Geeniekspression profilointi ja rintasyöpäpotilaiden kudosten geneettinen analyysi

ENSISIJAISET TAVOITTEET:

1. Sen määrittämiseksi, liittyykö erbB-2:n monistuminen ja/tai yli-ilmentyminen joko lisä- tai vähemmän hyötyyn doksorubisiinin tai neljän paklitakselin syklin kasvamisesta.
2. Sen määrittämiseksi, liittyvätkö p53:n poikkeavuudet (mutaatiot, deleetiot, proteiinin stabiloituminen) joko ylimääräiseen vai pienempään hyötyyn doksorubisiinin kasvamisesta tai neljästä paklitakselisyklistä.
3. Vertaa erbB-2:n ja p53:n analyysimenetelmiä käyttämällä näiden biomarkkerien yleisimpiä määritysmenetelmiä, jotta voidaan määrittää, ennustaako yksi menetelmä kliinistä tulosta paremmin kuin toinen vai ovatko menetelmät toisiaan täydentäviä.
4. Tunnistaa biomarkkerit, joita voidaan käyttää yksilöllisesti räätälöimään adjuvanttiannostiheän hoidon käyttöä.
5. Tunnistaa potilasryhmät, joilla on huono ennuste adjuvanttikemoterapiasta huolimatta, ja joille tulisi suunnata uusia lähestymistapoja adjuvanttihoitoon.
6. Tunnistaa biomarkkerit, joita voidaan käyttää yksilöllisesti räätälöimään adjuvanttipaklitakselihoidon käyttöä.
7. Tunnistaa potilasryhmät, joiden ennuste on huono adjuvanttikemoterapiasta huolimatta, ja joille tulisi suunnata uusia lähestymistapoja adjuvanttihoitoon.
8. Sen määrittämiseksi, liittyykö PAM50-määrityksellä määritetty luontainen alatyyppi hyötyyn paklitakselista (C9344) ja annostiheästä kemoterapiasta (C9741) riippumatta kliinisestä estrogeenireseptorin (ER) ja ihmisen epidermaalisen kasvutekijän reseptorin 2 (HER2) tilasta.
9. Sen määrittämiseksi, liittyykö luontainen alatyyppi hyötyyn paklitakselista ja annostiheästä kemoterapiasta HER2-negatiivisilla osajoukoilla, kuten tämän protokollan osioissa B2 ja B3 täytetyssä HER2:n kudosmikrosiruanalyysissä (TMA) määritetään.
10. Sen määrittämiseksi, liittyykö PAM50-määrityksellä määritetty uusiutumispistemäärä paklitakselin ja annostiheän kemoterapian hyötyyn kliinisestä ER- ja HER2-tilasta riippumatta.
11. Sen määrittämiseksi, liittyykö uusiutumispisteisiin paklitakselin ja tiheän annoksen kemoterapian hyöty HER2-negatiivisessa alaryhmässä.
12. Arvioida PAM50:n määrittämän proliferaatiopistemäärän yhteyttä ja hyötyä paklitakselista ja annostiheästä kemoterapiasta.
13. Arvioida, hyötyvätkö potilaat, joilla on PAM50-testin perusteella perusrintasyöpä, paklitakselista.

TOISSIJAISET TAVOITTEET:

1. PAM50:n määrittelemien luontaisten alatyyppien suorituskyvyn vertaaminen tämän protokollan osioissa B2 ja B3 kehitettyihin vasta-ainepaneelin määrittämiin alatyyppidiagnooseihin HER2-negatiivisen alajoukon paklitakselin ja tiheän kemoterapian hyötyjen ennustamisessa.
2. Arvioida PAM50:n määrittämän relapsipistemäärän prognostinen arvo potilailla, jotka eivät saa paklitakselihoitoa (C9344).
3. Tutkia monimuuttujamallin suorituskykyä, mukaan lukien proliferaatiopisteet ja uusiutumisen riski, paklitakselin ja tiheän annoksen kemoterapian hyödyn ennustamisessa.

YHTEENVETO:

Formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin upotetut kudoslohkot analysoidaan erbB-2:n (HER-2/neu) monistumisen ja/tai yli-ilmentymisen ja p53:n mutaatioiden tai deleetioiden varalta fluoresoivalla in situ -hybridisaatiolla (FISH) ja immunohistokemialla.