Diese Seite wurde automatisch übersetzt und die Genauigkeit der Übersetzung wird nicht garantiert. Bitte wende dich an die englische Version für einen Quelltext.

Integratives persönliches Omics-Profiling zur Überwachung dynamischer molekularer Phänotypen während der Faserergänzung

9. Januar 2021 aktualisiert von: Michael Snyder, Stanford University

Die Forscher schlagen eine umfassende, multiomische Studie vor, die Längsschnittdaten integrieren wird, die Veränderungen bei bestimmten Darmbakterien und Wirten als Reaktion auf eine präbiotische Ballaststoffergänzung assoziieren. Diese Daten werden die Entwicklung einer integrativen biologischen Signatur leiten, die von Bakterien stammende Metaboliten mit dem biologischen Ergebnis im Wirt in Beziehung setzt.

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Bedingungen

Präbiotika

Intervention / Behandlung

Nahrungsergänzungsmittel: Nahrungsergänzung mit Ballaststoffen

Detaillierte Beschreibung

Mit dieser Studie schlagen die Forscher vor, eine Kohorte gesunder Personen zusammenzustellen, die im Rahmen einer umfassenden, longitudinalen Charakterisierung der Mikrobiota und Wirtsveränderungen mit klinischen Markern und mehreren Omics-Assays eine präbiotische Ergänzung erhalten. Diese multiomischen Daten werden dann integriert und erzeugen einzigartige biologische Signaturen, die die Rolle definieren, die mikrobielle Metaboliten bestimmter Bakterien bei der biologischen Aktivität des Wirts spielen. Durch diese Studie erwarten die Forscher ein detailliertes und klares Verständnis der physiologischen Veränderungen auf mechanistischer Ebene, die im Mikrobiom und im Wirt als Reaktion auf eine Nahrungsergänzung mit präbiotischen Ballaststoffen auftreten.

Studientyp

Interventionell

Einschreibung (Tatsächlich)

Phase

Unzutreffend

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

Vereinigte Staaten
- California
  - Stanford, California, Vereinigte Staaten, 94304
    - Stanford University

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre bis 65 Jahre (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Beschreibung

Einschlusskriterien:

Guter allgemeiner Gesundheitszustand

Ausschlusskriterien:

Nüchternblutzucker >126 mg/dl
Triglyceride >400 mg/dL
Unkontrollierter Bluthochdruck
Gefässkrankheit
Chronisch entzündliche Erkrankungen
Schwere Organerkrankung
Starker Alkoholkonsum
Schwangerschaft/Stillzeit
Vorherige bariatrische Operation
Aktive psychiatrische Erkrankung
Verwendung von Medikamenten, von denen bekannt ist, dass sie den Kohlenhydrat- oder Fettstoffwechsel beeinflussen
Aktive Essstörung

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Hauptzweck: Grundlegende Wissenschaft
Zuteilung: N / A
Interventionsmodell: Sequenzielle Zuweisung
Maskierung: Single

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme	Maßnahmenbeschreibung	Zeitfenster
Kartierung von Veränderungen der Mikrobiota als Reaktion auf präbiotische Eingriffe Zeitfenster: 3 Jahre	Eine detaillierte Karte von Mikroben und Änderungen der mikrobiellen Genexpression während des Eingriffs wird entwickelt. Die Mikrobiota-Komplexität in Stuhlproben wird durch metagenomische Sequenzierung mit Schrotflinte bestimmt. Neuartige Mikroben und Genwege werden durch De-novo-Assemblierung ganzer fäkaler Metagenome identifiziert.	3 Jahre
Veränderungen des Lipidprofils als Reaktion auf eine präbiotische Intervention Zeitfenster: 3 Jahre	Analyse von Veränderungen im Lipidprofil der Teilnehmer der präbiotischen Intervention. Zu den gemessenen Lipiden in mg/dl gehören Gesamtcholesterin, LDL-Cholesterin, HDL-Cholesterin und Triglyceride.	3 Jahre

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme	Maßnahmenbeschreibung	Zeitfenster
Umfassendes Metagenomprofil während einer präbiotischen Intervention Zeitfenster: 3 Jahre	Änderungen im Metagenomprofil des Wirts (Mensch) während des präbiotischen Eingriffs werden bestimmt. Stuhl-DNA-Sequenzen werden mithilfe der Humann2- und Metaphlan-Pipelines analysiert, um Werte für die Signalwegabdeckung, die Häufigkeit von Genfamilien und die Häufigkeit von Taxa zu ermitteln {Franzosa, 2018}. Diese werden zur Ausrichtung auf die Datenbank des Human Microbiome Project abgebildet.	3 Jahre
Umfassendes Transkriptomprofil während einer präbiotischen Intervention Zeitfenster: 3 Jahre	Änderungen im Transkriptomprofil des Wirts (Mensch) während des präbiotischen Eingriffs werden bestimmt. Aus PBMC-Proben isolierte RNA-Lesevorgänge werden mithilfe des Programms „Spliced Transcripts Alignment to a Reference“ (STAR) an hg38 ausgerichtet. Die Transkripthäufigkeit wird mithilfe von RNA-Seq by Expectation Maximization (RSEM) berechnet. Die Normalisierung der Transkripthäufigkeit und paarweise Statistiken zur Messung der Unterschiede in der Transkripthäufigkeit zwischen Zeitpunkten werden mit dem Softwarepaket für R von Bioconductor (DESeq2) berechnet.	3 Jahre
Umfassendes Metabolomprofil während einer präbiotischen Intervention Zeitfenster: 3 Jahre	Änderungen im Metabolomprofil des Wirts (Mensch) während der präbiotischen Intervention werden bestimmt. Plasmametaboliten werden in Massenspektrometersäulen analysiert (HILIC- und RPLC-Trennung sowohl im positiven als auch im negativen Ionisationsmodus). MetID und unsere MS/MS-Daten werden verwendet, um 12740 Metaboliten mit Konfidenzniveaus von 1 bis 3 zu identifizieren, wobei 1 MS/MS, Retentionszeit und m/z von Standards auf unserer Plattform entspricht, 2 MS/MS und m/z aufweist stimmt mit einer Datenbank überein und 3 stimmt mit dem m/z einer Datenbank überein.	3 Jahre
Umfassendes Zytokinprofil während einer präbiotischen Intervention Zeitfenster: 3 Jahre	Änderungen im Zytokinprofil des Wirts (Mensch) während des präbiotischen Eingriffs werden bestimmt. Zytokine werden mithilfe eines Luminex xMAP-Zytokin-Profiling-Systems im Stanford Human Immune Monitoring Center profiliert. Dabei werden für Zytokine spezifische Antikörper mithilfe eines Fängermoleküls an Perlen gebunden. Die fluoreszierenden Moleküle werden an die Zytokine gebunden und die Fluoreszenz wird als Maß für die Zytokinhäufigkeit verwendet.	3 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Stanford University

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

15. Oktober 2014

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

11. August 2017

Studienabschluss (Tatsächlich)

11. August 2017

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

3. Dezember 2020

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

9. Januar 2021

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

13. Januar 2021

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)