Susceptibilidad genética a la cardiopatía reumática en la región del Pacífico
Estudio de asociación de todo el genoma de la susceptibilidad a la cardiopatía reumática en Fiji y Nueva Caledonia
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Descripción detallada
Los investigadores genotipificarán en micromatrices aproximadamente 300 000 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) utilizando muestras de ADN de pacientes con cardiopatía reumática (casos) de Nueva Caledonia y Fiji, y miembros de la población general (controles) de Nueva Caledonia, Vanuatu y Fiji. Los investigadores realizarán verificaciones de control de calidad estándar en los datos de SNP utilizando medidas como tasa de llamadas, heterocigosidad, duplicación y relación, y excluirán variantes sobre la base de la desviación del equilibrio de Hardy-Weinberg y la frecuencia de alelos menores. También imputaremos variantes no presentes en la micromatriz con referencia a la última publicación de datos de 1000 genomas y datos de secuencia de genoma completo de sesenta individuos melanesios de Nueva Caledonia de los extremos fenotípicos de este estudio.
Los investigadores llevarán a cabo un análisis de descubrimiento utilizando un enfoque de estudio de asociación de todo el genoma centrado en casos y controles oceánicos de las naciones francófonas de Nueva Caledonia y Vanuatu. Este análisis se corregirá por sesgo debido a la estratificación de la población utilizando el Modelo Lineal Mixto (LMM) y considerará modelos genéticos aditivos, dominantes y recesivos. Luego, los investigadores realizarán pruebas de asociación LMM para variantes con valor P en el análisis de descubrimiento inferior a 1x10 ^ -5 en casos y controles de Oceanic de Fiji y combinarán las estadísticas de asociación mediante metanálisis de efectos fijos. Los investigadores considerarán las variantes con efectos significativos en la misma dirección en los análisis de descubrimiento y replicación con un valor P combinado inferior a 1x10^-8 para que se hayan replicado. A menos que haya pruebas claras de que las variantes asociadas son específicas de las poblaciones oceánicas, más análisis de replicación para las variantes asociadas en casos y controles de ascendencia india de Fiji, así como individuos de otras etnias mixtas de Fiji y Nueva Caledonia.
Contratación finalizada en diciembre de 2013. Después de recibir la financiación de la Fundación Británica del Corazón, la genotipificación y el análisis comenzarán en julio de 2014.
Tipo de estudio
Inscripción (Actual)
Contactos y Ubicaciones
Ubicaciones de estudio
-
-
-
Suva, Fiyi
- Colonial War Memorial Hospital
-
-
-
-
-
Noumea, Nueva Caledonia
- Centre Hospitalier Territorial de Nouvelle Caledonie
-
-
-
-
-
Oxford, Reino Unido, OX3 7BN
- Wellcome Trust Centre for Human Genetics, University of Oxford
-
-
Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
Acepta Voluntarios Saludables
Géneros elegibles para el estudio
Método de muestreo
Población de estudio
Casos:
- Casos prevalentes e incidentes de cardiopatía reumática comprobados a partir de registros de enfermedades, consultas de atención primaria y servicios hospitalarios.
Nuevos controles:
- Individuos voluntarios de comunidades donde se identificaron casos.
Controles existentes:
- Individuos de esta región que hayan sido reclutados previamente para estudios de investigación de genética de poblaciones.
Descripción
Casos
Criterios de inclusión:
El diagnóstico de la cardiopatía reumática se basa en uno de los siguientes:
- Criterios ecocardiográficos definitivos de la Federación Mundial del Corazón
- Criterios ecocardiográficos limítrofes de la Federación Mundial del Corazón y antecedentes de fiebre reumática aguda
- Estenosis mitral con área valvular inferior a 2,0 cm2
- Cirugía previa por cardiopatía reumática
Criterio de exclusión:
- Edad menor de cinco años
- Incapacidad para dar consentimiento
Nuevos controles
Criterios de inclusión:
- Individuo sano que vive en una comunidad donde se identificaron casos
Criterio de exclusión:
- Antecedentes médicos o sistemas sugestivos de cardiopatía reumática, fiebre reumática aguda u otra cardiopatía valvular
- Edad menor de cinco años
- Incapacidad para dar consentimiento
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
|---|
|
Casos de cardiopatía reumática
Pacientes con cardiopatía reumática tal como se define en los criterios del caso
|
|
Controles de población
Individuos de la población general divididos en controles nuevos (reclutados específicamente para este estudio) y controles existentes (reclutados para estudios previos de genética de poblaciones en la región)
|
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
|
Diagnóstico de cardiopatía reumática
Periodo de tiempo: En la inscripción
|
Diagnóstico de cardiopatía reumática como disposición en los criterios de inclusión de casos.
|
En la inscripción
|
Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
|
Diagnóstico de estenosis mitral
Periodo de tiempo: En la inscripción
|
Antecedentes o diagnóstico ecocardiográfico de estenosis mitral
|
En la inscripción
|
Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Tom Parks, MRCP DTM&H, University of Oxford
- Investigador principal: Mariana Mirabel, MD, Institut National de la Santé Et de la Recherche Médicale, France
- Investigador principal: Andrew C Steer, FRACP PhD, University of Melbourne
- Silla de estudio: Adrian VS Hill, DPhil DM, University of Oxford
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio
Finalización primaria (Actual)
Finalización del estudio (Actual)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Estimar)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Estimar)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
- Enfermedades cardiovasculares
- Infecciones
- Enfermedades musculoesqueléticas
- Enfermedades del tejido conectivo
- Infecciones bacterianas
- Infecciones bacterianas y micosis
- Infecciones estreptocócicas
- Infecciones por bacterias grampositivas
- Enfermedades de las válvulas cardíacas
- Fiebre reumática
- Enfermedades cardíacas
- Enfermedades reumáticas
- Estenosis de la válvula mitral
- Enfermedad reumática del corazón
Otros números de identificación del estudio
- PACIFICRHDGEN
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .