Profilage de l'expression génique et analyse génétique des tissus de patientes atteintes d'un cancer du sein

OBJECTIFS PRINCIPAUX:

1. Déterminer si l'amplification et/ou la surexpression de erbB-2 est associée à un bénéfice supplémentaire ou moindre de doses croissantes de doxorubicine ou de quatre cycles de paclitaxel.
2. Déterminer si les anomalies de p53 (mutations, délétions, stabilisation des protéines) sont associées à un bénéfice supplémentaire ou moindre de l'augmentation des doses de doxorubicine ou de quatre cycles de paclitaxel.
3. Comparer les méthodes d'analyse de erbB-2 et p53, en utilisant les moyens les plus courants de dosage de ces biomarqueurs, afin de déterminer si une méthode est plus prédictive du résultat clinique qu'une autre, ou si les méthodes sont complémentaires.
4. Identifier les biomarqueurs qui peuvent être utilisés pour adapter individuellement l'utilisation d'un traitement adjuvant à dose dense.
5. Identifier les groupes de patients qui ont un mauvais pronostic, malgré une chimiothérapie adjuvante, qui devraient être prospectivement ciblés pour de nouvelles approches de traitement adjuvant.
6. Identifier les biomarqueurs qui peuvent être utilisés pour adapter individuellement l'utilisation du traitement adjuvant au paclitaxel.
7. Identifier les groupes de patients qui ont un mauvais pronostic malgré une chimiothérapie adjuvante et qui devraient être ciblés de manière prospective pour de nouvelles approches de traitement adjuvant.
8. Déterminer si le sous-type intrinsèque, tel que déterminé par le test PAM50, est associé au bénéfice du paclitaxel (C9344) et de la chimiothérapie à haute dose (C9741) quel que soit le statut clinique du récepteur des œstrogènes (RE) et du récepteur 2 du facteur de croissance épidermique humain (HER2).
9. Déterminer si le sous-type intrinsèque est associé au bénéfice du paclitaxel et de la chimiothérapie à dose dense dans le sous-ensemble HER2 négatif, tel que défini par l'analyse des microréseaux tissulaires (TMA) de HER2 complétée dans les sections B2 et B3 de ce protocole.
10. Déterminer si le score de rechute, tel que déterminé par le test PAM50, est associé au bénéfice du paclitaxel et de la chimiothérapie à dose dense, quel que soit le statut clinique ER et HER2.
11. Déterminer si le score de rechute est associé au bénéfice du paclitaxel et de la chimiothérapie à dose dense dans le sous-ensemble HER2 négatif.
12. Évaluer l'association d'un score de prolifération défini par PAM50 et du bénéfice du paclitaxel et de la chimiothérapie à haute dose.
13. Évaluer si les patientes identifiées comme ayant un cancer du sein basal par le test PAM50 bénéficient du paclitaxel.

OBJECTIFS SECONDAIRES :

1. Comparer les performances des sous-types intrinsèques définis par PAM50 avec les diagnostics de sous-type déterminés par le panel d'anticorps, développés dans les sections B2 et B3 de ce protocole, pour prédire le bénéfice du paclitaxel et de la chimiothérapie à dose dense dans le sous-ensemble HER2 négatif.
2. Évaluer la valeur pronostique du score de rechute défini par PAM50 chez les patients ne recevant aucun traitement au paclitaxel (C9344).
3. Étudier la performance d'un modèle multivarié incluant le score de prolifération et le risque de rechute pour prédire le bénéfice du paclitaxel et de la chimiothérapie à haute dose.

CONTOUR:

Des blocs de tissus fixés au formol et inclus en paraffine sont analysés pour l'amplification et/ou la surexpression de erbB-2 (HER-2/neu) et pour les mutations ou les délétions de p53 par hybridation fluorescente in situ (FISH) et immunohistochimie.