Sviluppo di microbi per combattere l'Escherichia Coli produttore di beta-lattamasi a spettro esteso (ESBL)

viaggiatori nel sud-est asiatico

Verranno reclutati clienti che intendono viaggiare nel sud-est asiatico

Altro: esame del campione di feci

Ogni partecipante fornisce campioni di feci prima e dopo il viaggio, dopo 2, 4, 6, 8, 10, 12, 16, 20 e 52 settimane. I campioni di feci saranno utilizzati per isolare sia a) ceppi di E. coli ESBL sia b) ceppi di E. coli pan-sensibili. Parte del campione di feci viene conservata per l'isolamento di ulteriori cloni di E. coli e l'analisi del microbiota per l'isolamento di altri ceppi di microbiota. Tutte le Enterobacteriaceae trovate saranno sottoposte a screening per ulteriori resistenze come Carbapenem e Colistin. In caso di resistenza specifica, questa sarà confermata con ulteriori test fenotipici e genotipici come il disco ROSCO e il pannello basato sulla reazione a catena della polimerasi (PCR) e il sequenziamento dell'intero genoma al fine di rilevare specifici meccanismi e geni di resistenza. I batteri saranno sequenziati utilizzando il sequenziamento basato su Illumina e Nanopore. L'analisi bioinformatica consentirà di determinare l'intero genoma batterico contenente i geni di resistenza e di descrivere la diversità del microbiota nel tempo nei singoli individui.

Altro: questionario paziente

Ogni partecipante dovrà fornire un questionario prima e dopo il viaggio, nonché dopo 2, 4, 6, 8, 10, 12, 16, 20 e 52 settimane.

Altro: esame del campione di sangue

Ogni partecipante dovrà fornire un campione di sangue prima e dopo il viaggio e dopo 6, 12 e 20 settimane. Verranno raccolti un campione di siero (5 ml) per la misurazione degli anticorpi e un campione di sangue da 50 ml per il recupero delle cellule mononucleate del sangue periferico (PBMC in 6 CPT) per l'immunità cellulo-mediata. Il siero e le PBMC consentiranno l'analisi dell'anti-E. coli risposte umorali e cellulari al fine di caratterizzare la risposta immunitaria individuale a specifici batteri nel tempo. I polimorfismi a singolo nucleotide associati alle risposte immunitarie umorali e cellulari saranno caratterizzati e collegati ai fenotipi immunologici e clinici e agli endpoint dello studio.

percentuale di pazienti decolonizzati "naturalmente" da ESBL E. coli

percentuale di pazienti decolonizzati "naturalmente" da ESBL E. coli alla fine del periodo di studio a 18 mesi