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Netzwerk Medizin, Epigenetik und Adipositas (NEWTON)

17. September 2019 aktualisiert von: Giuditta Benincasa, University of Campania "Luigi Vanvitelli"

Netzwerkbasierte epigenomweite Assoziationsstudie in der Präzisionsmedizin bei Adipositas: Klinische Studie NEWTON

Die Prävalenz von Fettleibigkeit nimmt zu und betrifft mehr als 650 Millionen Menschen jeden Alters und ist damit zu einer der größten globalen Gesundheitsbedrohungen geworden. Adipositas ist ein komplexes Syndrom, das die Gesundheit durch eine Vielzahl von Komplikationen wie Herz-Kreislauf-Erkrankungen, Typ-1- und Typ-2-Diabetes (T1D und T2D), Krebs, Muskel-Skelett-Erkrankungen, psychosoziale Ungleichgewichte und eingeschränkte Lebensqualität ernsthaft beeinträchtigen und die Behandlung beeinträchtigen kann von anderen Bedingungen. Es hat sich gezeigt, dass eine Gewichtsreduktion einen positiven Effekt auf diese Komorbiditäten hat und die Wirksamkeit von Behandlungen erhöhen kann, die spezifisch für andere Komorbiditäten sind. Die Änderung des Lebensstils ist ein wesentlicher Bestandteil des Gewichtsmanagements, reicht jedoch oft allein nicht aus und kann gegebenenfalls durch pharmakologische und chirurgische Zusatzbehandlungen ergänzt werden, um eine größere und nachhaltigere Gewichtsabnahme zu erreichen. Es ist wahrscheinlich, dass es Untergruppen von Patienten gibt, die für bestimmte Behandlungsarten besser geeignet sind, und es besteht die Gefahr, dass die Ergebnisse die wahrgenommene Wirksamkeit verwässern, es sei denn, diese Gruppen werden identifiziert und die Behandlung wird personalisiert. Das Ziel dieses Projekts ist es, pathophysiologisch und klinisch bedeutsame Untergruppen von Adipositas zu identifizieren, indem Next Generation Sequencing (NGS)-Ansätze und netzwerkbasierte Algorithmen durchgeführt werden, die die Optimierung der Prävention und Behandlung von Adipositas und ihren Komplikationen ermöglichen.

Studienübersicht

Status

Unbekannt

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

Die Bevölkerungsstudie wird an der Klinischen Abteilung für Innere Medizin und Fachkunde, Abteilung für fortgeschrittene klinische und chirurgische Wissenschaften der Universität von Kampanien "Luigi Vanvitelli" rekrutiert. Diese Studie wird nach den Grundsätzen der Deklaration von Helsinki durchgeführt. Subkutanes Fettgewebe, das sich in der chirurgischen Inzision befindet, wird ohne die Verwendung von chirurgischen Geräten entnommen, um den Abbau der biologischen Probe von 50 fettleibigen Probanden (25 fettleibige Probanden mit Typ-2-Diabetes vs. 25 fettleibige Probanden ohne Typ-2-Diabetes), die sich einer bariatrischen Behandlung unterziehen, zu vermeiden Operation. Als Kontrollen (n=50) rekrutieren wir subkutanes Fettgewebe von Patienten ohne eine klinische Vorgeschichte von kardiovaskulären oder dysmetabolischen Erkrankungen, die sich einer Operation wegen Stress-Leistenhernie unterziehen. Klinische und demografische Merkmale der Studienpopulation werden aus von Ärzten erstellten Datensätzen verfügbar sein.

