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Epidemiologie des Tensid-Protein-B-Mangels

24. November 2023 aktualisiert von: F. Sessions Cole, MD, Washington University School of Medicine
Der Zweck dieser Studie ist es, die Hypothese zu testen, dass überschüssige, seltene, funktionell störende Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs) Gene (z. B. das Surfactant-Protein-B-Gen) (SFTPB) und Gennetzwerke (z andere Gennetzwerke, die die alveoläre Typ-2-Zellfunktion regulieren), die mit einem erhöhten Risiko für das neonatale Atemnotsyndrom (RDS) verbunden sind.

Studienübersicht

Detaillierte Beschreibung

HINTERGRUND:

Das Atemnotsyndrom ist die häufigste respiratorische Ursache für Tod und Morbidität bei Säuglingen unter 1 Jahr in den Vereinigten Staaten. Von ungefähr 28.500 Todesfällen bei Säuglingen im Jahr 2006 wurde bei 5.421 (19,7 %) Atemnot als primäre (1.011 – 3,7 %) oder sekundäre (4.410 – 16 %) Todesursache diagnostiziert. Trotz der Verbesserung der Säuglingssterblichkeitsrate in den letzten 20 Jahren verbrauchen Überlebende des Atemnotsyndroms mit chronischer Atemwegserkrankung zwanzigmal mehr Dollar pro Jahr als nicht betroffene Kinder und 5,9 % aller Dollar, die für Kinder im Alter von 0 bis 18 Jahren ausgegeben werden. Neuere Schätzungen, einschließlich Daten aus Kalifornien und New York, dem Institute of Medicine und der Nationwide Inpatient Sample 2001 des Healthcare Cost and Utilization Project, legen nahe, dass die durchschnittlichen Krankenhauskosten für jedes der 49.900 Säuglinge mit der Diagnose Atemnotsyndrom lagen 56.800 $ gegenüber 10.700 $ für ein Frühgeborenes ohne Atemnotsyndrom. Die jüngste Zunahme von späten Frühgeburten hat sowohl zur Häufigkeit des Atemnotsyndroms als auch zu seinen wirtschaftlichen Auswirkungen beigetragen. Diese medizinischen Kosten beinhalten nicht die wirtschaftlichen Folgen der respiratorischen Morbidität von Säuglingen für Familien, z. Darüber hinaus haben europäisch-amerikanische Säuglinge ein höheres Risiko, an Atemnot zu sterben als afroamerikanische Säuglinge, obwohl das Risiko einer Säuglingssterblichkeit für afroamerikanische Säuglinge aus allen anderen Gründen zwei- bis dreimal höher ist als für europäisch-amerikanische Säuglinge, und dieses erhöhte Risiko ist nicht darauf zurückzuführen Unterschiede in der Surfactant-Phospholipid-Zusammensetzung, dem Geburtsgewicht, dem Gestationsalter oder verwirrenden sozioökonomischen Faktoren. Das Verständnis der genetischen Mechanismen, die das Atemnotsyndrom verursachen, ist entscheidend, um die Ergebnisse von Kindern in den Vereinigten Staaten zu verbessern, die Kosten ihrer Gesundheitsversorgung zu senken und die Rassenunterschiede bei der Kindersterblichkeit zu verringern. Seit der ursprünglichen Beschreibung des Lungensurfactant-Mangels bei Frühgeborenen durch Avery und Mead im Jahr 1959 wurde das Atemnotsyndrom am häufigsten einer entwicklungsbedingten Unreife der Lungensurfactant-Produktion zugeschrieben. Trotz der Verbesserung der Überlebensrate von Neugeborenen im Zusammenhang mit der Verfügbarkeit einer Surfactant-Ersatztherapie für Frühgeborene bestehen weiterhin geschlechts- und rassenbedingte Unterschiede in der Krankheitshäufigkeit, Morbidität und Mortalität, eine Beobachtung, die darauf hindeutet, dass genetische Faktoren eine wichtige Rolle bei der Krankheitsentstehung spielen. Darüber hinaus weisen Zwillingsstudien auf eine hohe Heritabilität (h2) des neonatalen Atemnotsyndroms (0,2 und 0,8) hin. Jüngste klinische Berichte über monogene Ursachen des Atemnotsyndroms bei Neugeborenen, statistische Assoziationen von Kandidatengenvarianten mit erhöhtem Krankheitsrisiko und Studien zur gezielten Genablation bei Mauslinien haben ebenfalls stark darauf hingewiesen, dass genetische Mechanismen zum Risiko eines Atemnotsyndroms bei Neugeborenen beitragen. Als wir genetische Varianten in großen Populations-basierten und Fall-Kontroll-Kohorten untersuchten, stellten wir fest, dass die populationsbasierten Häufigkeiten einzelner störender Mutationen in 3 Kandidatengenen (SFTPB, SFTPC und ABCA3) (< 2 %) < 0,1 ausmachen % der Bevölkerung zuschreibbares Risiko bei termingerechten oder kurz vor der Geburt stehenden Säuglingen und dass einzelne, seltene, störende Mutationen in Fall-Kontroll-Kohorten nicht mit einer Erkrankung assoziiert sind. Als wir außerdem versuchten, einen Zusammenhang zwischen einem intermediären biochemischen Phänotyp (Tensid-B-Peptid-Mobilität im Western Blot) und SFTPB-Varianten (bewertet durch vollständige Resequenzierung) bei termingerechten und termingerechten Säuglingen mit und ohne Atemnot herzustellen, gelang uns dies nicht Identifizieren einer SFTPB-Variante oder einer Kombination von Varianten, die mit Atemnot und veränderter Surfactant-Protein-B-Struktur assoziiert sind. Schließlich haben wir kürzlich herausgefunden, dass tagSNPs in Genen aus Gennetzwerken, die in der Lunge exprimiert werden, aber nicht Teil des pulmonalen Surfactant-Netzwerks sind (Ionenkanal, Lungenumbau und entfaltete Proteinantwortgene), ein rassenspezifisches Risiko für das neonatale Atemnotsyndrom verleihen. Diese Studien deuten darauf hin, dass die Variation in SFTPB, SFTPC und ABCA3 unter erheblichem Reinigungsselektionsdruck steht und dass der genetische Beitrag zum neonatalen Atemnotsyndrom auf Beiträgen seltener, unabhängiger Risikoallele in mehreren Genen und Gennetzwerken basiert.

