Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Netwerkgeneeskunde, epigenetica en obesitas (NEWTON)

17 september 2019 bijgewerkt door: Giuditta Benincasa, University of Campania "Luigi Vanvitelli"

Netwerkgebaseerd epigenoom-breed associatieonderzoek in obesitasprecisiegeneeskunde: NEWTON klinisch onderzoek

De prevalentie van zwaarlijvigheid neemt toe en treft meer dan 650 miljoen mensen van alle leeftijden, waardoor het een van de belangrijkste wereldwijde bedreigingen voor de gezondheid wordt. Obesitas is een complex syndroom dat de gezondheid ernstig kan schaden door een breed scala aan complicaties, zoals hart- en vaatziekten, diabetes type 1 en 2 (T1D en T2D), kanker, musculoskeletale aandoeningen, psychosociale onevenwichtigheden en verminderde kwaliteit van leven, en beïnvloedt de behandeling van andere voorwaarden. Het is aangetoond dat gewichtsvermindering een positief effect heeft op deze comorbiditeiten en de effectiviteit van behandelingen die specifiek zijn voor andere comorbiditeiten kan verhogen. Aanpassing van levensstijl is een integraal onderdeel van het traject van gewichtsbeheersing, maar is op zichzelf vaak onvoldoende en kan worden aangevuld met farmacologische en chirurgische aanvullende behandelingen om, indien van toepassing, meer en duurzamer gewichtsverlies te bereiken. Het is waarschijnlijk dat er subgroepen van patiënten zijn die geschikter zijn voor bepaalde soorten behandelingen en dat de resultaten het risico lopen dat de waargenomen werkzaamheid afneemt, tenzij deze groepen worden geïdentificeerd en de behandeling wordt gepersonaliseerd. Het doel van dit project is om pathofysiologisch en klinisch relevante subgroepen van obesitas te identificeren door het uitvoeren van Next Generation Sequencing (NGS) benaderingen en netwerkgebaseerde algoritmen die de optimalisatie van de preventie en behandeling van obesitas en de complicaties ervan mogelijk zullen maken.

Studie Overzicht

Toestand

Onbekend

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Populatieonderzoek zal worden aangeworven bij de Klinische Afdeling Interne Geneeskunde en Specialisten, Afdeling Geavanceerde Klinische en Chirurgische Wetenschappen van de Universiteit van Campania "Luigi Vanvitelli". Deze studie zal worden uitgevoerd volgens de principes uiteengezet in de Verklaring van Helsinki. Onderhuids vetweefsel dat zich in de chirurgische incisie bevindt, zal worden teruggetrokken zonder het gebruik van chirurgische hulpmiddelen om de afbraak van het biologische monster van 50 zwaarlijvige proefpersonen (25 zwaarlijvige proefpersonen met diabetes type 2 versus 25 zwaarlijvige proefpersonen zonder diabetes type 2) die bariatrische patiënten ondergingen, te voorkomen. chirurgie. Als controlegroep (n=50) zullen we onderhuids vetweefsel rekruteren van patiënten zonder een klinische voorgeschiedenis van cardiovasculaire of dysmetabolische aandoeningen die een operatie ondergaan voor stress inguinale hernia. Klinische en demografische kenmerken van de onderzoekspopulatie zullen beschikbaar zijn uit door artsen gegenereerde datasets.

Uit weefselmonsters wordt het genomische DNA en het totale RNA geëxtraheerd. Genomisch DNA zal worden geëxtraheerd met behulp van de DNeasy Blood & Tissue kit (QIAGEN), volgens het protocol van de fabrikant. Gepoolde DNA-monsters bestaande uit gelijke hoeveelheden DNA (2 μg) uit gevallen en controles zullen worden verzonden naar Genomix4Life Genomics and Bioinformatics Service, om een ​​wereldwijde DNA-methylatie-analyse uit te voeren. Hiervoor zal het Human Methylation 27K BeadChip-platform worden gebruikt met behulp van Bisulfite-conversietechnologie (BBRS-Seq). Totaal RNA zal worden geëxtraheerd uit weefsels met behulp van RNeasy Mini Kit (QIAGEN) volgens het protocol van de fabrikant. De voorbereiding van de cDNA-bibliotheek zal worden uitgevoerd vanaf 4 µg totaal RNA met behulp van Illumina TruSeq-bibliotheken en vervolgens wordt de sequentie bepaald met een hoge dekking op het Illumina HiSeq 2500 NGS-platform. Nucleïnezuurconcentraties en kwaliteitscontrole van Genomix4Life zullen worden beoordeeld met behulp van Nanodrop-spectrofotometer (Thermo Fisher Scientific) en Qubit-assay (Thermo Fisher Scientific) en TapeStation 4200 (Agilent). Het gewogen menselijke DNA-methylatie-PPI-netwerk (WMPN) zal worden geconstrueerd om een ​​obesitas-interactoom te verkrijgen in beide subgroepen (zwaarlijvig en zwaarlijvig met T2D versus controles) op basis van differentieel gemethyleerde genen om vermoedelijk bruikbare diagnostische biomarkers te identificeren. Het TargetScan-algoritme , door te zoeken in de geconserveerde seed-pairing-regio's in de 3'-untraslated-regio's (UTR) van genen op basis van volledige genoomuitlijning, zal worden gebruikt om miRNA-target-genenparen van dezelfde studiepopulatie robuust te voorspellen.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Verwacht)

