Indfangning af sunde tarmbakterier forbundet med fiberrig kost (iTARGET)

Siden to årtier er adskillige undersøgelser blevet udført for bedre at forstå tarmmikrobiotaens rolle i sundhed og sygdom. En ubalance i tarmmikrobiotaen, kendt som dysbiose, beskrives ofte som en årsag til mange kroniske sygdomme og metaboliske dysfunktioner hos mennesker. Blandt de faktorer, der spiller en vigtig rolle for at opretholde denne balance, spiller kosten en fremherskende rolle. Mere specifikt er forbruget af frugt, grøntsager og korn forbundet med et godt helbred og i særdeleshed med en stigning i den relative overflod af bakteriegrupper, der beskrives som gavnlige. Modulering af tarmmikrobiotaen via eller direkte ved at tilvejebringe disse gavnlige bakterier (næste generation af probiotika NGP'er) er derfor en mulig lovende tilgang til forebyggelse og/eller behandling af patologier. Til dato er et stort antal bakteriearter i tarmmikrobiotaen endnu ikke blevet isoleret og dyrket, hvilket begrænser karakteriseringen af ​​deres potentielle sundhedsmæssige fordele. At have stammer, der kan isoleres og dyrkes, er et væsentligt trin i fænotypebestemmelse og karakterisering. For at isolere og dyrke disse tarmbakterier er det særligt vigtigt at rekruttere personer med en fiberrig kost. I denne sammenhæng er en positiv udvælgelse af donorer, baseret på deres kostprofiler stærkt beriget med fibre, afgørende. I denne undersøgelse sigter vi mod at identificere hidtil usete potentielt nye gavnlige tarmbakterier i silico og isolere, dyrke og karakterisere disse bakteriearter for deres potentiale. Vi vil tage en innovativ tilgang ved at bruge culturomics-værktøjer styret af metagenomics til at isolere dem. For at gøre dette vil vi indsamle fækale prøver fra 10 sunde frivillige med et regelmæssigt og diversificeret indtag af frugt, grøntsager og korn, som fremmer væksten af ​​gavnlige mikroorganismer og øger rigdommen af ​​tarmmikrobiotaen.