Wirus brodawczaka ludzkiego (HPV) a ryzyko stanu przedrakowego i raka szyjki macicy

Rakotwórczość 15 typów HPV o potencjale rakotwórczym jest bardzo zróżnicowana. Pragniemy wyjaśnić przydatność kliniczną rakotwórczych testów DNA HPV u kobiet w wieku 21 lat i starszych poprzez zrozumienie unikalnych właściwości poszczególnych genotypów HPV dla trwałości i progresji wirusa. W szczególności staramy się zrozumieć czas i determinanty klirensu wirusa w porównaniu z trwałością oraz, biorąc pod uwagę trwałość, ryzyko progresji do CIN3 / raka (większego lub równego CIN3) wśród kobiet zakażonych każdym typem rakotwórczego genotypu HPV w wieku, w którym występuje rak. Brakuje odpowiednich danych dotyczących historii naturalnej. Nie ma NCI ani innych kohort, w których te i inne pytania byłyby odpowiednio rozwiązywane.

Kaiser Permanente Północna Kalifornia (KPNC) rutynowo stosuje zatwierdzony przez FDA test DNA zbiorczego genotypu HPV w kierunku rakotwórczego HPV (Hybrid Capture 2 [HC2], Qiagen Corporation, Gaithersburg, MD) jako uzupełnienie cytologii w badaniach przesiewowych w kierunku raka szyjki macicy u kobiet w wieku 30 i starszych i jako segregacja do natychmiastowej kolposkopii dla kobiet z niejednoznacznymi wynikami cytologii w każdym wieku. Współpracujemy z KPNC w celu stworzenia rakotwórczej kohorty HPV-dodatniej (HPV Persistence and Progression Cohort lub PaP Cohort) do badania naturalnej historii genotypów HPV. W szczególności będziemy przechowywać około 60 000 próbek wyjściowych z następujących subpopulacji: 1) około 40 000 osób zakażonych wirusem HPV oraz losową próbkę populacji składającą się z 4 000 próbek wyjściowych od kobiet w wieku 30 lat i starszych; 2) około 5000 HPV-orcytolog-dodatnich i losowa populacja 2000 próbek wyjściowych od kobiet w wieku 25-29 lat; oraz 3) około 5000 HPV- lub cytologicznie dodatnich oraz losowa populacja 2000 próbek wyjściowych od kobiet w wieku 21-24 lat. Zastosujemy wydajne schematy pobierania próbek, aby osiągnąć wysoką moc przy minimalnych analizach laboratoryjnych, z próbkami wybranymi do badań na podstawie wyników klinicznych potwierdzonych przez powiązanie z bazami danych cytologii i histologii Kaiser oraz aktywnym rocznym monitoringiem KPNC wszystkich kobiet HC2-dodatnich. Planujemy „podążać” za kobietami przez trzy lata po ich zapisie w latach 2007-2008, bankując ich szczątkowe okazy zebrane podczas ich wizyt ponownych; dłuższa obserwacja prawdopodobnie byłaby obciążona przez obszerne cenzurowanie z powodu leczenia.

Niezwykle tanie gromadzenie próbek, skomputeryzowane monitorowanie przy użyciu baz danych KPNC i lewarowane finansowanie sprawią, że ta kohorta będzie bardzo opłacalna, z proponowanym budżetem w wysokości 1 030 954 USD w ciągu 5 lat. Koszt de novo badań przesiewowych tej populacji w celu zidentyfikowania około 50 000 kobiet zakażonych wirusem HPV w wieku 21 lat i starszych, które są wykonywane przez KPNC w ramach rutynowych badań przesiewowych i bez żadnych kosztów dla nas, wynosi około 50 milionów USD. Obserwacja kliniczna, cytologia i diagnozy histologiczne kosztują miliony więcej. Możemy uzyskać genotypowanie i testy wariantów bez ponoszenia kosztów przez Wydział Epidemiologii i Genetyki Nowotworów (DCEG), dzięki współpracy i wspomnianej umowie o współpracy. Główne koszty personelu związane są z przechowywaniem i obsługą próbek, ekstrakcją danych klinicznych i kwestionariuszowych oraz oferowaniem kobietom, których okazy zostały przechowane w banku, rezygnacji z ich wykorzystania.