Aus Gewebeproben wird die genomische DNA und die Gesamt-RNA extrahiert. Genomische DNA wird mit dem DNeasy Blood & Tissue Kit (QIAGEN) gemäß Herstellerprotokoll extrahiert. Gepoolte DNA-Proben, die aus gleichen DNA-Mengen (2 µg) von Fällen und Kontrollen bestehen, werden an Genomix4Life Genomics and Bioinformatics Service geschickt, um eine globale DNA-Methylierungsanalyse durchzuführen. Zu diesem Zweck wird die Human Methylation 27K BeadChip-Plattform unter Verwendung der Bisulfit-Umwandlungstechnologie (BBRS-Seq) verwendet. Die Gesamt-RNA wird mit dem RNeasy Mini Kit (QIAGEN) gemäß Herstellerprotokoll aus Geweben extrahiert. Die Erstellung der cDNA-Bibliothek wird ausgehend von 4 ug Gesamt-RNA unter Verwendung von Illumina TruSeq-Bibliotheken durchgeführt und dann mit hoher Abdeckung auf der Illumina HiSeq 2500 NGS-Plattform sequenziert. Nukleinsäurekonzentrationen und Qualitätskontrolle von Genomix4Life werden mit einem Nanodrop-Spektrophotometer (Thermo Fisher Scientific) und einem Qubit-Assay (Thermo Fisher Scientific) und TapeStation 4200 (Agilent) bewertet. Das gewichtete menschliche DNA-Methylierungs-PPI-Netzwerk (WMPN) wird konstruiert, um ein Adipositas-Interaktom in beiden Untergruppen (fettleibig und fettleibig mit T2D vs. Kontrollen) basierend auf unterschiedlich methylierten Genen zu erhalten, um mutmaßliche nützliche diagnostische Biomarker zu identifizieren. Der TargetScan-Algorithmus wird verwendet, um miRNA-Zielgenpaare aus derselben Studienpopulation robust vorherzusagen, indem er die konservierten Seed-Paarungsregionen in den 3'-Untraslated-Regionen (UTR) von Genen auf der Grundlage des Gesamtgenom-Alignments durchsucht.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Voraussichtlich)

100

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre bis 60 Jahre (Erwachsene)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Subkutanes Fettgewebe, das sich in der chirurgischen Inzision befindet, wird ohne die Verwendung von chirurgischen Geräten entnommen, um den Abbau der biologischen Probe von 50 fettleibigen Probanden (25 fettleibige Probanden mit Typ-2-Diabetes vs. 25 fettleibige Probanden ohne Typ-2-Diabetes), die sich einer bariatrischen Behandlung unterziehen, zu vermeiden Operation. Als Kontrollen (n=50) rekrutieren wir subkutanes Fettgewebe von Patienten ohne eine klinische Vorgeschichte von kardiovaskulären oder dysmetabolischen Erkrankungen, die sich einer Operation wegen Stress-Leistenhernie unterziehen.

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Erfüllt die aktuellen Richtlinien der American Diabetes Association für die Diagnose von Diabetes (Diabetikergruppe) und Fettleibigkeit
  • Muss bereit und in der Lage sein, die Studienanforderungen zu erfüllen
  • Muss ihr Verständnis der Studie und ihre Bereitschaft zur Teilnahme durch Unterzeichnung einer entsprechenden Einwilligungserklärung angeben

Ausschlusskriterien:

  • Geschichte von Krebs
  • Malignitätsstörungen
  • Aktive Infektionen
  • Chronische oder immunvermittelte Erkrankungen
  • Primärerkrankung, die einen chirurgischen Eingriff erfordert
  • Das Komplikationsscreening kann nicht eingehalten werden
  • Unter 18 Jahre alt
  • Schwanger sind oder planen, während der Untersuchung schwanger zu werden
  • Lebenserwartung <12 m
  • Derzeit Teilnahme an einer anderen klinischen Prüfung

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Beobachtungsmodelle: Fallkontrolle
  • Zeitperspektiven: Interessent

