Genomiikkaan perustuvan ennusteen validointi vakavassa traumassa

Erityinen tavoite: Prospektiivinen validointi nopea genomitesti, joka on saatu vakavasti traumatisoituneiden potilaiden veren leukosyyttien alapopulaatiosta ensimmäisten 24 tunnin aikana vastaanottoon pääsyn jälkeen, jota voidaan käyttää sellaisten potilaiden erottamiseen, joilla on monimutkainen kliininen kehityskulku ja jotka siksi olisivat hyviä ehdokkaita interventio-, immunomodulatorisiin hoitoihin.

Vakavan tylpän traumaattisen vamman jälkeen ja toipumisen aikana tapahtuu muutoksia leukosyyttitranskriptomissa. Siten ehdotamme, että validoidun 63 kokonaisleukosyytti- tai 181 PMN-geenin ilmentymiseen perustuvaa leukosyyttitranskriptomisignaalia voidaan käyttää sellaisten potilaiden tunnistamiseen, joilla on monimutkaisen kliinisen lopputuloksen riski, joko yksinään tai yhdistettynä anatomisiin tai fysiologisiin ennustajiin. Tämän kliinisen tutkimuksen tavoitteena on vahvistaa tämän transkriptioon perustuvan ennusteen ennustekyky.

Tämä on ei-interventiotutkimus, jossa on mukana 200 vakavasti loukkaantunutta potilasta, joilla on tylppä trauma, ja 40 tervettä vapaaehtoista. Osallistumiskriteerit ovat samat kuin viimeiset kahdeksan vuotta Liima-apurahan yhteydessä. Vakavasti tylppälle vammautuneille potilaille, jotka täyttävät sisällyttämiskriteerit, suoritetaan nopea leukosyyttigenomiseulonta vastaanoton yhteydessä ja seuraavana aamuna (~24 tuntia). Lisäverinäytteitä kerätään 4, 7, 14, 21 ja 28 vuorokauden kohdalla tai niin kauan kuin potilaat ovat trauma- tai kirurgisen tehohoidon osastolla pankkisiirtoa varten.

Neljän vuoden aikana otamme mukaan 240 ainetta Floridan yliopistosta ja Washingtonin yliopistosta Harborview Medical Centerissä. Traumapotilailla verinäytteitä otetaan vastaanoton yhteydessä päivinä 1, 4, 7, 14, 21 ja 28 tai teho-osastolta kotiutumiseen tai kuolemaan asti. Jokaisena ajankohtana kerätään yhteensä 4–5 ml verta. Terveiltä vapaaehtoisilta otetaan kertaluonteinen verinäyte.

Seulonta ja suostumus: Tutkimushenkilöstö tunnistaa traumapotilaat päivystykseen. Potilaalta tai lailliselta lähiomaiselta pyydetään suostumus 96 tunnin kuluessa, jos potilas täyttää pääsyvaatimukset. Pyydämme viivästynyttä suostumusta tästä potilasjoukosta 96 tuntia vammojen vakavuuden, potilaan haavoittuvuuden tämän varhaisen ajan ja potilaan laillisten edustajien tavoittamisen vuoksi. Jos tietoista suostumusta ei saada 96 tunnin kuluessa, kaikki verinäytteet ja kerätyt tiedot hylätään.

Terveet vapaaehtoistyöntekijät tunnistetaan suuresta väestöstä asianomaisiin yliopistoihin lähetettävien mainoslehtisten avulla. Esitteissä on laboratorioiden yhteystiedot. Terveet koehenkilöt seulotaan mukaanotto-/poissulkemiskriteerien mukaan, kun he ovat yhteydessä niihin. Jos osallistumisen kannalta on tarkoituksenmukaista, koehenkilöä kuullaan suostumuksen saamiseksi.

Tarvittaessa verta kerätään olemassa olevasta sisäänkäynnistä tai laskimopunktiolla. Veri asetetaan viipymättä jäälle ja siirretään laboratorioon, jossa siitä käsitellään solulysaatteja ja plasmaa.

Kaikki muut asiaankuuluvat kliiniset tiedot ja hemodynaamiset mittaukset kerätään päivittäin, kun potilas on sairaalahoidossa.

