Lidský papilomavirus (HPV) a riziko prekancerózy a rakoviny děložního čípku

Karcinogenita 15 typů HPV s karcinogenním potenciálem se velmi liší. Chceme objasnit klinickou užitečnost testování karcinogenní HPV DNA u žen ve věku 21 let a starších pochopením jedinečných vlastností jednotlivých genotypů HPV pro virovou perzistenci a progresi. Konkrétně se snažíme porozumět načasování a determinantám virové clearance versus perzistence a vzhledem k perzistenci riziku progrese do CIN3/rakoviny (vyšší nebo rovné CIN3) u žen infikovaných každým typem karcinogenního genotypu HPV ve věku, kdy vzniká rakovina. Chybí relevantní přírodopisné údaje. Neexistují žádné NCI ani jiné kohorty, ve kterých by byly tyto a další otázky adekvátně řešeny.

Společnost Kaiser Permanente Northern California (KPNC) běžně používá test DNA genotypu HPV schválený FDA pro karcinogenní HPV (Hybrid Capture 2 [HC2], Qiagen Corporation, Gaithersburg, MD) jako doplněk k cytologii pro screening rakoviny děložního čípku u žen 30 a starší a jako třída pro okamžitou kolposkopii pro ženy s nejednoznačnými výsledky Pap v každém věku. Spolupracujeme s KPNC, abychom vytvořili karcinogenní HPV-pozitivní kohortu (HPV Perzistence a Progrese Kohorta nebo PaP Kohorta) pro zkoumání přirozené historie genotypů HPV. Konkrétně uložíme přibližně 60 000 základních vzorků z následujících dílčích populací: 1) přibližně 40 000 HPV pozitivních a náhodný vzorek populace 4 000 základních vzorků od žen ve věku 30 let a starších; 2) přibližně 5 000 HPV-orcytologicky pozitivních a náhodný vzorek populace 2 000 výchozích vzorků od žen ve věku 25-29 let; a 3) přibližně 5 000 HPV nebo cytologicky pozitivních a náhodný vzorek populace 2 000 výchozích vzorků od žen ve věku 21-24 let. Použijeme efektivní návrhy odběrů, abychom dosáhli vysokého výkonu s minimálními laboratorními analýzami, se vzorky vybranými k testování na základě klinických výsledků zjištěných napojením na Kaiserovy cytologické a histologické databáze a aktivní roční sledování všech HC2 pozitivních žen KPNC. Plánujeme „sledovat“ ženy po dobu tří let po jejich zápisu v letech 2007–2008 tím, že uložíme jejich zbytkové vzorky odebrané při jejich zpětných návštěvách; delší sledování by bylo pravděpodobně zkresleno rozsáhlou cenzurou kvůli léčbě.

Extrémně nízkonákladové načítání vzorků, počítačové sledování pomocí databází KPNC a pákové financování učiní tuto kohortu vysoce nákladově efektivní s navrhovaným rozpočtem 1 030 954 USD na 5 let. De novo náklady na screening této populace za účelem identifikace přibližně 50 000 HPV pozitivních žen 21 a starších, který provádí KPNC jako součást rutinního screeningu a pro nás zdarma, jsou přibližně 50 milionů USD. Další miliony stojí klinické sledování, cytologie a histologické diagnózy. Můžeme získat genotypizaci a testování variant bez nákladů na oddělení epidemiologie a genetiky rakoviny (DCEG), prostřednictvím spolupráce a výše uvedené dohody o spolupráci. Hlavní náklady spočívají v tom, že personál bude muset ušetřit a nakládat se vzorky, získat klinická data a data z dotazníků a nabídnout ženám, jejichž vzorky byly uloženy v bance, možnost neúčastnit se použití vzorků.