Validace prognostiky založené na genomice u těžkého traumatu

Specifický cíl: Prospektivně ověřit rychlý genomický test získaný ze subpopulace krevních leukocytů těžce traumatizovaných pacientů během prvních 24 hodin po přijetí, který může být použit k rozlišení těch pacientů, kteří budou mít komplikovanou klinickou trajektorii a byli by proto dobrými kandidáty pro intervenční, imunomodulační terapie.

Po těžkém tupém traumatickém poranění a během zotavování dochází ke změnám v transkriptomu leukocytů. Navrhujeme tedy, aby signál transkriptomu leukocytů založený na expresi ověřených genů 63 celkových leukocytů nebo 181 PMN mohl být použit k identifikaci pacientů, kteří jsou ohroženi komplikovaným klinickým výsledkem, buď samostatně, nebo v kombinaci s anatomickými nebo fyziologickými prediktory. Cílem této klinické studie je ověřit prediktivní schopnost této prognostiky založené na transkriptomu.

Jedná se o neintervenční observační studii 200 těžce zraněných pacientů s tupým traumatem a 40 zdravých dobrovolníků. Vstupní kritéria budou stejná, jaká byla používána posledních osm let u grantu Glue Grant. Pacienti s těžkým tupým poraněním, kteří splňují kritéria pro zařazení, podstoupí rychlý leukocytární genomický screening při přijetí a následující ráno (~24 hodin). Další vzorky krve budou odebírány za 4, 7, 14, 21 a 28 dnů, nebo dokud budou pacienti na traumatologické nebo chirurgické jednotce intenzivní péče, pro bankovnictví.

Během čtyřletého období přihlásíme 240 subjektů z University of Florida a z University of Washington v Harborview Medical Center. U pacientů s traumatem budou vzorky krve odebírány při příjmu, 1., 4., 7., 14., 21. a 28. den nebo do propuštění z JIP nebo do smrti. V každém časovém bodě bude odebráno celkem 4 až 5 ml krve. U zdravých dobrovolníků bude odebrán jednorázový vzorek krve.

Screening a souhlas: Pacienti s traumatem budou identifikováni personálem studie po prezentaci na pohotovosti. Subjekt nebo právní nejbližší příbuzní budou požádáni o souhlas do 96 hodin, pokud pacient splní vstupní kritéria. V této populaci pacientů žádáme o opožděný souhlas po dobu 96 hodin kvůli závažnosti zranění, zranitelnosti pacienta v této rané době a obtížnosti oslovit zákonné zástupce pacienta. Pokud nebude informovaný souhlas získán do 96 hodin, všechny vzorky krve a shromážděné údaje budou vyřazeny.

Zdravé dobrovolné subjekty budou identifikovány z běžné populace prostřednictvím reklamních letáků vyvěšených na příslušných univerzitách. Letáky budou obsahovat kontaktní informace na laboratoře. Zdraví jedinci budou po kontaktu vyšetřeni podle kritérií pro zařazení/vyloučení. Je-li to vhodné pro účast, bude subjekt konzultován se souhlasem.

Krev bude odebrána ze stávajícího přístupu nebo v případě potřeby venepunkcí. Krev bude okamžitě umístěna na led a přenesena do laboratoře, kde bude zpracována na buněčné lyzáty a plazmu.

Všechna další relevantní klinická data a hemodynamická měření budou shromažďována denně během hospitalizace pacienta.

