udvidet spektrum beta-lactamase (ESBL)-producerende Escherichia coli

rejsende til Sydøstasien

Kunder, der planlægger at rejse til Sydøstasien, vil blive rekrutteret

Andet: undersøgelse af afføringsprøve

Hver deltager giver afføringsprøver før og efter rejsen, efter 2, 4, 6, 8, 10, 12, 16, 20 og 52 uger. Afføringsprøver vil blive brugt til at isolere både a) ESBL E. coli-stammer og b) pan-sensitive E. coli-stammer. En del af afføringsprøven opbevares til isolering af yderligere E. coli-kloner og mikrobiotaanalyse af isolering af andre mikrobiota-stammer. Alle fundne Enterobacteriaceae vil blive screenet for yderligere resistens såsom Carbapenem og Colistin. I tilfælde af en specifik resistens vil dette blive bekræftet med yderligere fænotypiske og genotypiske tests såsom ROSCO disk og polymerase kædereaktion (PCR) baseret panel og hel genom sekventering for at påvise specifikke resistensmekanismer og gener. Bakterier vil blive sekventeret ved hjælp af Illumina og Nanopore baseret sekventering. Bioinformatisk analyse vil gøre det muligt at bestemme hele bakteriegenomet med indeholdende resistensgener og også beskrive mikrobiota-diversiteten over tid hos enkelte individer.

Andet: patient spørgeskema

Hver deltager skal levere et spørgeskema før og efter rejsen, samt efter 2, 4, 6, 8, 10, 12, 16, 20 og 52 uger.

Andet: undersøgelse af blodprøve

Hver deltager skal give en blodprøve før og efter rejsen og efter 6, 12 og 20 uger. En serumprøve (5 ml) til antistofmåling og en 50 ml blodprøve til genvinding af perifere mononukleære blodceller (PBMC'er i 6 CPT'er) til cellemedieret immunitet vil blive indsamlet. Serum og PBMC'er vil tillade analyse af anti-E. coli humorale og cellulære responser for at karakterisere det individuelle immunrespons på specifikke bakterier over tid. Enkeltnukleotidpolymorfismer forbundet med humorale og cellulære immunresponser vil blive karakteriseret og forbundet med immunologiske og kliniske fænotyper og endepunkter i undersøgelsen.

andel af patienter, der "naturligt" afkoloniseres fra ESBL E. coli

andel af patienter, der "naturligt" er afkoloniseret fra ESBL E. coli ved slutningen af ​​undersøgelsesperioden efter 18 måneder