DESIGN-NARRATIVE:

Seltene Mutationen im Surfactant-Protein-B-Gen (SFTPB) und anderen Genen im metabolischen Netzwerk des pulmonalen Surfactant verursachen bei menschlichen Neugeborenen ein letales neonatales Atemnotsyndrom, indem sie den Stoffwechsel und die Funktion des pulmonalen Surfactants stören. Mutationshäufigkeiten (<1-2%) in SFTPB und 2 anderen Kandidatengenen im Lungensurfactant-Netzwerk (SFTPC und ABCA3) berücksichtigen nicht die Vererbbarkeit des Atemnotsyndroms bei Neugeborenen (h2~0,2-0,8) vorgeschlagen durch Zwillingsstudien. Um einen umfassenden Katalog von Genen und Gennetzwerken zu entwickeln, die für die Erblichkeit dieser komplexen Krankheit verantwortlich sind, schlagen wir vor, die Hypothese zu testen, dass übermäßige, seltene, funktionell störende Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs) Gene und Gennetzwerke charakterisieren, die mit einem erhöhten Risiko für Neugeborene verbunden sind Atemnotsyndrom. Insbesondere unter Verwendung der Trio-Gesamtexom- oder Gesamtgenomsequenzierung des betroffenen Säuglings (progressive, schwere Atemnot bei termingerechten oder kurz vor der Geburt stehenden Säuglingen oder Kindern mit ungeklärter interstitieller Lungenerkrankung oder anderen seltenen Lungenphänotypen)/Eltern-Trios werden wir de novo oder rezessiv vererbt identifizieren pathogene Varianten, einschließlich Einzelnukleotidvarianten, kleine Insertionen/Deletionen und Kopienzahl- oder Strukturvarianten (>100 kb). Um die Pathogenität vorherzusagen, verwenden wir eine Reihe von rechnerischen Vorhersagealgorithmen (z. B. ANNOVAR, CADD). Um Varianten in Genen und Genwegen zu bestätigen, die zuvor nicht mit seltenen respiratorischen Phänotypen bei menschlichen Säuglingen/Kindern in Verbindung gebracht wurden, werden wir GeneMatcher verwenden, um andere betroffene Säuglinge mit pathogenen Varianten am selben Genort oder im selben Genweg zu identifizieren oder identifizierte Varianten funktionell zu testen eine Vielzahl von zellbasierten Jor-Modell-Organismus-Modellen. Die Verwendung von Sequenzierungstechnologie der nächsten Generation und modernster statistischer Methoden zur Aufklärung der genetischen Komplexität des neonatalen Atemnotsyndroms und seltener Lungenphänotypen bei Säuglingen wird die Entwicklung personalisierter diagnostischer Instrumente und präventiver therapeutischer Strategien für Säuglinge und Kleinkinder mit hohem Risiko ermöglichen.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Geschätzt)

