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同种异体造血干细胞移植中的 DNA 甲基化。 (MET_SCT_2018)

2023年5月26日 更新者:Francesca Bonifazi, MD、IRCCS Azienda Ospedaliero-Universitaria di Bologna

同种异体造血干细胞移植中的 DNA 甲基化 (MET_SCT_2018)。

由于预期寿命即将延长,因此迫切需要采取挽救生命的干预措施,例如造血干细胞移植 (SCT),这些患者由于其先进性而被认为不适合此类医疗程序年龄。 然而,越来越多的证据表明,年龄本身并不能可靠地估计个人应对 SCT 压力程序和处理同源不良反应的能力。 最近的文献表明,基因组 DNA 特定位点的表观遗传标记(即甲基化程度)的变化标志着衰老的速度,并允许估计所谓的“生物衰老”。 换句话说,当评估生理年龄时,相同实际年龄的个体可能会变得更年长或更年轻。 后者预计与主要稳态机制的变化密切相关,因此与成功 SCT 的机会有关。 该研究的主要目的是研究接受同种异体造血干细胞移植的患者的 DNA。 将评估 DNA 的甲基化程度,这也与循环的外源 DNA(即微生物组)有关。

研究概览

地位

招聘中

详细说明

造血干细胞移植 (SCT) 在以前因年龄不适合的患者群体中的应用正在逐渐增加。 如今,60 岁以上患者的同种异体 SCT 约占 18%。 在欧洲 SCT 数据库中,年龄 > 65 岁的患者人数在 2000 年之前为 <1%,在 2000 年之后为 6.7%。 这种趋势是由于全球总人口的逐渐老龄化以及老年患者中身体状况良好的受试者比例增加导致临床需求不断增长的结果。

目前,移植的适应性是通过不存在 Sorror 的合并症指数评分 (HCT-CI) 评估的主要合并症来衡量的。 该评分与移植后的结果相关,并明确指示移植前阶段化疗的强度,以降低非复发死亡率 (NRM)。NRM 是不是由于疾病恢复而导致的死亡率;它可能由三种并发症引起:免疫(移植物抗宿主病 -GVHD-);传染性(机会性感染)和毒性(与化疗相关的器官毒性)。 预处理方案的强度因此在存在合并症时降低,并且在老年患者中,更频繁地受合并症影响。 但降低预处理方案的强度也意味着显着增加血液病复发的概率,因此这种降低必须根据上述老化和合并症指标(HCT-CI)进行,以免过度降低移植的治疗潜力。本研究旨在应用生物年龄的创新标记来评估 SCT 患者。 生物年龄评估是一个迅速扩展的研究领域,已经产生了非常有前途的结果。 生物年龄是由分子标记(如有核血细胞的DNA甲基化或与循环蛋白相关的聚糖水平)组成的指标;它与实足年龄密切相关,但能够表达单个主体的衰老速度,因此能够突出与衰老相关的健康风险,比实足年龄更受重视。 最近的文献清楚地表明 DNA 也存在于非细胞部分中,以游离 DNA 的形式存在,它主要包含在纳米囊泡的隔室中。 特别值得一提的是,研究纳米囊泡 DNA 是否可以提供有关表观基因组的有用数据,并验证表观基因组如何与外源 DNA(即微生物组)的存在相关联。该实体包括与微生物共存的所有细菌和病毒物种每个人,主要位于胃肠道,并且越来越决心了解炎症和/或代谢疾病的发病机制,以及衰老的生物学基础。 在这方面,最近的文献表明 GVHD、病毒瘤和肠道微生物组之间存在密切关系。表观遗传学并不专门研究受试者 DNA 序列的修饰,而是研究影响基因表达的所有调控过程。 特别是,甲基化是 DNA 的表观遗传修饰。 因此,表观遗传学研究不同于经典遗传学研究,后者对受试者的确切 DNA 序列进行分析。 在本协议中,研究人员将“DNA 研究”称为对其甲基化状态而非序列修饰的研究。

研究的主要目的:

- 研究接受同种异体造血干细胞移植的患者样本中的 DNA。 特别是,将从白细胞和血浆细胞外纳米囊泡中提取 DNA。 将评估 DNA 的甲基化程度,这也与循环的外源 DNA(即微生物组)有关。

次要目标:

  • 研究同一受试者的尿液和粪便样本中的 DNA,以描述系统微生物组的更多元素 - 即尿液病毒组和肠道微生物组。
  • 循环表观基因组和全身微生物组与临床结果(总生存期、GVHD、感染发生率)和合并症指数 (HCT-CI) 的相关性。

排除标准:

- 没有签署知情同意书。

不提供治疗;患者将根据正常临床实践和国际准则接受治疗和随访。

访视和评估是常规做法,不会更改。 不同生物材料的样本将在恢复开始时、第-1、+1天以及移植后1、3、6、9、12个月后采集。 出院后,所有患者将像往常一样在血液学研究所移植科日间医院接受随访,并在指定时间继续前瞻性样本采集。

研究的主要目的是描述性的。 主要临床变量的评估是通过描述性分析(平均值、中位数、范围等)完成的。 将根据删失数据的 Kaplan-Meier 方法进行生存分析。 审查数据的回归分析将使用 Cox 比例风险模型进行。

DNA 甲基化以连续变量表示,作为不同分析基因位点的甲基化百分比。 甲基化数据的分析将通过支持者开发的一系列算法进行。 病毒数据是名义变量(病毒种类的存在/不存在)。

该研究具有探索性,预计将招募 50 名患者。

研究类型

观察性的

注册 (估计的)

50

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习联系方式

研究联系人备份

学习地点

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 至 70年 (成人、年长者)

接受健康志愿者

取样方法

非概率样本

研究人群

所有接受同种异体造血干细胞移植的患者,作为其正常治愈过程的一部分,都将被纳入。

描述

纳入标准:

  • ≥18岁的患者。
  • S. Orsola-Malpighi 医院“Seràgnoli”血液学研究所接受同种异体造血干细胞移植的血液病患者。
  • 签署书面知情同意书后同意参加的患者。

排除标准:

- 缺乏书面知情同意。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
DNA甲基化研究
大体时间:24个月
接受同种异体造血干细胞移植的患者样本中的 DNA 研究。 特别是,将从白细胞和血浆细胞外纳米囊泡中提取 DNA。 将评估 DNA 的甲基化程度,这也与循环的外源 DNA(即微生物组)有关。
24个月

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
用于确定全身微生物组的 DNA 研究..
大体时间:24个月
研究同一受试者的尿液和粪便样本中的 DNA,以描述系统微生物组的更多元素 - 即尿液病毒组和肠道微生物组。
24个月
移植临床结果。
大体时间:24个月
循环表观基因组和全身微生物组与临床结果(总生存期、GVHD、感染发生率)和合并症指数 (HCT-CI) 的相关性。
24个月

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Francesca Bonifazi, MD、St. Orsola-Malpighi University Hospital, Bologna, Italy

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2018年9月10日

初级完成 (估计的)

2023年9月10日

研究完成 (估计的)

2024年9月10日

研究注册日期

首次提交

2019年2月4日

首先提交符合 QC 标准的

2019年3月8日

首次发布 (实际的)

2019年3月12日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2023年5月30日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2023年5月26日

最后验证

2023年5月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他研究编号

  • 151/2018/Sper/AOUBo

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

研究美国 FDA 监管的设备产品

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