mNGS - Guidad antimikrobiell behandling vid tidig svår samhällsförvärvad lunginflammation bland immunförsvagade patienter (MATESHIP)

Severe Community-acquired pneumonia (SCAP) är en uppkomst av infektionssjukdom av lungparenkym som förvärvas utanför en sjukhusmiljö. SCAP är en ledande global infektiös orsak till inläggningar på intensivvårdsavdelningar (cirka 20-30 %), och den primära orsaken till dödlighet och sjuklighet hos patienter med nedsatt immunförsvar. Det finns en global ökning av patienter med distinkta immunförsvagade tillstånd på grund av framstegen inom cancerbehandling, ökande biologiska läkemedel och immunsuppressiva medel för autoimmuna sjukdomar och växande organtransplanterade mottagare, och det har uppskattats att patienter med nedsatt immunförsvar står för cirka 35 % av alla intensivvårdsavdelningar (ICU) intagningar. Immunförsvagade patienter, som alltid löper risk för blandade och ovanliga patogener, har fler faktorer att komplicera med sepsis, andningssvikt, akut andnödsyndrom och dödligheten kan vara upp till 50 %. Dessutom var resultaten hos patienter med nedsatt immunförsvar med SCAP inte bara relaterade till sjukdomens svårighetsgrad utan också relaterade till förseningar i början av att få lämplig terapi. 2019American Thoracic Society (ATS)/Infectious Diseases Society of America (IDSA) community-acquired pneumonia (CAP) riktlinjer rekommenderar att administrering av lämpliga antimikrobiella medel så snart som möjligt är den mest effektiva åtgärden för att förbättra klinisk prognos och minska dödligheten för SCAP-patienter. Därför är snabb identifiering av patogena mikroorganismer särskilt avgörande för antimikrobiell behandling hos immunkomprometterade patienter med SCAP.

Konventionella mikrobiologiska diagnostiska metoder, såsom standard mikrobiologiska kulturer, mikroskopi, polymeraskedjereaktion (PCR), respiratorisk virus multiplex PCR, såväl som patogenspecifika antigener och antikroppsanalyser, är förknippade med relevanta begränsningar: (1) lång odlingscykel och låg positiv ränta; (2) vanligtvis kan endast en patogen detekteras åt gången; (3) oförmåga att upptäcka kräsna eller svåra odlingsorganismer; (4) patogenantikroppsbaserad testning kan vara opålitlig hos patienter med nedsatt immunförsvar som inte kan ge antikroppssvar. Konventionella diagnostiska metoder utgör en stor utmaning för patogener att diagnostisera SCAP bland immunförsvagade patienter på grund av ovanstående begränsningar och de komplicerade orsakande mikroorganismerna. Konventionell antimikrobiell terapi baserad på resultaten av konventionella mikrobiologiska diagnostiska tekniker, vilket kan fördröja korrekt antimikrobiell behandling i rätt tid i det inledande skedet, och dödligheten hos patienter med nedsatt immunförsvar med SCAP kan öka. Metagenomisk nästa generations sekvensering (mNGS), som snabbt (vanligtvis inom 24 timmar) kan upptäcka ett brett spektrum av bakterier, virus och svampar på ett opartiskt sätt samtidigt genom att analysera cellfria nukleinsyrafragment (DNA) av patogener med hjälp av lämpliga prover från de nedre luftvägarna (LRT), används i allt större utsträckning vid svåra infektionssjukdomar, särskilt bland immunförsvagade patienter. Denna studie spekulerar i att mNGS (med hjälp av LRT-prov) kan vägleda tidig och korrekt antimikrobiell behandling för immunförsvagade patienter med SCAP. Detta multicenter, öppnande, randomiserade, kontrollerade spår kommer att registrera SCAP-patienter med immunförsvagade tillstånd för att avgöra om mNGS-vägledd antimikrobiell behandling förbättrar den kliniska prognosen och ökar den kliniska botningshastigheten. Syftet med denna studie är att karakterisera effekten av mNGS-vägledd antimikrobiell behandling för SCAP kontra konventionell behandling bland immunsupprimerade patienter. Det postuleras att mNGS-vägledd antimikrobiell behandling för immunsupprimerade patienter med SCAP kommer att förbättra kliniska resultat bland dessa patienter.