7000

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

    • Missouri
      • Saint Louis, Missouri, Vereinigte Staaten, 63110
        • Rekrutierung
        • Washington University School of Medicine
        • Kontakt:

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

Nicht älter als 1 Jahr (Kind)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Ja

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Kohorte I ist eine bevölkerungsbezogene Kohorte aus Missouri. Kohorte II ist eine Kohorte von Familientrios (betroffener Säugling/Kind und Eltern), die auch andere nicht betroffene oder betroffene Geschwister von der Neugeborenen-Intensivstation des St. Louis Children's Hospital und von Patienten umfassen kann, die von anderen Zentren überwiesen wurden.

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Normale Lungenfunktion oder eine Diagnose von RDS

Ausschlusskriterien:

  • Keiner

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Populationsbasierte Kohorte
Beschreibende Kohorte von populationsbasierten DNA-Proben aus dem Neugeborenen-Screening-Programm in Missouri mit auf Vitalstatistiken basierenden, verknüpften Phänotypdaten
Trio-Sequenzierungskohorte
Betroffener Säugling/Kind (reifgeborener oder kurz vor der Geburt geborener Säugling mit fortschreitender Atemnot oder einem anderen seltenen pulmonalen Phänotyp oder älteres Kind mit interstitieller Lungenerkrankung oder einem anderen seltenen pulmonalen Phänotyp) und Eltern

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Statistische Assoziation seltener, funktionell störender genomischer Varianten mit RDS
Zeitfenster: 4 Wochen
Entdecken Sie mithilfe von Trio-Gesamtexom- oder -Genomsequenzierung, Next-Generation-Sequenzierung und In-Silico-Funktionsvorhersage statistische Assoziationen zwischen Genloci mit übermäßigen, seltenen, funktionsstörenden Varianten und dem Risiko eines neonatalen Atemnotsyndroms.
4 Wochen

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Statistische Zusammenhänge zwischen dem Risiko eines neonatalen Atemnotsyndroms und exzessiven, seltenen funktionellen Varianten in Genwegen
Zeitfenster: 4 Wochen
Identifizieren Sie statistische Assoziationen zwischen dem Risiko eines neonatalen Atemnotsyndroms und Signalwegen mit übermäßigen, seltenen funktionellen Varianten unter Verwendung von Trio-Gesamtexom- oder -Gesamtgenomsequenzierung, Next-Generation-Sequenzierung, In-Silico-Vorhersage von Funktionsvarianten und Metacore für die Konstruktion von Signalwegen
4 Wochen

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Ermittler

  • Hauptermittler: F. Sessions Cole, MD, Washington University School of Medicine

Publikationen und hilfreiche Links

Die Bereitstellung dieser Publikationen erfolgt freiwillig durch die für die Eingabe von Informationen über die Studie verantwortliche Person. Diese können sich auf alles beziehen, was mit dem Studium zu tun hat.

Allgemeine Veröffentlichungen

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

1. Juni 2001

Primärer Abschluss (Geschätzt)

30. Juni 2024

Studienabschluss (Geschätzt)

30. Juni 2024

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

11. April 2001

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

11. April 2001

Zuerst gepostet (Geschätzt)

12. April 2001

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

29. November 2023

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

24. November 2023

Zuletzt verifiziert

1. November 2023

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Beschreibung des IPD-Plans

Alle neuen Varianten werden unmittelbar nach der Veröffentlichung in öffentlichen Datenbanken hinterlegt.

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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