Genekspresjonsprofilering og genetisk analyse av vev fra pasienter med brystkreft

PRIMÆRE MÅL:

1. For å bestemme om amplifikasjon og/eller overekspresjon av erbB-2 er assosiert med enten ytterligere eller mindre fordel av økende doser av doksorubicin eller fire sykluser med paklitaksel.
2. For å bestemme om abnormiteter i p53 (mutasjoner, slettinger, proteinstabilisering) er assosiert med enten ytterligere eller mindre fordel av økende doser av doksorubicin eller fire sykluser av paklitaksel.
3. For å sammenligne analysemetoder av erbB-2 og p53, ved å bruke de vanligste metodene for å analysere disse biomarkørene, for å finne ut om en metode er mer prediktiv for klinisk utfall enn en annen, eller om metodene er komplementære.
4. For å identifisere biomarkører som kan brukes til å individuelt skreddersy bruken av adjuvant dosetett terapi.
5. Å identifisere grupper av pasienter som har en dårlig prognose, til tross for adjuvant kjemoterapi, som bør være prospektivt målrettet for nye tilnærminger til adjuvant behandling.
6. For å identifisere biomarkører som kan brukes til å individuelt skreddersy bruken av adjuvant paklitakselbehandling.
7. Å identifisere grupper av pasienter som har en dårlig prognose til tross for adjuvant kjemoterapi som bør være prospektivt målrettet for nye tilnærminger til adjuvant behandling.
8. For å avgjøre om den iboende subtypen, som bestemt ved PAM50-analyse, er assosiert med fordel av paklitaksel (C9344) og fra dosetett kjemoterapi (C9741) uavhengig av klinisk østrogenreseptor (ER) og human epidermal vekstfaktorreseptor 2 (HER2) status.
9. For å avgjøre om egen subtype er assosiert med fordeler fra paklitaksel og fra dosetett kjemoterapi i den HER2-negative undergruppen, som definert av vevsmikroarray-analysen (TMA) av HER2 fullført i avsnitt B2 og B3 i denne protokollen.
10. For å bestemme om tilbakefallsscore, som bestemt ved PAM50-analyse, er assosiert med fordeler fra paklitaksel og fra dosetett kjemoterapi uavhengig av klinisk ER og HER2-status.
11. For å bestemme om tilbakefallsscore er assosiert med nytte av paklitaksel og fra dosetett kjemoterapi i den HER2-negative undergruppen.
12. For å evaluere sammenhengen mellom en PAM50-definert spredningsscore og fordel av paklitaksel og fra dosetett kjemoterapi.
13. For å evaluere om pasienter identifisert som å ha basal brystkreft av PAM50-analysen har nytte av paklitaksel.

SEKUNDÆRE MÅL:

1. For å sammenligne ytelsen til de PAM50-definerte iboende subtypene med subtypediagnosene bestemt av antistoffpanelet, utviklet i seksjoner B2 og B3 i denne protokollen, for å forutsi fordelene fra paklitaksel og fra dosetett kjemoterapi i den HER2-negative undergruppen.
2. For å evaluere den prognostiske verdien av den PAM50-definerte tilbakefallsskåren hos pasienter som ikke får paklitakselbehandling (C9344).
3. For å undersøke ytelsen til en multivariat modell inkludert spredningsscore og risiko for tilbakefall i å forutsi nytte av paklitaksel og fra dosetett kjemoterapi.

OVERSIKT:

Formalinfikserte, parafininnstøpte vevsblokker analyseres for amplifikasjon og/eller overekspresjon av erbB-2 (HER-2/neu) og for mutasjoner eller delesjoner av p53 ved fluorescerende in situ hybridisering (FISH) og immunhistokjemi.