太平洋地区风湿性心脏病的遗传易感性

研究人员将使用来自新喀里多尼亚和斐济的风湿性心脏病患者（病例）以及来自新喀里多尼亚、瓦努阿图和斐济的普通人群（对照）的 DNA 样本，对大约 300,000 个单核苷酸多态性 (SNP) 进行微阵列基因分型。 研究人员将使用调用率、杂合性、重复和相关性等措施对 SNP 数据进行标准质量控制检查，并根据与 Hardy-Weinberg 平衡和次要等位基因频率的偏差排除变异。 我们还将参考最新发布的 1000 基因组数据和来自新喀里多尼亚的 60 名美拉尼西亚人的全基因组序列数据，从本研究中的表型极端中估算微阵列上不存在的变体。

研究人员将使用全基因组关联研究方法进行发现分析，重点关注来自新喀里多尼亚和瓦努阿图法语国家的大洋洲病例和对照。 该分析将使用线性混合模型 (LMM) 纠正由于人口分层导致的偏差，并考虑加性、显性和隐性遗传模型。 然后，研究人员将对来自斐济的海洋病例和对照的发现分析中 P 值小于 1x10^-5 的变体进行 LMM 关联测试，并通过固定效应荟萃分析结合关联统计数据。 研究人员将考虑在发现和复制分析中在相同方向上具有显着影响的变体，其组合 P 值小于 1x10^-8 以进行复制。 除非有明确的证据表明相关变异是大洋洲人群特有的，否则将对来自斐济的印度后裔以及来自斐济和新喀里多尼亚的其他种族和混合种族的病例和对照中的相关变异进行进一步的复制分析。

招聘于 2013 年 12 月完成。 在收到英国心脏基金会的资助后，基因分型和分析将于 2014 年 7 月开始。