• Demografická informace.
• Minulé a současné lékařské záznamy
• Výsledky laboratoří, mikrobiologie a všech ostatních testů
• Výsledky rentgenových, CT, MRI, US a všech dalších zobrazovacích testů
• Záznamy o všech lécích přijatých během přijetí
• Záznamy o fyzické zkoušce při přijetí
• Záznamy všech vitálních funkcí a monitorování hemodynamiky při příjmu
• Záznamy o jakémkoli postupu nebo zásahu během příjmu
• Záznamy o jakémkoli postupu nebo zásahu během přijetí do nemocnice
• Stav na vypouštěcím a vypouštěcím zařízení

Každé ze dvou klinických pracovišť ponese odpovědnost za sběr a uchovávání klinických dat. Pro sběr klinických dat bude využito REDCap (Research Electronic Data Capture). Jedná se o bezpečnou webovou aplikaci navrženou tak, aby podporovala tradiční sběr dat z formulářů případových zpráv. Buněčné lyzáty získané na University of Washington-Harborview Medical Center budou odeslány na University of Florida pro genomické analýzy, zatímco vzorky plazmy odebrané v Shands Hospital na University of Florida budou odeslány na University of Washington pro analýzu cytokinů pomocí Luminex™. . V ročních intervalech budou probíhat elektronické přenosy dat z University of Florida na University of Washington, a to jak neidentifikovatelných, kódovaných klinických dat, tak dat o cytokinech a genomu.

Odběry krve související se studií budou prováděny u lůžka způsobem kompatibilním se standardem klinické péče nebo v našich laboratořích pro zdravé dobrovolníky. Zkumavky použité pro odběry krve související se studií budou označeny jedinečným číslem studie a neponesou žádný identifikátor pacienta. Klíč spojující jedinečné číslo pacienta a osobní identifikátory pacientů bude uložen v heslem chráněném a zašifrovaném souboru a bude přístupný pouze PI a výzkumnému týmu. Všechna shromážděná klinická data pacienta budou uložena ve skříni, která se nachází v kanceláři PI nebo výzkumného týmu. Počítač používaný pro ukládání dat bude umístěn v kanceláři PI nebo výzkumného personálu, která je vždy uzamčena. Počítač bude chráněn heslem a šifrován.

Naše hodnocení počtu subjektů jsme založili na našem předběžném souboru dat od 1637 subjektů s těžkým traumatem. V této studii z 1637 subjektů mělo 31 % nebo 507 pacientů čas do zotavení méně než pět dní a bylo možné identifikovat, že mají nekomplikovaný výsledek. Naproti tomu 442 pacientů nebo 27 % mělo komplikovaný výsledek, definovaný buď pozdním úmrtím, nebo MOF trvajícím déle než 14 dní. Za předpokladu podobné frekvence komplikovaných a nekomplikovaných pacientů u 200 subjektů bychom očekávali, že 62 z těchto subjektů bude propuštěno do 5 dnů bez poškození orgánů a 54 subjektů bude mít prodloužené orgánové selhání a/nebo pozdní smrt. Tato čísla jsou dobře v rozmezích požadovaných pro statistické ověření těchto různých modelů.

Očekáváme, že naše celková míra souhlasu s touto observační studií s minimálním rizikem bude 75 %, což znamená, že abychom dosáhli narůstající míry 25 subjektů s traumatem za rok v každé instituci, budeme muset mít 34 subjektů za rok splňující vstupní kritéria. Neočekáváme žádné potíže při získávání těchto 200 subjektů během čtyřletého období na zúčastněných místech. Obě jsou traumatologická centra úrovně 1, která mají nadbytečnou kapacitu pro dokončení navrhovaných studií.

V tomto protokolu bude jediným specifickým zásahem studie odběr krve. Rizika odběru krve ze žíly zahrnují nepohodlí v místě vpichu; možné modřiny a otoky kolem místa vpichu; zřídka infekce; a vzácně mdloba z procedury. Narušení soukromí bude negováno použitím kódování pro všechna shromážděná data a vzorky.

Neexistují žádné přímé výhody pro účast ve studijních předmětech. Tento výzkum může být pro společnost v budoucnu přínosem. Tato studie může jednoho dne vyústit v nové testy nebo léčby nebo může pomoci při prevenci nebo léčbě nemocí. U hlavního výzkumného pracovníka nebo dílčího vyšetřovatele neexistuje žádný střet zájmů.