100

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar tot 60 jaar (Volwassen)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Onderhuids vetweefsel dat zich in de chirurgische incisie bevindt, zal worden teruggetrokken zonder het gebruik van chirurgische hulpmiddelen om de afbraak van het biologische monster van 50 zwaarlijvige proefpersonen (25 zwaarlijvige proefpersonen met diabetes type 2 versus 25 zwaarlijvige proefpersonen zonder diabetes type 2) die bariatrische patiënten ondergingen, te voorkomen. chirurgie. Als controlegroep (n=50) zullen we onderhuids vetweefsel rekruteren van patiënten zonder een klinische voorgeschiedenis van cardiovasculaire of dysmetabolische aandoeningen die een operatie ondergaan voor stress inguinale hernia.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Voldoet aan de huidige richtlijn van de American Diabetes Association voor de diagnose van diabetes (diabetische groep) en obesitas
  • Moet bereid en in staat zijn om aan de studievereisten te voldoen
  • Moeten hun begrip van de studie en bereidheid om deel te nemen aangeven door een geschikt geïnformeerd toestemmingsformulier te ondertekenen

Uitsluitingscriteria:

  • Geschiedenis van kanker
  • Maligniteitsstoornissen
  • Actieve infecties
  • Chronische of immuungemedieerde ziekten
  • Primaire ziekte die chirurgische ingreep vereist
  • Kan niet voldoen aan de complicatiescreening
  • Minder dan 18 jaar oud
  • Zwanger of van plan zwanger te worden tijdens de duur van het onderzoek
  • Levensverwachting <12 m
  • Neemt momenteel deel aan enig ander klinisch onderzoek

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Observatiemodellen: Case-control
  • Tijdsperspectieven: Prospectief

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
controle onderwerpen
Ander: DNA-methyloom en totaal-RNA-sequencing
Epigenomics-tools gecombineerd met bio-informatica-analyse om vermeende bruikbare klinische biomarkers te correleren met klinische kenmerken
Zwaarlijvige proefpersonen met en zonder T2D
Ander: DNA-methyloom en totaal-RNA-sequencing
Epigenomics-tools gecombineerd met bio-informatica-analyse om vermeende bruikbare klinische biomarkers te correleren met klinische kenmerken

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
DNA-methylatiepatroon in vetweefsels
Tijdsspanne: 3 maanden
Met behulp van het Methylation 27K BeadChip-platform op basis van Bisulfite-conversietechnologie, zal het DNA-methylatieprofiel in vetweefsels van 25 vooraf geselecteerde zwaarlijvige proefpersonen en 25 zwaarlijvige proefpersonen met respect voor controles (n=50) worden uitgevoerd.
3 maanden
Bio-informatica-analyse om vermeende nieuwe kandidaatgenen te voorspellen die ten grondslag liggen aan het fenotype van obesitas
Tijdsspanne: 6 maanden
Het netwerkgebaseerde algoritme "Weighted Human DNA methylation PPI network (WMPN)" zal worden toegepast op methyloomgegevens om een ​​ziektemodule te verkrijgen die de cruciale differentieel gemethyleerde genen bevat, zowel bij zwaarlijvige patiënten als bij zwaarlijvige patiënten met T2D in vergelijking met controles.
6 maanden
RNA-sequencinganalyse in vetweefsel
Tijdsspanne: 3 maanden
RNA-sequencing-analyse met behulp van Illumina HiSeq2000 Next Generatin Sequencing (NGS)-platform zal worden uitgevoerd voor het identificeren van differentieel tot expressie gebracht micro-RNA- en mRNA-doelwit, zowel bij obese patiënten als obese patiënten met T2D in vergelijking met controles.
3 maanden

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
ROC-curvenanalyse om vermeende DNA-methylatie / microRNA-interacties te evalueren
Tijdsspanne: 12 maanden
ROC-curvenanalyse om vermeende DNA-methylatie / microRNA-interacties te evalueren als diagnostische biomarkers om obesitas-subgroepen te onderscheiden.
12 maanden
Lineaire regressieanalyse en BMI (Kg/m2).
Tijdsspanne: 12 maanden
Lineaire regressie om epigenetische biomarkers te correleren met BMI (Kg/m2) in verschillende subgroepen.
12 maanden
Lineaire regressie om epigenetische biomarkers te correleren met pro-inflammatoire cytokines
Tijdsspanne: 12 maanden
Lineaire regressie om epigenetische biomarkers te correleren met pro-inflammatoire cytokines (TNF-α, IL-6, PCR) niveaus in verschillende subgroepen.
12 maanden
Lineaire regressie om epigenetische biomarkers te correleren met de HOMA-index
Tijdsspanne: 12 maanden
Lineaire regressie om epigenetische biomarkers te correleren met klinische variabelen, zoals HOMA-indexglycemie (mmol/L) x insulinemie (mUI/L)/22,5, in verschillende subgroepen.
12 maanden

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

University of Campania "Luigi Vanvitelli"

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Verwacht)

1 december 2019

Primaire voltooiing (Verwacht)

1 juni 2020

Studie voltooiing (Verwacht)

1 juni 2021

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

31 maart 2019

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

2 april 2019

Eerst geplaatst (Werkelijk)

4 april 2019

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

18 september 2019

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

17 september 2019

Laatst geverifieerd

1 september 2019

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • PRIN2017F8ZB89 (Ander subsidie-/financieringsnummer: Italian Ministry of University and Research (MIUR))

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

Nee

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren