Genuttrycksprofilering och genetisk analys av vävnader från patienter med bröstcancer

PRIMÄRA MÅL:

1. För att avgöra om amplifiering och/eller överuttryck av erbB-2 är associerad med antingen ytterligare eller mindre nytta av ökade doser av doxorubicin eller fyra cykler av paklitaxel.
2. För att avgöra om abnormiteter i p53 (mutationer, deletioner, proteinstabilisering) är associerade med antingen ytterligare eller mindre nytta av ökande doser av doxorubicin eller fyra cykler av paklitaxel.
3. Att jämföra metoder för analys av erbB-2 och p53, med hjälp av de vanligaste metoderna för analys av dessa biomarkörer, för att avgöra om en metod är mer förutsägande av kliniskt utfall än en annan, eller om metoder är komplementära.
4. Att identifiera biomarkörer som kan användas för att individuellt skräddarsy användningen av adjuvant dos-tät terapi.
5. Att identifiera grupper av patienter som har en dålig prognos, trots adjuvant kemoterapi, som bör riktas prospektivt för nya tillvägagångssätt för adjuvant behandling.
6. För att identifiera biomarkörer som kan användas för att individuellt skräddarsy användningen av adjuvant paklitaxelterapi.
7. Att identifiera grupper av patienter som har en dålig prognos trots adjuvant kemoterapi som bör riktas prospektivt för nya tillvägagångssätt för adjuvant behandling.
8. För att avgöra om den inneboende subtypen, som fastställts med PAM50-analysen, är associerad med nytta av paklitaxel (C9344) och från dos-tät kemoterapi (C9741) oavsett status för klinisk östrogenreceptor (ER) och human epidermal tillväxtfaktorreceptor 2 (HER2).
9. För att avgöra om inneboende subtyp är associerad med nytta av paklitaxel och från dos tät kemoterapi i den HER2-negativa undergruppen, enligt definitionen av vävnadsmikroarray-analysen (TMA) av HER2 i avsnitt B2 och B3 i detta protokoll.
10. För att fastställa om återfallspoäng, som fastställts med PAM50-analysen, är associerad med nytta av paklitaxel och från dos-tät kemoterapi oavsett klinisk ER- och HER2-status.
11. För att avgöra om återfallspoäng är associerad med nytta av paklitaxel och från dos tät kemoterapi i den HER2-negativa undergruppen.
12. Att utvärdera sambandet mellan en PAM50-definierad proliferationspoäng och dra nytta av paklitaxel och från dos tät kemoterapi.
13. För att utvärdera om patienter som identifierats ha basal bröstcancer av PAM50-analysen drar nytta av paklitaxel.

SEKUNDÄRA MÅL:

1. Att jämföra prestandan för de PAM50-definierade inneboende subtyperna med subtypdiagnoserna som bestäms av antikroppspanelen, utvecklad i avsnitt B2 och B3 i detta protokoll, för att förutsäga nyttan av paklitaxel och från dos tät kemoterapi i den HER2-negativa undergruppen.
2. För att utvärdera det prognostiska värdet av den PAM50-definierade återfallspoängen hos patienter som inte får någon paklitaxelbehandling (C9344).
3. Att undersöka prestandan hos en multivariat modell inklusive proliferationspoäng och risk för återfall för att förutsäga nyttan av paklitaxel och från dos tät kemoterapi.

SKISSERA:

Formalinfixerade, paraffininbäddade vävnadsblock analyseras för amplifiering och/eller överuttryck av erbB-2 (HER-2/neu) och för mutationer eller deletioner av p53 genom fluorescerande in situ hybridisering (FISH) och immunhistokemi.