Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Сетевая медицина, эпигенетика и ожирение (NEWTON)

17 сентября 2019 г. обновлено: Giuditta Benincasa, University of Campania "Luigi Vanvitelli"

Сетевое эпигеномное ассоциативное исследование в области точной медицины ожирения: клиническое исследование NEWTON

Распространенность ожирения растет и затрагивает более 650 миллионов человек всех возрастов, что делает его одной из главных глобальных угроз для здоровья. Ожирение — это сложный синдром, который может серьезно ухудшить здоровье из-за широкого спектра осложнений, таких как сердечно-сосудистые заболевания, диабет 1 и 2 типа (СД1 и СД2), рак, нарушения опорно-двигательного аппарата, психосоциальный дисбаланс и снижение качества жизни, что влияет на лечение. других условий. Было показано, что снижение веса оказывает положительное влияние на эти сопутствующие заболевания и может повысить эффективность лечения, характерного для других сопутствующих заболеваний. Модификация образа жизни является неотъемлемой частью пути к управлению весом, но часто сама по себе недостаточна и может быть дополнена фармакологическими и хирургическими дополнительными методами лечения для достижения большей и более устойчивой потери веса, если это необходимо. Вполне вероятно, что существуют подгруппы пациентов, которым больше подходят определенные виды лечения, и результаты могут привести к ослаблению воспринимаемой эффективности, если только эти группы не будут определены и лечение не будет персонализировано. Целью этого проекта является выявление патофизиологически и клинически значимых подгрупп ожирения с помощью подходов секвенирования нового поколения (NGS) и сетевого алгоритма, которые позволят оптимизировать профилактику и лечение ожирения и его осложнений.

Обзор исследования

Статус

Неизвестный

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Популяционное исследование будет набрано на клиническом факультете внутренней медицины и специализированного факультета передовых клинических и хирургических наук Университета Кампании «Луиджи Ванвителли». Это исследование будет проводиться в соответствии с принципами, изложенными в Хельсинкской декларации. Подкожная жировая ткань, расположенная в хирургическом разрезе, будет извлечена без использования хирургических устройств, чтобы избежать деградации биологического образца у 50 субъектов с ожирением (25 субъектов с ожирением и диабетом 2 типа против 25 субъектов с ожирением без диабета 2 типа), перенесших бариатрическую операцию. операция. В качестве контроля (n = 50) мы набирали подкожную жировую ткань от пациентов без истории болезни сердечно-сосудистых или дисметаболических заболеваний, перенесших операцию по поводу стрессовой паховой грыжи. Клинические и демографические характеристики исследуемой популяции будут доступны из наборов данных, созданных врачами.

Из образцов тканей будут извлечены геномная ДНК и общая РНК. Геномная ДНК будет извлечена с использованием набора DNeasy Blood & Tissue Kit (QIAGEN) в соответствии с протоколом производителя. Объединенные образцы ДНК, состоящие из равных количеств ДНК (2 мкг) из случаев и контролей, будут отправлены в Службу геномики и биоинформатики Genomix4Life для проведения глобального анализа метилирования ДНК. Для этой цели будет использоваться платформа Human Methylation 27K BeadChip с использованием технологии преобразования бисульфита (BBRS-Seq). Общая РНК будет извлечена из тканей с использованием набора RNeasy Mini Kit (QIAGEN) в соответствии с протоколом производителя. Подготовка библиотеки кДНК будет выполняться, начиная с 4 мкг общей РНК, с использованием библиотек Illumina TruSeq, а затем секвенироваться при высоком покрытии на платформе Illumina HiSeq 2500 NGS. Концентрации нуклеиновых кислот и контроль качества от Genomix4Life будут оцениваться с использованием спектрофотометра Nanodrop (Thermo Fisher Scientific) и анализа Qubit (Thermo Fisher Scientific) и TapeStation 4200 (Agilent). Сеть PPI взвешенного метилирования ДНК человека (WMPN) будет построена для получения интерактома ожирения в обеих подгруппах (с ожирением и с ожирением с СД2 по сравнению с контролем) на основе дифференциально метилированных генов с целью выявления предполагаемых полезных диагностических биомаркеров. Алгоритм TargetScan путем поиска консервативных областей спаривания семян в 3'-нетранслированных областях (UTR) генов на основе выравнивания всего генома будет использоваться для надежного прогнозирования пар генов-миРНК-мишеней из той же исследуемой популяции.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Ожидаемый)

100

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 18 лет до 60 лет (Взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Подкожная жировая ткань, расположенная в хирургическом разрезе, будет извлечена без использования хирургических устройств, чтобы избежать деградации биологического образца у 50 субъектов с ожирением (25 субъектов с ожирением и диабетом 2 типа против 25 субъектов с ожирением без диабета 2 типа), перенесших бариатрическую операцию. операция. В качестве контроля (n = 50) мы набирали подкожную жировую ткань от пациентов без истории болезни сердечно-сосудистых или дисметаболических заболеваний, перенесших операцию по поводу стрессовой паховой грыжи.