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Kontrollsubjekte
Sonstiges: DNA-Methylom und Gesamt-RNA-Sequenzierung
Epigenomik-Tools kombiniert mit bioinformatischer Analyse, um vermeintlich nützliche klinische Biomarker mit klinischen Merkmalen zu korrelieren
Übergewichtige Probanden mit und ohne T2D
Sonstiges: DNA-Methylom und Gesamt-RNA-Sequenzierung
Epigenomik-Tools kombiniert mit bioinformatischer Analyse, um vermeintlich nützliche klinische Biomarker mit klinischen Merkmalen zu korrelieren

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
DNA-Methylierungsmuster im Fettgewebe
Zeitfenster: 3 Monate
Unter Verwendung der Methylation 27K BeadChip-Plattform basierend auf der Bisulfit-Umwandlungstechnologie wird ein DNA-Methylierungsprofil in Fettgeweben von 25 vorab ausgewählten fettleibigen Probanden und 25 fettleibigen Probanden im Vergleich zu Kontrollen (n = 50) durchgeführt.
3 Monate
Bioinformatische Analyse zur Vorhersage mutmaßlicher neuer Kandidatengene, die dem Phänotyp der Adipositas zugrunde liegen
Zeitfenster: 6 Monate
Der netzwerkbasierte Algorithmus „Weighted Human DNA methylation PPI network (WMPN)“ wird auf Methylomdaten angewendet, um ein Krankheitsmodul zu erhalten, das die entscheidenden differentiell methylierten Gene sowohl bei adipösen Patienten als auch bei adipösen Patienten mit T2D im Vergleich zu Kontrollen enthält.
6 Monate
RNA-Sequenzanalyse im Fettgewebe
Zeitfenster: 3 Monate
Eine RNA-Sequenzanalyse unter Verwendung der Illumina HiSeq2000 Next Generatin Sequencing (NGS)-Plattform wird durchgeführt, um differenziell exprimierte Mikro-RNA- und mRNA-Ziele sowohl bei adipösen Patienten als auch bei adipösen Patienten mit T2D im Vergleich zu Kontrollen zu identifizieren.
3 Monate

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
ROC-Kurvenanalyse zur Bewertung mutmaßlicher DNA-Methylierung/microRNA-Wechselwirkungen
Zeitfenster: 12 Monate
ROC-Kurvenanalyse zur Bewertung mutmaßlicher DNA-Methylierung/microRNA-Wechselwirkungen als diagnostische Biomarker zur Unterscheidung von Adipositas-Untergruppen.
12 Monate
Lineare Regressionsanalyse und BMI (kg/m2).
Zeitfenster: 12 Monate
Lineare Regression zur Korrelation epigenetischer Biomarker mit dem BMI (kg/m2) in verschiedenen Untergruppen.
12 Monate
Lineare Regression zur Korrelation epigenetischer Biomarker mit proinflammatorischen Zytokinen
Zeitfenster: 12 Monate
Lineare Regression zur Korrelation epigenetischer Biomarker mit proinflammatorischen Zytokinspiegeln (TNF-α, IL-6, PCR) in verschiedenen Untergruppen.
12 Monate
Lineare Regression zur Korrelation epigenetischer Biomarker mit dem HOMA-Index
Zeitfenster: 12 Monate
Lineare Regression zur Korrelation epigenetischer Biomarker mit klinischen Variablen, wie z. B. HOMA-Index-Glykämie (mmol/L) x Insulinämie (mUI/L)/22,5, in verschiedenen Untergruppen.
12 Monate

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

University of Campania "Luigi Vanvitelli"

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Voraussichtlich)

1. Dezember 2019

Primärer Abschluss (Voraussichtlich)

1. Juni 2020

Studienabschluss (Voraussichtlich)

1. Juni 2021

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

31. März 2019

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

2. April 2019

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

4. April 2019

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

18. September 2019

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

17. September 2019

Zuletzt verifiziert

1. September 2019

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Schlüsselwörter

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • PRIN2017F8ZB89 (Andere Zuschuss-/Finanzierungsnummer: Italian Ministry of University and Research (MIUR))

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

Nein

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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