Trattamento antimicrobico guidato da mNGS nella polmonite acquisita in comunità grave precoce tra i pazienti immunocompromessi (MATESHIP)

La polmonite acquisita in comunità grave (SCAP) è una malattia infettiva emergente del parenchima polmonare acquisita al di fuori di un ambiente ospedaliero. SCAP è una delle principali cause infettive globali di ricovero in unità di terapia intensiva (ICU) (circa il 20% -30%) e la ragione principale di mortalità e morbilità nei pazienti immunocompromessi. Vi è un aumento globale di pazienti con condizioni immunocompromesse distinte a causa del progresso del trattamento del cancro, dell'aumento dei farmaci biologici e degli immunosoppressori per le malattie autoimmuni e dei riceventi di trapianto di organi in crescita, ed è stato stimato che i pazienti con condizioni immunocompromesse rappresentano circa il 35% di tutti ricoveri in unità di terapia intensiva (ICU). I pazienti immunocompromessi, che sono sempre a rischio di infezione da agenti patogeni misti e insoliti, hanno più fattori da complicare con sepsi, insufficienza respiratoria, sindrome da distress respiratorio acuto e il tasso di mortalità può arrivare fino al 50%. Inoltre, gli esiti nei pazienti immunocompromessi con SCAP non solo erano correlati alla gravità della malattia, ma anche ai ritardi nell'inizio della ricezione di una terapia appropriata. 2019 Le linee guida per la polmonite acquisita in comunità (CAP) dell'American Thoracic Society (ATS)/Infectious Diseases Society of America (IDSA) raccomandano che la somministrazione di antimicrobici appropriati il ​​prima possibile sia la misura più efficace per migliorare la prognosi clinica e ridurre il tasso di mortalità per i pazienti con SCAP. Pertanto, l'identificazione tempestiva dei microrganismi patogeni è particolarmente cruciale per il trattamento antimicrobico nei pazienti immunocompromessi con SCAP.

I metodi diagnostici microbiologici convenzionali, come le colture microbiologiche standard, la microscopia, la reazione a catena della polimerasi (PCR), la PCR multiplex del virus respiratorio, nonché gli antigeni specifici del patogeno e i test anticorpali, sono associati a limitazioni rilevanti: (1) ciclo di coltura lungo e basso tasso positivo; (2) di solito è possibile rilevare un solo agente patogeno alla volta; (3) incapacità di rilevare organismi di coltura esigenti o difficili; (4) i test basati sugli anticorpi patogeni possono essere inaffidabili nei pazienti immunocompromessi che non sono in grado di attivare le risposte anticorpali. I metodi diagnostici convenzionali rappresentano una grande sfida per la diagnosi dei patogeni di SCAP tra i pazienti immunocompromessi a causa delle limitazioni di cui sopra e dei complicati microrganismi causativi. Tuttavia, la terapia antimicrobica convenzionale basata sui risultati delle tecniche diagnostiche microbiologiche convenzionali, che può ritardare una terapia antimicrobica tempestiva e accurata nella fase iniziale, e la mortalità dei pazienti immunocompromessi con SCAP può essere aumentata. Sequenziamento metagenomico di nuova generazione (mNGS), che può rilevare rapidamente (di solito entro 24 ore) un'ampia gamma di batteri, virus e funghi in modo imparziale allo stesso tempo analizzando frammenti di acido nucleico (DNA) di agenti patogeni utilizzando appropriati campione del tratto respiratorio inferiore (LRT), è sempre più utilizzato nelle malattie infettive gravi, specialmente tra i pazienti immunocompromessi. Questo studio ipotizza che mNGS (utilizzando il campione LRT) possa guidare un trattamento antimicrobico precoce e accurato per i pazienti immunocompromessi con SCAP. Questo percorso multicentrico, di apertura, randomizzato e controllato arruolerà pazienti SCAP con condizioni immunocompromesse per determinare se il trattamento antimicrobico guidato da mNGS migliora la prognosi clinica e aumenta il tasso di guarigione clinica. Lo scopo di questo studio è caratterizzare l'effetto del trattamento antimicrobico guidato da mNGS per SCAP rispetto al trattamento convenzionale tra i pazienti immunocompromessi. Si ipotizza che il trattamento antimicrobico guidato da mNGS per i pazienti immunocompromessi con SCAP migliorerà gli esiti clinici tra questi pazienti.