DNA-methylering i allogen hæmatopoietisk stamcelletransplantation. (MET_SCT_2018)

Anvendelsen af ​​hæmatopoietisk stamcelletransplantation (SCT) i grupper af patienter, der tidligere var uegnede på grund af alder, stiger gradvist. I dag udgør allogen SCT hos patienter over 60 år cirka 18 %. I den europæiske SCT-database var antallet af patienter i alderen > 65 år <1 % frem til 2000 og 6,7 % efter 2000. Denne tendens er en konsekvens af et voksende klinisk behov forårsaget af den progressive globale aldring af den generelle befolkning og til den stigende andel af forsøgspersoner med god præstationsstatus blandt ældre patienter.

Fitness til transplantation måles i øjeblikket ved fraværet af de væsentligste komorbiditeter vurderet ved Sorror's Comorbidity Index score (HCT-CI). Scoren korrelerer med resultatet efter transplantation og giver klare indikationer på intensiteten af ​​den kemoterapi, der skal administreres i præ-transplantationsfasen for at reducere ikke-tilbagefaldsdødelighed (NRM). NRM er dødeligheden, der ikke skyldes genopretning af sygdommen; det kan opstå fra tre rækkefølger af komplikationer: immunologisk (Graft versus Host Disease -GVHD-); infektiøse (opportunistiske infektioner) og toksiske (organtoksicitet relateret til kemoterapi). Intensiteten af ​​konditioneringsregimen reduceres følgelig ved tilstedeværelse af komorbiditet og hos den ældre patient, hyppigere påvirket af komorbiditet. Men at reducere intensiteten af ​​konditioneringsregimet betyder også en væsentlig forøgelse af sandsynligheden for tilbagefald af hæmatologisk sygdom, og derfor skal denne reduktion foretages på basis af indeks for aldring og komorbiditet, som nævnt ovenfor (HCT-CI), for ikke at reducere alt for meget. transplantationens helbredende potentiale. Denne undersøgelse har til formål at anvende innovative markører for biologisk alder til evaluering af SCT-patienter. Biologisk aldersvurdering er et hastigt voksende forskningsområde, der har givet meget lovende resultater. Biologisk alder er et indeks sammensat af molekylære markører (såsom DNA-methylering af nukleerede blodceller eller niveauet af glycaner forbundet med cirkulerende proteiner); det er stærkt relateret til kronologisk alder, men er i stand til at udtrykke ældningshastigheden for det enkelte individ og er derfor i stand til at fremhæve de sundhedsrisici, der er forbundet med aldring, med mere vægt end kronologisk alder. Den nyere litteratur indikerer klart, at DNA også er til stede i den ikke-cellulære fraktion, i form af frit DNA, som det stort set er indeholdt i nanovesiklernes rum. Det er især interessant at undersøge, om nanovesicles DNA kan give nyttige data vedrørende epigenomet og at verificere, hvordan epigenomet er forbundet med tilstedeværelsen af ​​eksogent DNA, dvs. mikrobiomet. Denne enhed omfatter alle de bakterielle og virale arter, der eksisterer sammen med hvert menneske, for det meste lokaliseret i mave-tarmkanalen, og som i stigende grad er bestemmende for at forstå patogenesen af ​​inflammatoriske og/eller metaboliske sygdomme, såvel som de biologiske grundlag for aldring. I denne henseende viser den nyere litteratur et tæt forhold mellem GVHD, viroma og intestinalt mikrobiom. Epigenetik beskæftiger sig ikke specifikt med ændringen af ​​sekvensen af ​​individets DNA, men med alle de regulatoriske processer, der påvirker genekspression. Især er methylering en epigenetisk modifikation af DNA. Derfor adskiller epigenetiske undersøgelser sig fra klassiske genetiske undersøgelser, hvor analysen af ​​forsøgspersonernes nøjagtige DNA-sekvens udføres. I denne protokol vil efterforskerne henvise til "undersøgelsen af ​​DNA" som undersøgelsen af ​​dens modifikationer i methyleringsstatus og ikke i dens sekvens.

Undersøgelsens primære mål:

- Undersøgelse af DNA i prøver af patienter, der gennemgår allogen hæmatopoietisk stamcelletransplantation. Især vil DNA blive ekstraheret fra leukocytter og plasma ekstracellulære nanovesikler. DNA vil blive vurderet for omfanget af methylering, som også vil være i relation til cirkulerende eksogent DNA (dvs. mikrobiomet).

Sekundære mål:

• Undersøgelse af DNA i urin- og fæcesprøver fra de samme forsøgspersoner for at beskrive yderligere elementer af det systemiske mikrobiom - nemlig urinviromet og tarmmikrobiomet.
• Korrelation af cirkulerende epigenom og systemisk mikrobiom med kliniske resultater (samlet overlevelse, GVHD, forekomst af infektioner) og komorbiditetsindeks (HCT-CI).

Eksklusionskriterier:

- Fravær af underskrevet informeret samtykke.

Der ydes ingen behandling; patienter vil blive behandlet og fulgt i henhold til normal klinisk praksis og i henhold til internationale retningslinjer.

Besøgene og evalueringerne er rutineprægede, vil ikke blive ændret. Prøver af forskellige biologiske materialer vil blive taget i starten af ​​genopretning, på dag -1, +1 og efter 1, 3, 6, 9, 12 måneder efter transplantation. Efter udskrivelsen vil alle patienter som sædvanligt blive fulgt af Daghospitalet på Hæmatologisk Instituts Transplantationsenhed, hvor den prospektive indsamling af prøver på fastlagte tidspunkter vil fortsætte.

Det primære formål med undersøgelsen er beskrivende. Evalueringen af ​​de vigtigste kliniske variabler foretages med deskriptiv analyse (middelværdi, median, interval osv.). Overlevelsesanalyse vil blive udført i henhold til Kaplan-Meier-metoden for censurerede data. Regressionsanalyse for censurerede data vil blive udført ved hjælp af Cox proportionelle risikomodeller.

DNA-methyleringen udtrykkes i form af kontinuerte variable, som en procentdel af methyleringen af ​​de forskellige analyserede gen-loci. Analysen af ​​methyleringsdata vil blive udført gennem en pipeline af algoritmer udviklet af forslagsstillerne. De viromiske data er nominelle variable (tilstedeværelse/fravær af virale arter).

Undersøgelsen er af eksplorativ karakter og forventes at inkludere 50 patienter.