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Capture de bactéries intestinales saines associée à un régime riche en fibres (iTARGET)

25 juin 2026 mis à jour par: Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement

Ciblage in silico et in vitro de bactéries intestinales saines présentant un potentiel métabolique de dégradation des fibres

Le rôle du microbiote intestinal sur la santé est désormais bien reconnu, et l’alimentation est l’un des facteurs influençant le maintien d’un microbiote intestinal sain. Plus précisément, la consommation de fruits, légumes et céréales est associée à une bonne santé et notamment à une augmentation de l’abondance relative des groupes bactériens qualifiés de bénéfiques. À ce jour, un grand nombre d’espèces bactériennes du microbiote intestinal doivent encore être isolées et cultivées, ce qui limite la caractérisation de leurs bénéfices potentiels pour la santé. Afin d’isoler et de cultiver ces bactéries intestinales, il est particulièrement pertinent de recruter des individus ayant une alimentation riche en fibres.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Description détaillée

Depuis deux décennies, de nombreuses études ont été réalisées pour mieux comprendre le rôle du microbiote intestinal dans la santé et la maladie. Un déséquilibre du microbiote intestinal, appelé dysbiose, est fréquemment décrit comme à l’origine de nombreuses maladies chroniques et dysfonctionnements métaboliques chez l’homme. Parmi les facteurs qui jouent un rôle important dans le maintien de cet équilibre, l’alimentation joue un rôle prédominant. Plus précisément, la consommation de fruits, légumes et céréales est associée à une bonne santé et notamment à une augmentation de l’abondance relative des groupes bactériens qualifiés de bénéfiques. Moduler le microbiote intestinal via ou directement en apportant ces bactéries bénéfiques (probiotiques nouvelle génération NGP) est donc une possible approche prometteuse pour la prévention et/ou le traitement de pathologies. À ce jour, un grand nombre d’espèces bactériennes du microbiote intestinal doivent encore être isolées et cultivées, ce qui limite la caractérisation de leurs bénéfices potentiels pour la santé. Disposer de souches pouvant être isolées et cultivées est une étape essentielle du phénotypage et de la caractérisation. Afin d’isoler et de cultiver ces bactéries intestinales, il est particulièrement important de recruter des individus ayant une alimentation riche en fibres. Dans ce contexte, une sélection positive des donneurs, basée sur leurs profils alimentaires hautement enrichis en fibres, est essentielle. Dans cette étude, nous visons à identifier in silico de nouvelles bactéries intestinales bénéfiques potentiellement sans précédent, et à isoler, cultiver et caractériser ces espèces bactériennes pour leur potentiel. Nous adopterons une approche innovante, en utilisant des outils de culturomique guidés par la métagénomique pour les isoler. Pour ce faire, nous collecterons les échantillons fécaux de 10 volontaires sains ayant un apport régulier et diversifié de fruits, légumes et céréales, qui favorisent la croissance de micro-organismes bénéfiques et augmentent la richesse du microbiote intestinal.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

10

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Sauvegarde des contacts de l'étude

Lieux d'étude

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Adulte

Accepte les volontaires sains

Oui

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Population générale résidant à Clermont-Ferrand (France)

La description

Critère d'intégration:

  • Sujets adultes sains ;
  • Âge entre 20 et 50 ans (limites incluses) ;
  • IMC entre 18,5 et 25 kg/m2 (hors limites) ;
  • Consommation de plus de 5 portions de fruits et légumes par jour ;
  • Apport d'au moins 25 g de fibres alimentaires par jour ;
  • Une alimentation variée avec peu d’aliments transformés.

Critère d'exclusion:

  • Antibiotiques et/ou modulateurs du transit pris dans les 3 mois précédant le prélèvement ;
  • Pathologies connues ;
  • Traitement actuel ;
  • Antécédents de chirurgie digestive ayant un impact sur le microbiote, jugés incompatibles avec l'étude (chirurgie bariatrique) ;
  • Consommation de compléments alimentaires à base de préparations protéiques, probiotiques ou prébiotiques ;
  • Fumer (même occasionnellement) ;
  • Consommation d'alcool > 2 verres (soit 20 g) par jour ;
  • Activité sportive intense ;
  • Femmes enceintes ou allaitantes ;
  • Les personnes sous protection légale (curatelle, curatelle, etc.) ;
  • Volontaires participant à une autre étude d'intervention ;
  • Les personnes refusant de s'inscrire au Fichier National des Volontaires Sains du Ministère de la Santé ;
  • Sujet non affilié au système de sécurité sociale ;
  • Sujet en période d'exclusion d'une étude antérieure ou ayant perçu un montant total d'indemnisation supérieur à 6000 euros sur les 12 mois consécutifs précédant le début de l'essai (après vérification au Fichier des Volontaires pour la Recherche Biomédicale).

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Isolement et culture d'un isolat de chaque espèce cible
Délai: Jusqu'à 3 ans
Isolement et culture réussis d'au moins un isolat de chaque espèce cible préalablement identifiée par des analyses de données métagénomiques.
Jusqu'à 3 ans

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
profils métagénomiques en relation avec les profils alimentaires
Délai: Jusqu'à 3 ans
Pour obtenir des profils métagénomiques par séquençage shotgun du microbiote intestinal (espèces bactériennes), en relation avec les profils alimentaires
Jusqu'à 3 ans
capacité de croissance des isolats
Délai: Jusqu'à 3 ans
Pour caractériser la croissance (surveillance de la croissance par densité optique) des isolats d'intérêt.
Jusqu'à 3 ans
Potentiel fonctionnel des isolats
Délai: jusqu'à 3 ans.
Caractériser les caractéristiques génomiques des isolats d'intérêt (potentiel fonctionnel par annotation du génome).
jusqu'à 3 ans.
Caractérisation phénotypique des isolats
Délai: Jusqu'à 3 ans
Caractériser phénotypiquement les isolats d'intérêt par galerie API.
Jusqu'à 3 ans

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement

Collaborateurs

Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne

Les enquêteurs

  • Directeur d'études: Victoria MESLIER, PhD, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement
  • Directeur d'études: Claire CHERBUY, PhD, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

24 octobre 2023

Achèvement primaire (Réel)

31 décembre 2025

Achèvement de l'étude (Estimé)

31 décembre 2026

Dates d'inscription aux études

Première soumission

4 décembre 2023

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

4 décembre 2023

Première publication (Réel)

12 décembre 2023

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

29 juin 2026

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

25 juin 2026

Dernière vérification

1 septembre 2025

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Autres numéros d'identification d'étude

  • 2023-A01677-38

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

NON

Description du régime IPD

Aucun partage prévu

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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