• Demografiset tiedot.
• Aiemmat ja nykyiset potilastiedot
• Laboratorio-, mikrobiologia- ja kaikki muut testitulokset
• Röntgen-, CT-, MRI-, US- ja kaikkien muiden kuvantamistestien tulokset
• Kirjaa kaikista sisäänpääsyn aikana saaduista lääkkeistä
• Kirjaaminen fyysiseen kokeeseen pääsyn aikana
• Kirjaa kaikki elintoiminnot ja hemodynaaminen seuranta sisäänpääsyn aikana
• Kirjaa kaikista toimenpiteistä tai interventioista sisäänpääsyn aikana
• Tiedot kaikista toimenpiteistä tai interventioista sairaalahoidon aikana
• Tila poisto- ja purkulaitoksessa

Kumpikin kahdesta kliinisestä toimipaikasta on vastuussa kliinisen tiedon keräämisestä ja tallentamisesta. Kliinisen tiedon keräämiseen käytetään REDCapia (Research Electronic Data Capture). Se on turvallinen, verkkopohjainen sovellus, joka on suunniteltu tukemaan perinteisiä tapausraporttien tietojen talteenottoa. Washingtonin yliopiston Harborview Medical Centerissä saadut solulysaatit toimitetaan Floridan yliopistoon genomianalyysejä varten, kun taas Floridan yliopiston Shandsin sairaalassa kerätyt plasmanäytteet lähetetään Washingtonin yliopistoon Luminex™:n sytokiinianalyysejä varten. . Vuosittain tapahtuu sähköisiä tiedonsiirtoja Floridan yliopistosta Washingtonin yliopistoon sekä tunnistamattomista, koodatuista kliinisistä tiedoista että sytokiini- ja genomitiedoista.

Tutkimukseen liittyvät verikokeet tehdään sängyn vieressä kliinisen hoidon standardien mukaisella tavalla tai laboratorioissamme terveille vapaaehtoisille. Tutkimukseen liittyvissä verinäytteessä käytetyt putket merkitään yksilöllisellä tutkimusnumerolla, eikä niissä ole potilastunnistetta. Ainut, joka yhdistää yksilöllisen potilasnumeron ja potilaiden henkilökohtaiset tunnisteet, tallennetaan salasanalla suojattuun ja salattuun tiedostoon, ja se on vain PI:n ja tutkimusryhmän käytettävissä. Kaikki potilaiden keräämät kliiniset tiedot tallennetaan kaappiin, joka sijaitsee PI:n tai tutkimusryhmän toimistossa. Tietojen tallentamiseen käytettävä tietokone sijoitetaan PI:n tai tutkimushenkilöstön toimistoon, joka on aina lukittu. Tietokone on suojattu salasanalla ja salattu.

Olemme perustaneet arviomme koehenkilöiden lukumäärästä alustavaan tietokokoelmaamme 1637 vakavan trauman kohteena olevasta henkilöstä. Tuossa tutkimuksessa 1637 koehenkilöstä 31 prosentilla eli 507 potilaalla toipumisaika oli alle viisi päivää, ja heillä voitiin todeta olevan mutkaton lopputulos. Sitä vastoin 442 potilaalla eli 27 prosentilla oli monimutkainen lopputulos, joka määriteltiin joko myöhäisellä kuolemalla tai yli 14 päivää kestäneen MOF:n perusteella. Olettaen, että monimutkaisia ​​ja komplisoitumattomia potilaita on samanlainen esiintymistiheys 200 koehenkilössä, odotamme, että 62 näistä koehenkilöistä kotiutetaan 5 päivän sisällä ilman elinvaurioita ja 54 koehenkilöllä on pitkittynyt elimen vajaatoiminta ja/tai myöhäinen kuolema. Nämä luvut ovat selvästi näiden eri mallien tilastolliseen validointiin vaadittavien rajojen sisällä.

Odotamme, että yleinen suostumusprosenttimme tähän havainnointitutkimukseen, jossa riski on minimaalinen, on 75 %, mikä tarkoittaa, että saavuttaaksemme 25 traumapotilaan kertymisasteen jokaisessa laitoksessa vuodessa, meillä on oltava 34 koehenkilöä vuodessa, jotka täyttävät pääsykriteerit. Emme odota vaikeuksia kerätä näitä 200 aihetta neljän vuoden aikana osallistuvissa kohteissa. Molemmat ovat tason 1 traumakeskuksia, joilla on liikaa kapasiteettia suorittaa ehdotetut tutkimukset.

Tässä protokollassa ainoa tutkimuskohtainen interventio on veren kerääminen. Veren ottamisen riskeihin kuuluu epämukavuus pistokohdassa; mahdollinen mustelma ja turvotus pistokohdan ympärillä; harvoin infektio; ja harvoin pyörtyminen toimenpiteestä. Yksityisyyden loukkaus kielletään käyttämällä koodausta kaikille kerätyille tiedoille ja näytteille.

Opiskeluaineiden osallistumisesta ei ole suoria etuja. Tämä tutkimus voi hyödyttää yhteiskuntaa tulevaisuudessa. Tämä tutkimus voi jonakin päivänä johtaa uusiin testeihin tai hoitoihin tai auttaa ehkäisemään tai parantamaan sairauksia. PI:llä tai osatutkijalla ei ole eturistiriitaa.