Perfiles de expresión génica y análisis genético de tejidos de pacientes con cáncer de mama

OBJETIVOS PRINCIPALES:

1. Determinar si la amplificación y/o sobreexpresión de erbB-2 se asocia con un beneficio adicional o menor al aumentar las dosis de doxorrubicina o cuatro ciclos de paclitaxel.
2. Determinar si las anomalías en p53 (mutaciones, deleciones, estabilización de proteínas) se asocian con un beneficio adicional o menor al aumentar las dosis de doxorrubicina o cuatro ciclos de paclitaxel.
3. Comparar métodos de análisis de erbB-2 y p53, utilizando los medios más comunes de análisis de estos biomarcadores, para determinar si un método es más predictivo del resultado clínico que otro, o si los métodos son complementarios.
4. Identificar biomarcadores que puedan usarse para adaptar individualmente el uso de la terapia adyuvante de dosis densa.
5. Identificar grupos de pacientes que tienen un mal pronóstico, a pesar de la quimioterapia adyuvante, que deberían ser seleccionados prospectivamente para nuevos enfoques de tratamiento adyuvante.
6. Identificar biomarcadores que puedan usarse para adaptar individualmente el uso de la terapia adyuvante con paclitaxel.
7. Identificar grupos de pacientes que tienen un mal pronóstico a pesar de la quimioterapia adyuvante que deberían ser seleccionados prospectivamente para nuevos enfoques de tratamiento adyuvante.
8. Determinar si el subtipo intrínseco, según lo determinado por el ensayo PAM50, está asociado con el beneficio del paclitaxel (C9344) y de la quimioterapia de dosis densa (C9741) independientemente del estado clínico del receptor de estrógeno (ER) y del receptor 2 del factor de crecimiento epidérmico humano (HER2).
9. Determinar si el subtipo intrínseco se asocia con el beneficio del paclitaxel y de la quimioterapia de dosis densa en el subgrupo HER2 negativo, según lo definido por el análisis de micromatriz de tejido (TMA) de HER2 completado en las secciones B2 y B3 de este protocolo.
10. Determinar si la puntuación de recaída, según lo determinado por el ensayo PAM50, se asocia con el beneficio del paclitaxel y de la quimioterapia de dosis densa, independientemente del estado clínico de ER y HER2.
11. Determinar si la puntuación de recaída se asocia con el beneficio del paclitaxel y de la quimioterapia de dosis densa en el subgrupo HER2 negativo.
12. Evaluar la asociación de una puntuación de proliferación definida por PAM50 y el beneficio del paclitaxel y de la quimioterapia de dosis densa.
13. Evaluar si los pacientes identificados con cáncer de mama basal mediante el ensayo PAM50 se benefician del paclitaxel.

OBJETIVOS SECUNDARIOS:

1. Comparar el rendimiento de los subtipos intrínsecos definidos por PAM50 con los diagnósticos de subtipo determinados por el panel de anticuerpos, desarrollado en las secciones B2 y B3 de este protocolo, en la predicción del beneficio del paclitaxel y de la quimioterapia de dosis densa en el subconjunto HER2 negativo.
2. Evaluar el valor pronóstico de la puntuación de recaída definida por PAM50 en pacientes que no reciben tratamiento con paclitaxel (C9344).
3. Investigar el rendimiento de un modelo multivariable que incluye la puntuación de proliferación y el riesgo de recaída para predecir el beneficio del paclitaxel y de la quimioterapia en dosis densas.

DESCRIBIR:

Los bloques de tejido incluidos en parafina y fijados con formalina se analizan para la amplificación y/o sobreexpresión de erbB-2 (HER-2/neu) y para mutaciones o deleciones de p53 mediante hibridación fluorescente in situ (FISH) e inmunohistoquímica.