Описание

Критерии включения:

  • Соответствует действующим рекомендациям Американской диабетической ассоциации по диагностике диабета (диабетическая группа) и ожирения.
  • Должен быть готов и способен выполнять требования обучения
  • Должны указать свое понимание исследования и готовность участвовать, подписав соответствующую форму информированного согласия.

Критерий исключения:

  • История рака
  • Злокачественные заболевания
  • Активные инфекции
  • Хронические или иммуноопосредованные заболевания
  • Первичное заболевание, требующее хирургического вмешательства
  • Невозможно выполнить скрининг осложнений
  • Младше 18 лет
  • Беременны или планируют забеременеть на время исследования
  • Ожидаемая продолжительность жизни <12 мес.
  • В настоящее время участвует в любом другом клиническом исследовании

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Наблюдательные модели: Кейс-контроль
  • Временные перспективы: Перспективный

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
субъекты управления
Другой: ДНК-метилом и тотальное секвенирование РНК
Инструменты эпигеномики в сочетании с биоинформационным анализом для корреляции предполагаемых полезных клинических биомаркеров с клиническими особенностями
Субъекты с ожирением с T2D и без него
Другой: ДНК-метилом и тотальное секвенирование РНК
Инструменты эпигеномики в сочетании с биоинформационным анализом для корреляции предполагаемых полезных клинических биомаркеров с клиническими особенностями

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Характер метилирования ДНК в жировых тканях
Временное ограничение: 3 месяца
Используя платформу Methylation 27K BeadChip, основанную на технологии преобразования бисульфита, будет выполнен профиль метилирования ДНК в жировых тканях 25 предварительно отобранных субъектов с ожирением и 25 субъектов с ожирением относительно контроля (n = 50).
3 месяца
Биоинформатический анализ для прогнозирования предполагаемых новых генов-кандидатов, лежащих в основе фенотипа ожирения
Временное ограничение: 6 месяцев
Сетевой алгоритм «Взвешенная сеть PPI метилирования ДНК человека (WMPN)» будет применяться к данным метилома, чтобы получить модуль заболевания, содержащий важные дифференциально метилированные гены как у пациентов с ожирением, так и у пациентов с ожирением и СД2 по сравнению с контрольной группой.
6 месяцев
Анализ секвенирования РНК в жировых тканях
Временное ограничение: 3 месяца
Анализ секвенирования РНК с использованием платформы Illumina HiSeq2000 Next Generatin Sequencing (NGS) будет выполняться для выявления дифференциально экспрессируемых микроРНК и мишеней мРНК как у пациентов с ожирением, так и у пациентов с ожирением и СД2 по сравнению с контрольной группой.
3 месяца

Вторичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Анализ кривых ROC для оценки предполагаемых взаимодействий метилирования ДНК и микроРНК
Временное ограничение: 12 месяцев
Анализ кривых ROC для оценки предполагаемых взаимодействий метилирования ДНК / микроРНК в качестве диагностических биомаркеров для различения подгрупп ожирения.
12 месяцев
Линейный регрессионный анализ и ИМТ (кг/м2).
Временное ограничение: 12 месяцев
Линейная регрессия для корреляции эпигенетических биомаркеров с ИМТ (кг/м2) в разных подгруппах.
12 месяцев
Линейная регрессия для корреляции эпигенетических биомаркеров с провоспалительными цитокинами
Временное ограничение: 12 месяцев
Линейная регрессия для корреляции эпигенетических биомаркеров с уровнями провоспалительных цитокинов (ФНО-α, ИЛ-6, ПЦР) в разных подгруппах.
12 месяцев
Линейная регрессия для корреляции эпигенетических биомаркеров с индексом HOMA
Временное ограничение: 12 месяцев
Линейная регрессия для корреляции эпигенетических биомаркеров с клиническими переменными, такими как гликемия индекса HOMA (ммоль/л) x инсулинемия (mUI/л)/22,5, в различных подгруппах.
12 месяцев

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

University of Campania "Luigi Vanvitelli"

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Ожидаемый)

1 декабря 2019 г.

Первичное завершение (Ожидаемый)

1 июня 2020 г.

Завершение исследования (Ожидаемый)

1 июня 2021 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

31 марта 2019 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

2 апреля 2019 г.

Первый опубликованный (Действительный)

4 апреля 2019 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

18 сентября 2019 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

17 сентября 2019 г.

Последняя проверка

1 сентября 2019 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • PRIN2017F8ZB89 (Другой номер гранта/финансирования: Italian Ministry of University and Research (MIUR))

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

Нет

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться