En validering av en genomikbaserad prognos vid allvarliga trauman

Specifikt mål: Att prospektivt validera ett snabbt genomiskt test erhållet från blodleukocytsubpopulation av allvarligt traumatiserade patienter under de första 24 timmarna efter inläggningen, som kan användas för att diskriminera de patienter som kommer att ha en komplicerad klinisk bana och som därför skulle vara goda kandidater för interventionella, immunmodulerande terapier.

Efter allvarlig trubbig traumatisk skada och under återhämtning inträffar förändringar i leukocyttranskriptomet. Således föreslår vi att en leukocyttranskriptomsignal baserad på uttrycket av de validerade 63 totala leukocyt- eller 181 PMN-generna kan användas för att identifiera patienter som löper risk för ett komplicerat kliniskt utfall, antingen ensamt eller i kombination med anatomiska eller fysiologiska prediktorer. Målet med denna kliniska prövning är att validera den prediktiva förmågan hos denna transkriptombaserade prognostiker.

Detta är en icke-interventionell, observationsstudie av 200 svårt skadade patienter med trubbigt trauma och 40 friska frivilliga. Inträdeskriterierna kommer att vara desamma som har använts de senaste åtta åren med Limbidraget. Svårt trubbiga skadade patienter som uppfyller inklusionskriterierna kommer att genomgå snabb genomisk leukocytscreening vid intagningen och följande morgon (~24 timmar). Ytterligare blodprov kommer att samlas in efter 4, 7, 14, 21 och 28 dagar, eller så länge patienterna är på trauma- eller kirurgisk intensivvårdsavdelning, för bankverksamhet.

Under en fyraårsperiod kommer vi att gå in i 240 ämnen från University of Florida och från University of Washington vid Harborview Medical Center. Hos traumapatienterna kommer blodprov att tas vid intagningen, dag 1, 4, 7, 14, 21 och 28, eller fram till utskrivning från intensivvårdsavdelningen eller dödsfall. Totalt 4 till 5 ml blod kommer att samlas in vid varje tidpunkt. Hos de friska frivilliga kommer ett engångsblodprov att tas.

Screening och samtycke: Traumapatienter kommer att identifieras av studiepersonal efter presentation till akuten. Försökspersonen eller juridiska anhöriga kommer att kontaktas för samtycke inom 96 timmar om patienten uppfyller inträdeskriterierna. Vi ber om försenat samtycke i denna patientpopulation i 96 timmar på grund av skadornas svårighetsgrad, patientens sårbara natur vid denna tidiga tidpunkt och utmaningen att nå patientens juridiska ombud. Om informerat samtycke inte erhålls inom 96 timmar kommer alla blodprover och insamlade data att kasseras.

Friska frivilliga ämnen kommer att identifieras från den allmänna befolkningen med hjälp av reklamblad som läggs upp vid respektive universitet. Flygbladen kommer att tillhandahålla kontaktinformation för laboratorierna. Friska försökspersoner kommer att screenas via inklusions-/exkluderingskriterier vid kontakt. Om det är lämpligt för deltagande, kommer försökspersonen att konsulteras för samtycke.

Blod kommer att samlas in från befintlig tillgång, eller genom venpunktion, om så krävs. Blod kommer omedelbart att placeras på is och överföras till laboratoriet där det kommer att behandlas för cellysat och plasma.

Alla andra relevanta kliniska data och hemodynamiska mätningar kommer att samlas in dagligen medan patienten är inlagd på sjukhus.

• Demografisk information.
• Tidigare och nuvarande journaler
• Laboratorie, mikrobiologi och alla andra testresultat
• Röntgen, CT, MRI, UL och alla andra bilddiagnostiska testresultat
• Anteckningar om eventuella mediciner som tagits emot under inläggningen
• Registrering av fysisk undersökning under antagning
• Registrering av alla vitala tecken och hemodynamisk övervakning under inläggning
• Registrering av alla ingrepp eller ingrepp under intagningen
• Registrering av alla ingrepp eller ingrepp under sjukhusinläggning
• Tillstånd vid ut- och utsläppsanläggningen

Var och en av de två kliniska platserna kommer att behålla ansvaret för insamling och lagring av kliniska data. REDCap (Research Electronic Data Capture) kommer att användas för insamling av klinisk data. Det är en säker, webbaserad applikation utformad för att stödja traditionell datainsamling av fallrapportformulär. Cellysat som erhållits vid University of Washington-Harborview Medical Center kommer att skickas till University of Florida för genomiska analyser, medan plasmaprover som samlas in vid Shands Hospital vid University of Florida kommer att skickas till University of Washington för cytokinanalyser med Luminex™ . Med årliga intervall kommer elektroniska dataöverföringar från University of Florida till University of Washington av både icke-identifierbara, kodade kliniska data och cytokin- och genomdata att ske.

Blodtagningar relaterade till studien kommer att göras vid sängen på ett sätt som är förenligt med standarden för klinisk vård eller i våra laboratorier för friska frivilliga. Rör som används för blodtagningar relaterade till studien kommer att märkas med det unika studienumret och kommer inte att bära någon patientidentifiering. Nyckeln som länkar det unika patientnumret och patientens personliga identifierare kommer att lagras i en lösenordsskyddad och krypterad fil och kommer endast att vara tillgänglig för PI och forskargruppen. Alla patientinsamlade kliniska data kommer att lagras i ett skåp som finns på PI:s eller forskargruppens kontor. Datorn som används för lagring av data kommer att finnas på PI:s eller forskningspersonalens kontor som alltid är låst. Datorn kommer att vara lösenordsskyddad och krypterad.

Vi har baserat vår bedömning av antalet försökspersoner på vår preliminära datauppsättning från 1637 patienter med svåra trauman. I den studien, av de 1637 försökspersonerna, hade 31 % eller 507 patienter en tid till återhämtning på mindre än fem dagar och kunde identifieras som med ett okomplicerat resultat. Däremot hade 442 patienter eller 27 % ett komplicerat resultat, som definierats av antingen sen död eller MOF som varade längre än 14 dagar. Om vi ​​antar en liknande frekvens av komplicerade och okomplicerade patienter hos de 200 försökspersonerna, skulle vi förvänta oss att 62 av dessa patienter skulle skrivas ut inom 5 dagar utan organskada och att 54 patienter skulle ha långvarig organsvikt och/eller sen död. Dessa siffror ligger väl inom de intervall som krävs för statistisk validering av dessa olika modeller.

Vi räknar med att vår totala samtyckesfrekvens för denna observationsstudie med minimal risk kommer att vara 75 %, vilket innebär att för att uppnå en ackumuleringsgrad på 25 traumapatienter per år vid varje institution måste vi ha 34 personer per år som uppfyller inträdeskriterierna. Vi förväntar oss inga svårigheter att samla in dessa 200 ämnen under en fyraårsperiod på de deltagande platserna. De är båda traumacenter på nivå 1 som har överkapacitet för att slutföra de föreslagna studierna.

I detta protokoll kommer den enda studiespecifika interventionen att vara insamling av blod. Riskerna med att ta blod från en ven inkluderar obehag vid punkteringsstället; möjliga blåmärken och svullnad runt punkteringsstället; sällan en infektion; och, ovanligt, svimning från proceduren. Intrång i integriteten kommer att förnekas med användning av kodning för alla data och exemplar som samlas in.

Det finns inga direkta fördelar med att studera ämnen för deltagande. Denna forskning kan komma att gynna samhället i framtiden. Denna studie kan en dag resultera i nya tester eller behandlingar, eller kan hjälpa till att förebygga eller bota sjukdomar. Det finns ingen intressekonflikt för PI eller underutredaren.