DNA-Methylierung bei allogener hämatopoetischer Stammzelltransplantation. (MET_SCT_2018)

Der Einsatz der hämatopoetischen Stammzelltransplantation (SCT) bei Patientengruppen, die bisher aufgrund ihres Alters nicht geeignet waren, nimmt zunehmend zu. Heutzutage macht die allogene SZT bei Patienten über 60 Jahren etwa 18 % aus. In der europäischen SCT-Datenbank betrug die Anzahl der Patienten im Alter > 65 Jahre bis zum Jahr 2000 <1 % und nach dem Jahr 2000 6,7 %. Dieser Trend ist die Folge eines wachsenden klinischen Bedarfs, der auf die fortschreitende globale Alterung der Allgemeinbevölkerung und den zunehmenden Anteil von Probanden mit gutem Leistungsstatus unter älteren Patienten zurückzuführen ist.

Die Transplantationstauglichkeit wird derzeit anhand des Fehlens der wichtigsten Komorbiditäten gemessen, die anhand des Sorror-Komorbiditätsindex (HCT-CI) bewertet werden. Der Score korreliert mit dem Ergebnis nach der Transplantation und liefert klare Hinweise auf die Intensität der Chemotherapie, die in der Phase vor der Transplantation verabreicht werden muss, um die Non-Relapse-Mortalität (NRM) zu reduzieren. NRM ist die Mortalität, die nicht auf die Genesung der Krankheit zurückzuführen ist; Sie kann aus drei Arten von Komplikationen entstehen: immunologisch (Graft-versus-Host-Krankheit – GVHD-); infektiös (opportunistische Infektionen) und toxisch (Organtoxizität im Zusammenhang mit Chemotherapie). Die Intensität des Konditionierungsschemas wird daher bei Vorliegen einer Komorbidität und bei älteren Patienten, die häufiger von Komorbiditäten betroffen sind, reduziert. Eine Verringerung der Intensität des Konditionierungsschemas bedeutet jedoch auch eine deutliche Erhöhung der Wahrscheinlichkeit eines Rückfalls einer hämatologischen Erkrankung. Daher muss diese Verringerung auf der Grundlage der oben genannten Alterungs- und Komorbiditätsindizes (HCT-CI) erfolgen, um sie nicht übermäßig zu verringern das Heilungspotenzial der Transplantation. Diese Studie zielt darauf ab, innovative Marker des biologischen Alters für die Beurteilung von SCT-Patienten anzuwenden. Die biologische Altersbestimmung ist ein schnell wachsendes Forschungsgebiet, das sehr vielversprechende Ergebnisse hervorgebracht hat. Das biologische Alter ist ein Index, der sich aus molekularen Markern zusammensetzt (z. B. DNA-Methylierung kernhaltiger Blutzellen oder der Gehalt an Glykanen, die mit zirkulierenden Proteinen verbunden sind); Es steht in engem Zusammenhang mit dem chronologischen Alter, ist jedoch in der Lage, die Geschwindigkeit des Alterns eines einzelnen Subjekts auszudrücken und ist daher in der Lage, die mit dem Altern verbundenen Gesundheitsrisiken stärker hervorzuheben als das chronologische Alter. Die neuere Literatur weist deutlich darauf hin, dass DNA auch in der nichtzellulären Fraktion vorhanden ist, und zwar in Form von freier DNA, die größtenteils im Kompartiment von Nanovesikeln enthalten ist. Insbesondere ist es interessant zu untersuchen, ob Nanovesikel-DNA nützliche Daten zum Epigenom liefern kann, und zu überprüfen, wie das Epigenom mit der Anwesenheit exogener DNA, also des Mikrobioms, zusammenhängt. Diese Einheit umfasst alle bakteriellen und viralen Spezies, die mit ihnen koexistieren Sie befinden sich meist im Magen-Darm-Trakt jedes Menschen und sind zunehmend von entscheidender Bedeutung für das Verständnis der Pathogenese entzündlicher und/oder metabolischer Erkrankungen sowie der biologischen Grundlagen des Alterns. Diesbezüglich zeigt die neuere Literatur einen engen Zusammenhang zwischen GVHD, Virom und Darmmikrobiom. Die Epigenetik befasst sich nicht speziell mit der Modifikation der Sequenz der DNA des Subjekts, sondern mit allen regulatorischen Prozessen, die die Genexpression beeinflussen. Insbesondere handelt es sich bei der Methylierung um eine epigenetische Veränderung der DNA. Daher unterscheiden sich epigenetische Studien von klassischen genetischen Studien, bei denen die Analyse der genauen DNA-Sequenz der Probanden erfolgt. In diesem Protokoll beziehen sich die Forscher auf die „Untersuchung der DNA“ als die Untersuchung ihrer Modifikationen im Methylierungsstatus und nicht in ihrer Sequenz.

Hauptziel der Studie:

- Untersuchung der DNA in Proben von Patienten, die sich einer allogenen hämatopoetischen Stammzelltransplantation unterziehen. Insbesondere wird DNA aus Leukozyten und extrazellulären Plasma-Nanovesikeln extrahiert. Die DNA wird auf das Ausmaß der Methylierung untersucht, die auch mit der zirkulierenden exogenen DNA (d. h. dem Mikrobiom) in Zusammenhang steht.

Sekundäre Ziele:

• Untersuchung der DNA in Urin- und Stuhlproben derselben Probanden zur Beschreibung weiterer Elemente des systemischen Mikrobioms – nämlich des Harnviroms und des Darmmikrobioms.
• Korrelation des zirkulierenden Epigenoms und des systemischen Mikrobioms mit klinischen Ergebnissen (Gesamtüberleben, GVHD, Inzidenz von Infektionen) und Komorbiditätsindex (HCT-CI).

Ausschlusskriterien:

- Fehlen einer unterschriebenen Einverständniserklärung.

Es wird keine Behandlung angeboten; Die Patienten werden gemäß der normalen klinischen Praxis und gemäß internationalen Richtlinien behandelt und betreut.

Bei den Besuchen und Beurteilungen handelt es sich um Routineuntersuchungen, die nicht verändert werden. Proben verschiedener biologischer Materialien werden zu Beginn der Genesung, am Tag -1, +1 und nach 1, 3, 6, 9, 12 Monaten nach der Transplantation entnommen. Nach der Entlassung werden alle Patienten wie gewohnt in der Tagesklinik der Transplantationseinheit des Hämatologischen Instituts betreut, wo die prospektive Probenentnahme zu definierten Zeiten fortgesetzt wird.

Das primäre Ziel der Studie ist die Beschreibung. Die Bewertung der wichtigsten klinischen Variablen erfolgt mittels deskriptiver Analyse (Mittelwert, Median, Bereich usw.). Die Überlebensanalyse wird gemäß der Kaplan-Meier-Methodik für zensierte Daten durchgeführt. Die Regressionsanalyse für zensierte Daten wird unter Verwendung von Cox-Proportional-Risikomodellen durchgeführt.

Die DNA-Methylierung wird in Form kontinuierlicher Variablen als Prozentsatz der Methylierung der verschiedenen analysierten Genorte ausgedrückt. Die Analyse der Methylierungsdaten erfolgt über eine Reihe von Algorithmen, die von den Befürwortern entwickelt wurden. Bei den viromischen Daten handelt es sich um nominale Variablen (Anwesenheit/Abwesenheit viraler Spezies).

Die Studie hat explorativen Charakter und wird voraussichtlich 50 Patienten umfassen.