Microbioma Gastrointestinal y Respuesta a la Inmunoterapia en el Melanoma Maligno Metastásico

Este estudio clínico prospectivo y no aleatorizado evalúa el valor pronóstico y predictivo del microbioma gastrointestinal en pacientes con melanoma maligno metastásico tratados con inhibidores de puntos de control inmunitario (inhibidores de PD-1 e inhibidores de CTLA-4) en primera línea. Aunque la inmunoterapia ha mejorado la supervivencia en el melanoma metastásico, los resultados clínicos siguen siendo heterogéneos y una proporción sustancial de pacientes experimenta eventos adversos relacionados con la inmunidad, pseudoprogresión o hiperprogresión. La identificación de biomarcadores que predigan la respuesta y la toxicidad sigue siendo clínicamente importante.

El tracto gastrointestinal contiene una alta concentración de microbios y tejido linfoide, y el sistema inmunitario y el microbioma existen en estrecha interacción. El microbioma gastrointestinal influye en la respuesta inmunitaria sistémica a través de la producción de citocinas y la regulación de la actividad de las células T. Estudios anteriores sugieren que la composición y diversidad del microbioma pueden estar asociadas con la supervivencia global (SG), la supervivencia libre de progresión (SLP) y la respuesta al tratamiento en pacientes que reciben inhibidores de puntos de control inmunitario. La disbiosis inducida por antibióticos se ha asociado con una eficacia reducida de la inmunoterapia, y el trasplante de microbiota fecal ha mostrado potencial para superar la resistencia a los inhibidores de PD-1.

El objetivo principal de este estudio es determinar si la composición predominante del microbioma gastrointestinal está asociada con la respuesta objetiva a los inhibidores de PD-1 y CTLA-4 en pacientes con melanoma maligno metastásico, evaluada según los criterios iRECIST. La hipótesis principal es que un perfil específico del microbioma está asociado con la respuesta al tratamiento y la supervivencia libre de progresión (SLP).

Los objetivos secundarios incluyen la evaluación de la asociación entre la composición del microbioma y los eventos adversos relacionados con la inmunidad, la progresión de la enfermedad durante el tratamiento y las poblaciones de células inmunitarias en sangre periférica (CD3+, CD4+, CD8+, relación CD4/CD8 y macrófagos).

Se incluyeron un total de 132 pacientes tratados con inhibidores de puntos de control inmunitario en primera línea en el Instituto de Oncología de Liubliana entre marzo de 2022 y marzo de 2024. Los datos clínicos se recopilaron de forma anónima e incluyen sexo, edad, fecha de diagnóstico, estado funcional al inicio del tratamiento, parámetros de laboratorio (incluidos LDH y S100), localización del melanoma, estado BRAF, duración del tratamiento, respuesta radiológica y eventos adversos relacionados con la inmunidad.

Además del tratamiento estándar, los participantes se sometieron a la recolección de muestras biológicas específicas del estudio según un calendario predefinido. Se recogieron muestras de heces antes del inicio del tratamiento, en la semana 12 (+2 semanas) y en la semana 28 (+2 semanas), en caso de sospecha de progresión/hiperprogresión, y en la aparición de eventos adversos relacionados con la inmunidad. Si los participantes recibieron terapia antibiótica, la recolección de heces se pospuso y se realizó tres semanas después de la finalización de los antibióticos. Las muestras se analizaron en la Facultad de Biotecnología de la Universidad de Liubliana mediante secuenciación de amplicones del ARNr 16S con la tecnología Illumina 16S/ITS Nextera de PCR en dos pasos y MiSeq 2×300. Los análisis bioinformáticos y estadísticos se realizaron utilizando la canalización UPARSE, las bases de datos Silva NR SSU y LTP SSU, el paquete de software Mothur y el paquete R Phyloseq.

Se recogieron muestras de sangre venosa periférica hasta cuatro semanas antes del inicio del tratamiento, en la semana 12 (+2 semanas) y en la semana 28 (+2 semanas), en caso de sospecha de progresión/hiperprogresión, y en la aparición de eventos adversos relacionados con la inmunidad. Se analizaron muestras de sangre adicionales en el Departamento de Citología del Instituto de Oncología de Liubliana mediante citometría de flujo para determinar las poblaciones de células inmunitarias, incluyendo CD3+, CD4+, CD8+, relación CD4/CD8 y macrófagos. Las muestras se analizaron utilizando el software FACSCanto 10 y FACSDiva.

La evaluación radiológica se realizó mediante PET/TC o tripleta de TC (cabeza, tórax, abdomen) dentro de las cuatro semanas previas al inicio del tratamiento y en la semana 12 (+2 semanas) y en la semana 28 (+2 semanas). Se realizaron imágenes adicionales en caso de sospecha de progresión o según criterio clínico. La respuesta al tratamiento se evaluó según los criterios iRECIST y se categorizó como respuesta completa (RC), respuesta parcial (RP), enfermedad estable (EE) o enfermedad progresiva (EP). La pseudoprogresión se definió como una progresión radiológica temporal sin deterioro clínico seguida de una reducción posterior de la carga tumoral.