Geneettinen alttius reumaattisille sydänsairauksille Tyynenmeren alueella
Genominlaajuinen yhdistystutkimus herkkyydestä reumaattisille sydänsairauksille Fidžin ja Uuden-Kaledonian alueella
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tutkijat tekevät mikroarray-genotyypistä noin 300 000 yksittäisen nukleotidin polymorfismia (SNP) käyttämällä DNA-näytteitä potilaista, joilla on reumaattinen sydänsairaus (tapaukset) Uudesta-Kaledoniasta ja Fidžistä, sekä yleisen väestön jäsenistä (kontrollit) Uudesta-Kaledoniasta, Vanuatusta ja Fidžistä. Tutkijat suorittavat standardinmukaisia laadunvalvontatarkistuksia SNP-tiedoille käyttämällä mittareita, kuten puhelunopeutta, heterotsygoottisuutta, päällekkäisyyttä ja sukulaisuutta, ja sulkevat pois variantit Hardy-Weinberg-tasapainosta poikkeamisen ja vähäisten alleelien esiintymistiheyden perusteella. Tämän tutkimuksen fenotyyppisistä ääripäistä laskemme myös muunnelmat, joita ei ole mikroryhmässä, viitaten viimeisimpään julkaisuun 1000 Genomes -datasta ja koko genomin sekvenssidatasta kuudeltakymmeneltä Uudesta-Kaledoniasta peräisin olevalta melanesialaiselta yksilöltä.
Tutkijat tekevät löytöanalyysin käyttämällä genominlaajuista assosiaatiotutkimuksen lähestymistapaa keskittyen Oceanic-tapauksiin ja kontrolleihin Uuden-Kaledonian ja Vanuatun frankofonisista maista. Tämä analyysi korjataan populaation kerrostumisen aiheuttaman harhan suhteen käyttämällä lineaarista sekamallia (LMM) ja harkitaan additiivisia, hallitsevia ja resessiivisiä geneettisiä malleja. Tutkijat suorittavat sitten LMM-assosiaatiotestauksen varianteille, joiden P-arvo löytöanalyysissä on alle 1x10^-5 Oceanic-tapauksissa ja Fidžin kontrolleissa, ja yhdistävät assosiaatiotilastot kiinteiden vaikutusten meta-analyysillä. Tutkijat harkitsevat, että variantit, joilla on merkittäviä vaikutuksia samaan suuntaan löytö- ja replikaatioanalyyseissä, joiden yhdistetty P-arvo on alle 1x10^-8, ovat replikoituneet. Ellei ole selviä todisteita siitä, että liittyvät muunnelmat ovat spesifisiä valtameren populaatioille, lisäreplikaatioanalyysejä assosioituneiden varianttien osalta tapauksista ja kontrolleista, jotka ovat peräisin Fidžin intiaanien alkuperästä, sekä muista ja sekalaisten etnisten ryhmien yksilöistä sekä Fidžistä että Uudesta-Kaledoniasta.
Rekrytointi päättyi joulukuussa 2013. British Heart Foundationin rahoituksen saamisen jälkeen genotyypitys ja analyysi alkaa heinäkuussa 2014.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Suva, Fidži
- Colonial War Memorial Hospital
-
-
-
-
-
Noumea, Uusi-Caledonia
- Centre Hospitalier Territorial de Nouvelle Caledonie
-
-
-
-
-
Oxford, Yhdistynyt kuningaskunta, OX3 7BN
- Wellcome Trust Centre for Human Genetics, University of Oxford
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Tapaukset:
- Sairausrekistereistä, perusterveydenhuollon klinikoista ja sairaalapalveluista todetut yleiset ja tapaukset reumaattisista sydänsairauksista.
Uudet säätimet:
- Vapaaehtoistyöntekijät yhteisöistä, joissa tapauksia havaittiin.
Olemassa olevat säätimet:
- Henkilöt tältä alueelta, jotka on aiemmin rekrytoitu populaatiogenetiikan tutkimuksiin.
Kuvaus
Tapaukset
Sisällyttämiskriteerit:
Reumaattisen sydänsairauden diagnoosi perustuu johonkin seuraavista:
- World Heart Federationin tarkat kaikukardiografiset kriteerit
- Maailman sydänliiton rajakaikukriteerit ja akuutin reumaattisen kuumeen historia
- Mitraalisahtauma, jonka läpän pinta-ala on alle 2,0 cm2
- Aiempi leikkaus reumaattisen sydänsairauden vuoksi
Poissulkemiskriteerit:
- Ikä alle viisi vuotta
- Kyvyttömyys antaa suostumusta
Uudet säätimet
Sisällyttämiskriteerit:
- Terve yksilö, joka asuu yhteisössä, jossa tapauksia havaittiin
Poissulkemiskriteerit:
- Aiempi sairaushistoria tai järjestelmät, jotka viittaavat reumaattiseen sydänsairauteen, akuuttiin reumakuumeeseen tai muuhun läppäsydänsairauteen
- Ikä alle viisi vuotta
- Kyvyttömyys antaa suostumusta
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Reumaattiset sydänsairaustapaukset
Potilaat, joilla on reumaattinen sydänsairaus tapauskriteerien mukaisesti
|
|
Väestönhallinta
Yksilöt yleisestä populaatiosta jaettuna uusiin kontrolleihin (rekrytoitu erityisesti tätä tutkimusta varten) ja olemassa oleviin kontrolleihin (rekrytoitu aikaisempiin alueen populaatiogenetiikkatutkimuksiin)
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Reumaattisen sydänsairauden diagnoosi
Aikaikkuna: Ilmoittautumisen yhteydessä
|
Reumaattisen sydänsairauden diagnoosi asetteluna tapausten ilmoittautumiskriteereissä.
|
Ilmoittautumisen yhteydessä
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Mitraalstenoosin diagnoosi
Aikaikkuna: Ilmoittautumisen yhteydessä
|
Mitraalistenoosin historia tai kaikukardiografinen diagnoosi
|
Ilmoittautumisen yhteydessä
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Tom Parks, MRCP DTM&H, University of Oxford
- Päätutkija: Mariana Mirabel, MD, Institut National de la Santé Et de la Recherche Médicale, France
- Päätutkija: Andrew C Steer, FRACP PhD, University of Melbourne
- Opintojen puheenjohtaja: Adrian VS Hill, DPhil DM, University of Oxford
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Sydän-ja verisuonitaudit
- Infektiot
- Tuki- ja liikuntaelinten sairaudet
- Sidekudostaudit
- Bakteeri-infektiot
- Bakteeri-infektiot ja mykoosit
- Streptokokki-infektiot
- Gram-positiiviset bakteeri-infektiot
- Sydänläppäsairaudet
- Reumakuume
- Sydänsairaudet
- Reumaattiset sairaudet
- Mitraaliläpän ahtauma
- Reumaattinen sydänsairaus
Muut tutkimustunnusnumerot
- PACIFICRHDGEN
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .