Una convalida di una prognosi basata sulla genomica nel trauma grave

Obiettivo specifico: convalidare in modo prospettico un test genomico rapido ottenuto da una sottopopolazione di leucociti del sangue di pazienti gravemente traumatizzati nelle prime 24 ore dopo il ricovero, che possa essere utilizzato per discriminare quei pazienti che avranno una complicata traiettoria clinica e sarebbero, quindi, buoni candidati per terapie interventistiche e immunomodulatorie.

A seguito di gravi lesioni traumatiche contusive e durante il recupero, si verificano alterazioni nel trascrittoma leucocitario. Pertanto, proponiamo che un segnale del trascrittoma leucocitario basato sull'espressione dei 63 leucociti totali convalidati o dei 181 geni PMN possa essere utilizzato per identificare i pazienti che sono a rischio di un esito clinico complicato, da solo o in combinazione con predittori anatomici o fisiologici. L'obiettivo di questo studio clinico è convalidare la capacità predittiva di questo prognostico basato sul trascrittoma.

Questo è uno studio osservazionale non interventistico su 200 pazienti gravemente feriti con trauma contusivo e 40 volontari sani. I criteri di ammissione saranno gli stessi utilizzati negli ultimi otto anni con il Glue Grant. I pazienti con lesioni contusive gravi che soddisfano i criteri di inclusione saranno sottoposti a rapido screening genomico dei leucociti al momento del ricovero e la mattina seguente (~ 24 ore). Ulteriori campioni di sangue verranno raccolti a 4, 7, 14, 21 e 28 giorni, o finché i pazienti si trovano nell'unità di terapia intensiva traumatologica o chirurgica, per la banca.

In un periodo di quattro anni, inseriremo 240 soggetti dall'Università della Florida e dall'Università di Washington presso l'Harborview Medical Center. Nei soggetti traumatizzati, i campioni di sangue verranno raccolti al momento del ricovero, giorni 1, 4, 7, 14, 21 e 28, o fino alla dimissione dalla terapia intensiva o alla morte. Verrà raccolto un totale di 4-5 ml di sangue in ogni punto temporale. Nei volontari sani, verrà raccolto un campione di sangue una tantum.

Screening e consenso: I pazienti traumatizzati saranno identificati dal personale dello studio dopo la presentazione al pronto soccorso. Il soggetto o il parente prossimo legale verrà contattato per il consenso entro 96 ore se il paziente soddisfa i criteri di ammissione. Chiediamo un consenso ritardato in questa popolazione di pazienti per 96 ore a causa della gravità delle lesioni, della natura vulnerabile del paziente in questo primo momento e della difficoltà nel raggiungere i rappresentanti legali del paziente. Se il consenso informato non viene ottenuto entro 96 ore, tutti i campioni di sangue e i dati raccolti verranno eliminati.

I soggetti volontari sani saranno individuati dalla popolazione generale mediante volantini pubblicitari affissi presso le rispettive università. I volantini forniranno le informazioni di contatto per i laboratori. I soggetti sani saranno sottoposti a screening tramite criteri di inclusione/esclusione al momento del contatto. Se opportuno per la partecipazione, il soggetto sarà consultato per il consenso.

Il sangue verrà raccolto dall'accesso esistente o mediante venopuntura, se necessario. Il sangue verrà prontamente posto sul ghiaccio e trasferito al laboratorio dove verrà processato per lisati cellulari e plasma.

Tutti gli altri dati clinici rilevanti e le misurazioni emodinamiche saranno raccolti quotidianamente mentre il paziente è ricoverato in ospedale.

• Informazione demografica.
• Cartelle cliniche passate e presenti
• Laboratorio, microbiologia e tutti gli altri risultati dei test
• Raggi X, TC, risonanza magnetica, US e tutti gli altri risultati dei test di imaging
• Registrazioni su qualsiasi farmaco ricevuto durante il ricovero
• Registrazioni dell'esame fisico durante l'ammissione
• Registrazioni di tutti i segni vitali e monitoraggio emodinamico durante il ricovero
• Registrazioni di qualsiasi procedura o intervento durante il ricovero
• Registrazioni di qualsiasi procedura o intervento durante il ricovero ospedaliero
• Condizione presso l'impianto di scarico e scarico

Ciascuno dei due siti clinici manterrà la responsabilità della raccolta e della conservazione dei dati clinici. REDCap (Research Electronic Data Capture) sarà utilizzato per la raccolta dei dati clinici. Si tratta di un'applicazione sicura basata sul Web progettata per supportare l'acquisizione di dati da moduli di case report tradizionali. I lisati cellulari ottenuti presso l'Università di Washington-Harborview Medical Center saranno spediti all'Università della Florida per le analisi genomiche, mentre i campioni di plasma raccolti presso lo Shands Hospital dell'Università della Florida saranno spediti all'Università di Washington per le analisi delle citochine mediante Luminex™ . A intervalli annuali, si verificheranno trasferimenti elettronici di dati dall'Università della Florida all'Università di Washington sia di dati clinici non identificabili e codificati che di citochine e dati genomici.

I prelievi di sangue relativi allo studio verranno eseguiti al capezzale in modo compatibile con lo standard di cura clinica o nei nostri laboratori per volontari sani. Le provette utilizzate per i prelievi di sangue relativi allo studio saranno etichettate con il numero univoco dello studio e non riporteranno alcun identificativo del paziente. La chiave che collega il numero univoco del paziente e gli identificatori personali del paziente sarà archiviata in un file protetto da password e crittografato e sarà accessibile solo al PI e al gruppo di ricerca. Tutti i dati clinici raccolti dal paziente verranno archiviati in un armadio che si trova nell'ufficio del PI o del gruppo di ricerca. Il computer utilizzato per la conservazione dei dati sarà collocato presso l'ufficio del PI o del personale di ricerca sempre chiuso a chiave. Il computer sarà protetto da password e crittografato.

Abbiamo basato la nostra valutazione per il numero di soggetti sul nostro set di dati preliminari di 1637 soggetti con traumi gravi. In quello studio, dei 1637 soggetti, il 31% o 507 pazienti ha avuto un tempo di guarigione inferiore a cinque giorni e potrebbe essere identificato come avente un esito non complicato. Al contrario, 442 pazienti o il 27% hanno avuto un esito complicato, come definito da morte tardiva o MOF di durata superiore a 14 giorni. Assumendo una frequenza simile di pazienti complicati e non complicati nei 200 soggetti, ci aspetteremmo che 62 di questi soggetti vengano dimessi entro 5 giorni senza danno d'organo e che 54 soggetti abbiano un'insufficienza d'organo prolungata e/o morte tardiva. Questi numeri sono ben all'interno degli intervalli richiesti per la convalida statistica di questi diversi modelli.

Prevediamo che il nostro tasso di consenso complessivo per questo studio osservazionale con rischio minimo sarà del 75%, il che significa che per raggiungere un tasso di accumulo di 25 soggetti traumatizzati all'anno in ciascuna istituzione, dovremo avere 34 soggetti all'anno che soddisfano i criteri di ammissione. Non ci aspettiamo alcuna difficoltà nell'accumulare questi 200 soggetti in un periodo di quattro anni presso i siti partecipanti. Sono entrambi centri traumatologici di livello 1 che hanno capacità in eccesso per completare gli studi proposti.

In questo protocollo, l'unico intervento specifico dello studio sarà la raccolta del sangue. I rischi di prelevare sangue da una vena includono disagio nel sito della puntura; possibili lividi e gonfiore attorno al sito di puntura; raramente un'infezione; e, insolitamente, svenimento dalla procedura. L'invasione della privacy sarà negata con l'uso della codifica per tutti i dati e i campioni raccolti.

Non ci sono vantaggi diretti per studiare le materie per la partecipazione. Questa ricerca potrebbe portare benefici alla società in futuro. Questo studio potrebbe un giorno portare a nuovi test o trattamenti, o potrebbe aiutare a prevenire o curare le malattie. Non esiste alcun conflitto di interessi per il PI o il sub-ricercatore.