Limakalvon geeniekspressiovirheet IBD:ssä

Infliksimabi, monoklonaalinen IgG1-vasta-aine tulehdusta edistävälle sytokiinituumorinekroositekijä-alfalle (TNF-α), oli ensimmäinen tehokas biologinen hoito IBD:lle. Infliksimabi paransi dramaattisesti IBD-potilaiden elämänlaatua. Sen lisäksi, että infliksimabi on indusoinut ja ylläpitänyt remissiota refraktorisilla IBD-potilailla, se on saavuttanut uusia hoitotavoitteita, kuten suolen limakalvon paranemista ja sairaalahoitojen ja leikkausten vähentämistä pitkällä aikavälillä. Jopa 30 % IBD-potilaista ei kuitenkaan reagoi tähän kalliiseen hoitoon ja mahdollisesti haitalliseen hoitoon, ja lisäksi 20-30 % vaste on epätäydellinen. Infliksimabiresistenssin mekanismia ei tunneta, eikä infliksimabivasteen ennustajia tällä hetkellä ole.

Tämän tutkimuksen tavoitteena oli tutkia aktiiviseen Crohnin tautiin (CD) ja haavaiseen paksusuolitulehdukseen (UC) liittyviä limakalvon geeniekspressiovirheitä sekä tutkia infliksimabin indusoiman tulehduksen ja limakalvon paranemisen vaikutusta näihin poikkeavuuksiin käyttämällä koko genomigeeniä. Expression microarray -tekniikka endoskooppisista johdetuista suolen limakalvobiopsioista kontrollihenkilöiltä ja potilailta, joilla on aktiivinen IBD, ja tämä ennen ensimmäistä infliksimabihoitoa ja sen jälkeen.

61 potilaalle, joilla on tulehduksellinen suolistosairaus, 19 Crohnin paksusuolitulehdusta, 18 Crohnin ileiittia ja 24 UC:tä sairastavaa potilasta, tehdään kolonoskopia ja biopsiat ennen ensimmäistä infliksimabihoitoa ja 4–6 viikkoa sen jälkeen. Infliksimabivaste määritettiin endoskooppisten ja histologisten löydösten perusteella. Mukaan otettiin myös 12 yksilön kontrolliryhmä. Kokonais-RNA eristettiin biopsioista, leimattiin ja hybridisoitiin Affymetrix HGU133plus2.0:aan. Array. Microarray-tiedot analysoitiin käyttämällä Bioconductor-ohjelmistoa ja Ingenuity Pathway Analysis -ohjelmistoa. Kvantitatiivista reaaliaikaista RT-PCR:ää ja immunohistokemiaa käytettiin mikrosirutietojen vahvistamiseen.