Ihmisen papilloomavirus (HPV) ja kohdunkaulan esisyövän ja syövän riski

15:n syöpää aiheuttavan HPV-tyypin karsinogeenisuus vaihtelee suuresti. Haluamme selventää karsinogeenisen HPV-DNA-testauksen kliinistä käyttökelpoisuutta 21-vuotiailla ja sitä vanhemmilla naisilla ymmärtämällä yksittäisten HPV-genotyyppien ainutlaatuiset ominaisuudet viruksen pysyvyyden ja etenemisen kannalta. Erityisesti pyrimme ymmärtämään viruksen puhdistuman ajoitusta ja määrääviä tekijöitä verrattuna pysyvyyteen ja pysyvyyden huomioon ottaen riskiä etenemisestä CIN3:ksi/syöpään (suurempi tai yhtä suuri kuin CIN3) naisilla, jotka ovat saaneet jokaisen karsinogeenisen HPV-genotyypin infektoitumisen iässä, jolloin syöpää esiintyy. Luonnonhistorialliset tiedot puuttuvat. Ei ole NCI:tä tai muita kohortteja, joissa näitä ja muita kysymyksiä käsitellään riittävästi.

Kaiser Permanente Northern California (KPNC) käyttää rutiininomaisesti FDA:n hyväksymää yhdistettyä HPV-genotyyppi-DNA-testiä karsinogeenisen HPV:n varalta (Hybrid Capture 2 [HC2], Qiagen Corporation, Gaithersburg, MD) lisänä sytologiaan kohdunkaulan syövän seulonnassa 30-vuotiailla naisilla. vanhemmille ja välittömään kolposkopiaan naisille, joilla on epäselviä pap-tuloksia kaikenikäisille. Teemme yhteistyötä KPNC:n kanssa luodaksemme karsinogeenisen HPV-positiivisen kohortin (HPV Persistence and Progression -kohortti tai PaP-kohortti) HPV-genotyyppien luonnollisen historian tutkimiseksi. Erityisesti säilytämme noin 60 000 perusnäytettä seuraavista alapopulaatioista: 1) noin 40 000 HPV-positiivista ja 4 000 perusnäytteen satunnaisotos 30-vuotiailta ja sitä vanhemmilta naisilta; 2) noin 5 000 HPV-orsytologiapositiivista ja 2 000 perusnäytteen satunnaisotos 25-29-vuotiailta naisilta; ja 3) noin 5 000 HPV- tai sytologiapositiivista ja 2 000 perusnäytteen satunnaisotos 21–24-vuotiailta naisilta. Käytämme tehokkaita näytteenottosuunnitelmia suuren tehon saavuttamiseksi minimaalisilla laboratorioanalyyseillä, ja näytteet valitaan testattavaksi kliinisten tulosten perusteella, jotka varmistetaan linkittämällä Kaiserin sytologia- ja histologiatietokantoihin ja KPNC:n aktiiviseen vuosittaiseen kaikkien HC2-positiivisten naisten seurantaan. Aiomme "seurata" naisia ​​kolmen vuoden ajan heidän ilmoittautumisensa jälkeen vuosina 2007-2008 tallettamalla heidän uusintakäynneillä kerätyt jäännösnäytteet. pidempi seuranta olisi todennäköisesti puolueellinen hoidosta johtuvan laajan sensuroinnin vuoksi.

Erittäin edullinen näytteiden kertyminen, tietokoneistettu seuranta KPNC-tietokantoja käyttäen ja vipuvaikutteinen rahoitus tekevät tästä kohortista erittäin kustannustehokkaan, ja sen ehdotettu budjetti on 1 030 954 dollaria viiden vuoden aikana. Tämän populaation de novo -seulonnan kustannukset noin 50 000 HPV-positiivisen 21-vuotiaan ja sitä vanhemman naisen tunnistamiseksi, jonka KPNC suorittaa osana rutiiniseulontaa ja josta meille ei aiheudu kustannuksia, ovat noin 50 miljoonaa dollaria. Kliininen seuranta, sytologia ja histologiset diagnoosit maksavat miljoonia enemmän. Voimme saada genotyypityksen ja varianttitestauksen ilman kustannuksia Syövän epidemiologian ja genetiikan osastolle (DCEG) yhteistyön ja edellä mainitun yhteistyösopimuksen kautta. Suurimmat kustannukset aiheutuvat henkilökunnalle näytteiden tallentamisesta ja käsittelystä, kliinisen ja kyselyaineiston poimimisesta sekä siitä, että naisille, joiden näytteet on talletettu, tarjotaan mahdollisuus opt-out-näytteiden käyttöön.