mNGS - Veiledet antimikrobiell behandling ved tidlig alvorlig samfunnservervet lungebetennelse blant immunkompromitterte pasienter (MATESHIP)

Alvorlig fellesskapservervet lungebetennelse (SCAP) er en infeksjonssykdom av lungeparenkym som oppstår utenfor sykehus. SCAP er en ledende global smittsom årsak til intensivavdeling (ICU) innleggelse (omtrent 20%-30%), og den primære årsaken til dødelighet og sykelighet hos immunkompromitterte pasienter. Det er en global økning av pasienter med distinkte immunkompromitterte tilstander på grunn av fremskritt innen kreftbehandling, økende biologiske medisiner og immunsuppressiva for autoimmune sykdommer og voksende organtransplanterte mottakere, og det har blitt anslått at pasienter med immunkompromitterte tilstander utgjør omtrent 35 % av alle. innleggelser på intensivavdelinger (ICU). Immunkompromitterte pasienter, som alltid er i fare for infeksjon med blandede og uvanlige patogener, har flere faktorer å komplisere med sepsis, respirasjonssvikt, akutt respiratorisk distress-syndrom, og dødeligheten kan være opptil 50 %. Dessuten var utfallene hos immunkompromitterte pasienter med SCAP ikke bare relatert til alvorlighetsgraden av sykdommen, men også relatert til forsinkelser i starten av å motta passende terapi. 2019American Thoracic Society (ATS)/Infectious Diseases Society of America (IDSA) community-acquired pneumonia (CAP) retningslinjer anbefaler at administrering av passende antimikrobielle midler så snart som mulig er det mest effektive tiltaket for å forbedre klinisk prognose og redusere dødeligheten for SCAP-pasienter. Derfor er rettidig identifisering av patogene mikroorganismer spesielt avgjørende for antimikrobiell behandling hos immunkompromitterte pasienter med SCAP.

Konvensjonelle mikrobiologiske diagnostiske metoder, som standard mikrobiologiske kulturer, mikroskopi, polymerasekjedereaksjon (PCR), respiratorisk virus multipleks PCR, samt patogenspesifikke antigener og antistoffanalyser, er assosiert med relevante begrensninger: (1) lang kultursyklus og lav positiv rate; (2) vanligvis bare ett patogen kan påvises om gangen; (3) manglende evne til å oppdage kresne eller vanskelige kulturorganismer; (4) patogenantistoffbasert testing kan være upålitelig hos immunkompromitterte pasienter som ikke er i stand til å montere antistoffresponser. Konvensjonelle diagnostiske metoder utgjør en stor utfordring for patogenes diagnose av SCAP blant immunkompromitterte pasienter på grunn av ovennevnte begrensninger og de kompliserte kausative mikroorganismene. Imidlertid kan konvensjonell antimikrobiell terapi basert på resultatene av konvensjonelle mikrobiologiske diagnostiske teknikker, som kan forsinke tidsriktig nøyaktig antimikrobiell terapi i det innledende stadiet, og dødeligheten av immunkompromitterte pasienter med SCAP kan øke. Metagenomisk neste generasjons sekvensering (mNGS), som raskt (vanligvis innen 24 timer) kan oppdage et bredt spekter av bakterier, virus og sopp på en objektiv måte på samme tid ved å analysere cellefrie nukleinsyre (DNA) fragmenter av patogener ved å bruke passende prøver fra nedre luftveier (LRT), brukes i økende grad ved alvorlig infeksjonssykdom, spesielt blant immunkompromitterte pasienter. Denne studien spekulerer i at mNGS (ved bruk av LRT-prøver) kan veilede tidlig og nøyaktig antimikrobiell behandling for immunkompromitterte pasienter med SCAP. Dette multisenter, åpne, randomiserte, kontrollerte sporet vil registrere SCAP-pasienter med immunkompromitterte tilstander for å avgjøre om mNGS-veiledet antimikrobiell behandling forbedrer den kliniske prognosen og øker den kliniske helbredelsesraten. Hensikten med denne studien er å karakterisere effekten av mNGS-veiledet antimikrobiell behandling for SCAP versus konvensjonell behandling blant immunkompromitterte pasienter. Det er postulert at mNGS-veiledet antimikrobiell behandling for immunkompromitterte pasienter med SCAP vil forbedre kliniske resultater blant disse pasientene.