mNGS - Vejledt antimikrobiel behandling ved tidlig svær samfundserhvervet lungebetændelse blandt immunkompromitterede patienter (MATESHIP)

Alvorlig samfundserhvervet lungebetændelse (SCAP) er en opstået infektionssygdom i lungeparenkym, som er erhvervet uden for et hospitalsmiljø. SCAP er en førende global smitsom årsag til intensiv afdeling (ICU) indlæggelse (ca. 20%-30%) og den primære årsag til dødelighed og morbiditet hos immunkompromitterede patienter. Der er en global stigning i patienter med distinkte immunkompromitterede tilstande på grund af fremskridt inden for kræftbehandling, stigende biologiske lægemidler og immunsuppressiva til autoimmune sygdomme og voksende organtransplanterede modtagere, og det er blevet anslået, at patienter med immunkompromitterede tilstande tegner sig for cirka 35 % af alle intensiv afdeling (ICU) indlæggelser. Immunkompromitterede patienter, som altid er i risiko for infektion med blandede og usædvanlige patogener, har flere faktorer at komplicere med sepsis, respirationssvigt, akut respiratory distress syndrome, og dødeligheden kan være op til 50%. Ydermere var resultaterne hos immunkompromitterede patienter med SCAP ikke kun relateret til sygdommens sværhedsgrad, men også relateret til forsinket påbegyndelse af modtagelse af passende behandling. 2019American Thoracic Society (ATS)/Infectious Diseases Society of America (IDSA) community-acquired pneumonia (CAP)-retningslinje anbefaler, at administration af passende antimikrobielle stoffer så hurtigt som muligt er den mest effektive foranstaltning til at forbedre den kliniske prognose og reducere dødeligheden for SCAP-patienter. Derfor er rettidig identifikation af patogene mikroorganismer særligt afgørende for antimikrobiel behandling hos immunkompromitterede patienter med SCAP.

Konventionelle mikrobiologiske diagnostiske metoder, såsom standard mikrobiologiske kulturer, mikroskopi, polymerasekædereaktion (PCR), respiratorisk virus multiplex PCR, samt patogenspecifikke antigener og antistofassays, er forbundet med relevante begrænsninger: (1) lang dyrkningscyklus og lav positiv rate; (2) normalt kan kun ét patogen påvises ad gangen; (3) manglende evne til at opdage kræsne eller vanskelige dyrkningsorganismer; (4) patogen antistof-baseret testning kan være upålidelig hos immunkompromitterede patienter, som ikke er i stand til at montere antistofresponser. Konventionelle diagnostiske metoder udgør en stor udfordring for patogener diagnosticering af SCAP blandt immunkompromitterede patienter på grund af ovenstående begrænsninger og de komplicerede forårsagende mikroorganismer. Konventionel antimikrobiel terapi baseret på resultaterne af konventionelle mikrobiologiske diagnostiske teknikker, som kan forsinke rettidig præcis antimikrobiel terapi i det indledende stadium, og dødeligheden af ​​immunkompromitterede patienter med SCAP kan dog stige. Metagenomisk næste generations sekventering (mNGS), som hurtigt (normalt inden for 24 timer) kan detektere en bred vifte af bakterier, vira og svampe på en upartisk måde på samme tid ved at analysere cellefri nukleinsyre (DNA) fragmenter af patogener ved hjælp af passende prøver fra nedre luftveje (LRT), bruges i stigende grad ved alvorlig infektionssygdom, især blandt immunkompromitterede patienter. Denne undersøgelse spekulerer i, at mNGS (ved hjælp af LRT-prøver) kan vejlede tidlig og nøjagtig antimikrobiel behandling af immunkompromitterede patienter med SCAP. Dette multicenter, åbnende, randomiserede, kontrollerede spor vil indskrive SCAP-patienter med immunkompromitterede tilstande for at afgøre, om mNGS-guidet antimikrobiel behandling forbedrer den kliniske prognose og øger den kliniske helbredelsesrate. Formålet med denne undersøgelse er at karakterisere effekten af ​​mNGS-guidet antimikrobiel behandling for SCAP versus konventionel behandling blandt immunkompromitterede patienter. Det postuleres, at mNGS-guidet antimikrobiel behandling til immunkompromitterede patienter med SCAP vil forbedre de kliniske resultater blandt disse patienter.