Utvikle mikrobier for å bekjempe utvidet spektrum beta-laktamase (ESBL)-produserende Escherichia coli

reisende til Sørøst-Asia

Kunder som planlegger å reise til Sørøst-Asia vil bli rekruttert

Annen: undersøkelse av avføringsprøve

Hver deltaker gir avføringsprøver før og etter reisen, etter 2, 4, 6, 8, 10, 12, 16, 20 og 52 uker. Avføringsprøver vil bli brukt for å isolere både a) ESBL E. coli-stammer og b) pan-sensitive E. coli-stammer. En del av avføringsprøven lagres for isolering av ytterligere E. coli-kloner og mikrobiotaanalyse av isolering av andre mikrobiotastammer. Alle funnet Enterobacteriaceae vil bli screenet for ytterligere resistens som Carbapenem og Colistin. Ved en spesifikk resistens vil dette bli bekreftet med ytterligere fenotypiske og genotypiske tester som ROSCO disk og polymerase kjedereaksjon (PCR) basert panel og helgenomsekvensering for å oppdage spesifikke resistensmekanismer og gener. Bakterier vil bli sekvensert ved hjelp av Illumina- og Nanopore-basert sekvensering. Bioinformatisk analyse vil tillate å bestemme hele bakteriegenomet med inneholdende resistensgener og også beskrive mikrobiota-mangfoldet over tid hos enkeltindivider.

Annen: pasient spørreskjema

Hver deltaker må levere et spørreskjema før og etter reisen, samt etter 2, 4, 6, 8, 10, 12, 16, 20 og 52 uker.

Annen: undersøkelse av blodprøve

Hver deltaker må gi en blodprøve før og etter reisen og etter 6, 12 og 20 uker. En serumprøve (5 ml) for antistoffmåling og en 50 ml blodprøve for utvinning av perifere mononukleære blodceller (PBMC-er i 6 CPT-er) for cellemediert immunitet vil bli samlet inn. Serum og PBMC vil tillate analyse av anti-E. coli humorale og cellulære responser for å karakterisere den individuelle immunresponsen mot spesifikke bakterier over tid. Enkeltnukleotidpolymorfismer assosiert med humorale og cellulære immunresponser vil bli karakterisert og knyttet til immunologiske og kliniske fenotyper og endepunkter i studien.

andel av pasientene som "naturlig" dekoloniseres fra ESBL E. coli

andel av pasientene som "naturlig" ble dekolonisert fra ESBL E. coli ved slutten av studieperioden ved 18 måneder