Zachycení zdravých střevních bakterií spojených s dietou s vysokým obsahem vlákniny (iTARGET)

Od dvou desetiletí byly provedeny četné studie s cílem lépe pochopit roli střevní mikroflóry ve zdraví a nemoci. Nerovnováha střevní mikroflóry, známá jako dysbióza, je často popisována jako příčina mnoha chronických onemocnění a metabolických dysfunkcí u lidí. Mezi faktory, které hrají důležitou roli při udržování této rovnováhy, hraje převládající roli strava. Konkrétněji je konzumace ovoce, zeleniny a obilovin spojena s dobrým zdravím a zejména se zvýšením relativního množství bakteriálních skupin, které jsou popisovány jako prospěšné. Modulace střevní mikroflóry prostřednictvím nebo přímo poskytnutím těchto prospěšných bakterií (probiotika nové generace NGP) je proto možným slibným přístupem pro prevenci a/nebo léčbu patologií. K dnešnímu dni musí být velké množství bakteriálních druhů ve střevní mikrobiotě ještě izolováno a kultivováno, což omezuje charakterizaci jejich potenciálních zdravotních přínosů. Mít kmeny, které lze izolovat a kultivovat, je základním krokem ve fenotypizaci a charakterizaci. Aby bylo možné izolovat a kultivovat tyto střevní bakterie, je zvláště důležité přijímat jedince s dietou s vysokým obsahem vlákniny. V této souvislosti je zásadní pozitivní výběr dárců na základě jejich dietních profilů vysoce obohacených o vlákninu. V této studii se snažíme identifikovat in silico bezprecedentní potenciálně nové prospěšné střevní bakterie a izolovat, kultivovat a charakterizovat tyto bakteriální druhy pro jejich potenciál. Zaujmeme inovativní přístup, k jejich izolaci použijeme nástroje kulturomiky vedené metagenomikou. K tomu odebereme vzorky výkalů 10 zdravých dobrovolníků s pravidelným a diverzifikovaným příjmem ovoce, zeleniny a obilovin, které podporují růst prospěšných mikroorganismů a zvyšují bohatost střevní mikroflóry.