Enfoque de secuenciación de la próxima generación metagenómica para detectar el ADN microbiano/tiempo extra en tiempo en individuos sometidos a trasplante de células madre hematopoyéticas

Descripción del estudio:

Las infecciones son una causa importante de morbilidad y mortalidad en pacientes sometidos a trasplante de células madre hematopoyéticas (HSCT). El propósito de este estudio es evaluar si la secuenciación metagenómica de próxima generación (MNG) puede detectar firmas microbianas en personas que se someten a HSCT, y si la identificación microbiana puede correlacionarse con las características clínicas de la infección (por ejemplo, fiebre).

Los participantes sometidos a HSCT como parte de otros estudios en el Centro Clínico NIH (CC) proporcionarán sangre antes del trasplante y durante 6 meses después. El ácido nucleico total se extraerá del plasma y se someterá a MNG.

Objetivos:

Primario:

Para investigar si mediante el uso de plasma y un enfoque de MNGS, podemos detectar el ADN/ARN/ARN bacteriano, fúngico, de protozoos o virales con el tiempo, en pacientes inmunocomprometidos sometidos a trasplante.

Secundario:

1. Para correlacionar la identificación microbiana con episodios de fiebre o sospecha clínica de infección.
2. Para correlacionar el cambio en las firmas microbianas en pacientes con sospecha del síndrome inflamatorio de la reconstitución inmune.

Puntos finales:

Primario:

Comparación de los resultados de MNGS con los resultados de las pruebas clínicas de rutina (microbiología y/o patología)

Secundario:

1. Cálculo de frecuencias de diferentes identificaciones microbianas en relación con el desarrollo de fiebre o infección microbiológica/clínica definida.
2. Cambios en diferentes firmas microbianas a lo largo del tiempo