Профилирование экспрессии генов и генетический анализ тканей пациентов с раком молочной железы

ОСНОВНЫЕ ЦЕЛИ:

1. Определить, связана ли амплификация и/или сверхэкспрессия erbB-2 с дополнительным или меньшим эффектом от увеличения доз доксорубицина или четырех циклов паклитаксела.
2. Определить, связаны ли аномалии р53 (мутации, делеции, стабилизация белка) с дополнительной или меньшей пользой от увеличения доз доксорубицина или четырех циклов паклитаксела.
3. Сравнить методы анализа erbB-2 и p53, используя наиболее распространенные способы анализа этих биомаркеров, чтобы определить, является ли один метод более предсказательным для клинического исхода, чем другой, или методы дополняют друг друга.
4. Определить биомаркеры, которые можно использовать для индивидуального подбора адъювантной терапии с высокой плотностью доз.
5. Выявить группы пациентов с неблагоприятным прогнозом, несмотря на адъювантную химиотерапию, которых следует проспективно нацелить на новые подходы к адъювантной терапии.
6. Определить биомаркеры, которые можно использовать для индивидуального подбора адъювантной терапии паклитакселом.
7. Выявить группы пациентов с неблагоприятным прогнозом, несмотря на адъювантную химиотерапию, которых следует проспективно нацелить на новые подходы к адъювантной терапии.
8. Определить, связан ли внутренний подтип, определенный с помощью анализа PAM50, с пользой от паклитаксела (C9344) и химиотерапии с плотной дозой (C9741) независимо от клинического состояния рецептора эстрогена (ER) и рецептора 2 эпидермального фактора роста человека (HER2).
9. Определить, связан ли внутренний подтип с пользой паклитаксела и химиотерапии с плотной дозой в HER2-отрицательном подмножестве, как определено анализом HER2 с помощью тканевого микрочипа (TMA), выполненным в разделах B2 и B3 этого протокола.
10. Определить, связана ли оценка рецидива, определенная с помощью анализа PAM50, с пользой паклитаксела и химиотерапии с плотной дозой независимо от клинического статуса ER и HER2.
11. Определить, связана ли оценка рецидива с пользой паклитаксела и химиотерапии с плотной дозой в HER2-отрицательной подгруппе.
12. Оценить взаимосвязь показателя пролиферации, определяемого PAM50, и преимущества паклитаксела и химиотерапии с высокой дозой.
13. Оценить, дает ли паклитаксел пользу пациентам, у которых с помощью анализа PAM50 выявлен базальный рак молочной железы.

ВТОРИЧНЫЕ ЦЕЛИ:

1. Сравнить характеристики внутренних подтипов, определяемых PAM50, с диагнозами подтипов, определенными панелью антител, разработанной в разделах B2 и B3 этого протокола, при прогнозировании пользы от паклитаксела и химиотерапии с высокой дозой в HER2-отрицательном подмножестве.
2. Оценить прогностическое значение оценки рецидива по шкале PAM50 у пациентов, не получавших терапию паклитакселом (C9344).
3. Исследовать эффективность многофакторной модели, включающей показатель пролиферации и риск рецидива, для прогнозирования пользы от паклитаксела и химиотерапии с высокой дозой.

КОНТУР:

Фиксированные формалином и залитые парафином блоки тканей анализируют на амплификацию и/или сверхэкспрессию erbB-2 (HER-2/neu) и на мутации или делеции p53 с помощью флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) и иммуногистохимии.