Metilação do DNA no Transplante Alogênico de Células Tronco Hematopoiéticas. (MET_SCT_2018)

O uso de transplante de células-tronco hematopoiéticas (SCT) em grupos de pacientes previamente inadequados por causa da idade está aumentando progressivamente. Atualmente, o SCT alogênico em pacientes com mais de 60 anos representa aproximadamente 18%. No banco de dados europeu SCT, o número de pacientes com idade > 65 anos foi <1% até 2000 e 6,7% após 2000. Esta tendência é consequência de uma crescente necessidade clínica causada pelo progressivo envelhecimento global da população em geral e pelo aumento da proporção de indivíduos com bom estado funcional entre os pacientes idosos.

A adequação ao transplante é atualmente medida pela ausência das principais comorbidades avaliadas pelo índice de comorbidade de Sorror (HCT-CI). A pontuação se correlaciona com o resultado após o transplante e fornece indicações claras sobre a intensidade da quimioterapia a ser administrada na fase pré-transplante para reduzir a Mortalidade Não Recaída (NRM).NRM é a mortalidade não devida à recuperação da doença; pode decorrer de três ordens de complicações: imunológicas (doença do enxerto versus hospedeiro -GVHD-); infecciosas (infecções oportunistas) e tóxicas (toxicidade orgânica relacionada à quimioterapia). A intensidade do regime de condicionamento é consequentemente reduzida na presença de comorbidade e no paciente idoso, mais frequentemente acometido por comorbidades. Mas reduzir a intensidade do regime de condicionamento significa também aumentar significativamente a probabilidade de recidiva da doença hematológica e, portanto, essa redução deve ser feita com base nos índices de envelhecimento e comorbidade, como mencionado acima (HCT-CI), para não reduzir excessivamente o potencial curativo do transplante. Este estudo visa aplicar marcadores inovadores de idade biológica para a avaliação de pacientes com SCT. A avaliação da idade biológica é uma área de pesquisa em rápida expansão que tem produzido resultados muito promissores. A idade biológica é um índice composto por marcadores moleculares (como a metilação do DNA de células sanguíneas nucleadas ou o nível de glicanos associados a proteínas circulantes); está fortemente relacionada com a idade cronológica, mas é capaz de expressar a velocidade do envelhecimento de um único sujeito e, consequentemente, é capaz de evidenciar os riscos para a saúde associados ao envelhecimento, com mais ênfase do que a idade cronológica. A literatura recente indica claramente que o DNA também está presente na fração não celular, na forma de DNA livre que está amplamente contido no compartimento das nanovesículas. Em particular, é interessante estudar se o DNA de nanovesículas pode fornecer dados úteis sobre o epigenoma e verificar como o epigenoma está relacionado com a presença de DNA exógeno, ou seja, o microbioma. Esta entidade inclui todas as espécies bacterianas e virais que coexistem com todos os humanos, localizados maioritariamente no trato gastrointestinal, e que são cada vez mais determinantes para compreender a patogénese das doenças inflamatórias e/ou metabólicas, bem como as bases biológicas do envelhecimento. A esse respeito, a literatura recente mostra uma estreita relação entre GVHD, viroma e microbioma intestinal. A epigenética não lida especificamente com a modificação da sequência do DNA do indivíduo, mas com todos os processos regulatórios que influenciam a expressão gênica. Em particular, a metilação é uma modificação epigenética do DNA. Portanto, os estudos epigenéticos diferem dos estudos genéticos clássicos, nos quais é realizada a análise da sequência exata do DNA dos indivíduos. Neste protocolo, os investigadores se referirão ao "estudo do DNA" como o estudo de suas modificações no estado de metilação e não em sua sequência.

Objetivo principal do estudo:

- Estudo do ADN em amostras de doentes submetidos a transplante alogénico de células estaminais hematopoiéticas. Em particular, DNA será extraído de leucócitos e nanovesículas extracelulares de plasma. O DNA será avaliado quanto à extensão da metilação, que também estará relacionada ao DNA exógeno circulante (ou seja, o microbioma).

Objetivos secundários:

• Estudo do DNA em amostras de urina e fezes dos mesmos indivíduos para descrever outros elementos do microbioma sistêmico - ou seja, o viroma urinário e o microbioma intestinal.
• Correlação do epigenoma circulante e microbioma sistêmico com desfechos clínicos (sobrevida geral, GVHD, incidência de infecções) e índice de comorbidade (HCT-CI).

Critério de exclusão:

- Ausência de consentimento informado assinado.

Nenhum tratamento é fornecido; os pacientes serão tratados e acompanhados de acordo com a prática clínica normal e de acordo com as diretrizes internacionais.

As visitas e avaliações são as da prática de rotina não serão modificadas. Amostras de diferentes materiais biológicos serão coletadas no início da recuperação, no dia -1, +1 e após 1, 3, 6, 9, 12 meses após o transplante. Após a alta, todos os pacientes serão seguidos normalmente pelo Day Hospital da Unidade de Transplantes do Instituto de Hematologia, onde continuará a coleta prospectiva de amostras em horários definidos.

O objetivo primário do estudo é descritivo. A avaliação das principais variáveis ​​clínicas é feita com análise descritiva (média, mediana, amplitude, etc.). A análise de sobrevida será realizada de acordo com a metodologia Kaplan-Meier para dados censurados. A análise de regressão para dados censurados será realizada usando modelos de risco proporcional de Cox.

A metilação do DNA é expressa em termos de variáveis ​​contínuas, como uma porcentagem da metilação dos diferentes loci gênicos analisados. A análise dos dados de metilação será realizada por meio de um pipeline de algoritmos desenvolvidos pelos proponentes. Os dados virômicos são variáveis ​​nominais (presença/ausência de espécies virais).

O estudo é de natureza exploratória e espera-se incluir 50 pacientes.