- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT02243592
Molekyyliprofilointi syöpäpotilaiden kudosnäytteissä, jotka reagoivat erinomaisesti hoitoon
Poikkeukselliset vasteet -pilottitutkimus: Poikkeuksellisesti reagoivien syöpäpotilaiden kasvainten molekyyliprofiili
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
ENSISIJAISET TAVOITTEET:
I. Tunnistaa pahanlaatuisten kudosten molekyyli-indikaattorit potilailta, jotka ovat antaneet poikkeuksellisen vasteen kliinisissä tutkimuksissa tai tavanomaisissa systeemisissä hoidoissa, joissa käytettiin koko eksomia ja/tai kohdennettua syväsekvensointia sekä mahdollisesti muita sekvensointi- ja muita molekyylien karakterisointimenetelmiä (jos riittävä kudos on olemassa).
II. Tutkia yhteyksiä tunnistettujen molekyyli-indikaattoreiden ja potilaan saaman hoidon oletetun vaikutusmekanismin välillä.
III. Testaa mahdollisuutta tunnistaa "poikkeukselliset reagoijat", hankkia asiaankuuluvat kasvain- ja normaalikudokset sekä kliiniset tiedot ja suorittaa koko eksoom ja/tai kohdennettu syväsekvensointi näille näytteille.
YHTEENVETO:
Aikaisemmin kerätyt kudosnäytteet analysoidaan kokonaisen eksomin sekvensoinnin ja/tai kohdennetun seuraavan sukupolven sekvensointi (NGS) syväsekvensoinnin avulla. Tapauksille, joihin on saatavilla riittävästi nukleiinihappoja, tehdään lisäanalyysejä, mukaan lukien koko genomin sekvensointi, lähettiribonukleiinihappo (RNA) (mRNA) -sekvensointi, mikro (miRNA) -sekvensointi, promoottorin metylaatioanalyysi ja yhden nukleotidin polymorfismin (SNP) analyysi.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
California
-
Duarte, California, Yhdysvallat, 91010
- City of Hope Comprehensive Cancer Center
-
Fresno, California, Yhdysvallat, 93720
- Kaiser Permanente-Fresno
-
Oakland, California, Yhdysvallat, 94611
- Kaiser Permanente-Oakland
-
Richmond, California, Yhdysvallat, 94801
- Kaiser Permanente-Richmond
-
San Francisco, California, Yhdysvallat, 94158
- UCSF Medical Center-Mission Bay
-
Santa Clara, California, Yhdysvallat, 95051
- Kaiser Permanente Medical Center - Santa Clara
-
Santa Rosa, California, Yhdysvallat, 95403
- Kaiser Permanente-Santa Rosa
-
Stockton, California, Yhdysvallat, 95210
- Kaiser Permanente-Stockton
-
Walnut Creek, California, Yhdysvallat, 94596
- Kaiser Permanente-Walnut Creek
-
-
Colorado
-
Aurora, Colorado, Yhdysvallat, 80045
- UCHealth University of Colorado Hospital
-
Fort Collins, Colorado, Yhdysvallat, 80524
- Poudre Valley Hospital
-
-
Connecticut
-
Greenwich, Connecticut, Yhdysvallat, 06830
- Greenwich Hospital
-
-
Delaware
-
Newark, Delaware, Yhdysvallat, 19713
- Helen F Graham Cancer Center
-
Newark, Delaware, Yhdysvallat, 19713
- Medical Oncology Hematology Consultants PA
-
-
District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, Yhdysvallat, 20016
- Sibley Memorial Hospital
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Yhdysvallat, 30322
- Emory University Hospital/Winship Cancer Institute
-
Columbus, Georgia, Yhdysvallat, 31904
- John B Amos Cancer Center
-
Valdosta, Georgia, Yhdysvallat, 31602
- South Georgia Medical Center/Pearlman Cancer Center
-
-
Idaho
-
Boise, Idaho, Yhdysvallat, 83706
- Saint Alphonsus Cancer Care Center-Boise
-
-
Illinois
-
Chicago, Illinois, Yhdysvallat, 60631
- Presence Resurrection Medical Center
-
Chicago, Illinois, Yhdysvallat, 60612
- Rush MD Anderson Cancer Center
-
Decatur, Illinois, Yhdysvallat, 62526
- Decatur Memorial Hospital
-
Decatur, Illinois, Yhdysvallat, 62526
- Cancer Care Specialists of Illinois - Decatur
-
Evanston, Illinois, Yhdysvallat, 60201
- NorthShore University HealthSystem-Evanston Hospital
-
Peoria, Illinois, Yhdysvallat, 61615
- Illinois CancerCare-Peoria
-
Springfield, Illinois, Yhdysvallat, 62702
- Springfield Clinic
-
-
Iowa
-
Cedar Rapids, Iowa, Yhdysvallat, 52402
- Physicians' Clinic of Iowa PC
-
-
Maine
-
York Village, Maine, Yhdysvallat, 03909
- York Hospital
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Yhdysvallat, 20892
- NCI - Center for Cancer Research
-
Bethesda, Maryland, Yhdysvallat, 20892
- National Cancer Institute Developmental Therapeutics Clinic
-
-
Michigan
-
Ann Arbor, Michigan, Yhdysvallat, 48109
- University of Michigan Rogel Cancer Center
-
Ann Arbor, Michigan, Yhdysvallat, 48106
- Trinity Health Saint Joseph Mercy Hospital Ann Arbor
-
Brighton, Michigan, Yhdysvallat, 48114
- Trinity Health Medical Center - Brighton
-
Detroit, Michigan, Yhdysvallat, 48201
- Wayne State University/Karmanos Cancer Institute
-
Grand Rapids, Michigan, Yhdysvallat, 49503
- Corewell Health Grand Rapids Hospitals - Butterworth Hospital
-
Marquette, Michigan, Yhdysvallat, 49855
- UP Health System Marquette
-
Marquette, Michigan, Yhdysvallat, 49855
- UP Health System Hematology Oncology Marquette
-
Southfield, Michigan, Yhdysvallat, 48075
- Henry Ford Health Providence Southfield Hospital
-
-
Missouri
-
Cape Girardeau, Missouri, Yhdysvallat, 63703
- Saint Francis Medical Center
-
Springfield, Missouri, Yhdysvallat, 65807
- CoxHealth South Hospital
-
Springfield, Missouri, Yhdysvallat, 65804
- Mercy Hospital Springfield
-
St Louis, Missouri, Yhdysvallat, 63110
- Washington University School of Medicine
-
St Louis, Missouri, Yhdysvallat, 63131
- Missouri Baptist Medical Center
-
St Louis, Missouri, Yhdysvallat, 63141
- Mercy Hospital Saint Louis
-
-
Montana
-
Great Falls, Montana, Yhdysvallat, 59405
- Benefis Sletten Cancer Institute
-
-
New Hampshire
-
Portsmouth, New Hampshire, Yhdysvallat, 03802
- Portsmouth Regional Hospital
-
-
New Mexico
-
Albuquerque, New Mexico, Yhdysvallat, 87106
- University of New Mexico Cancer Center
-
-
New York
-
Rochester, New York, Yhdysvallat, 14642
- University of Rochester
-
-
North Carolina
-
Durham, North Carolina, Yhdysvallat, 27710
- Duke University Medical Center
-
Winston-Salem, North Carolina, Yhdysvallat, 27157
- Wake Forest University Health Sciences
-
-
North Dakota
-
Fargo, North Dakota, Yhdysvallat, 58122
- Sanford Roger Maris Cancer Center
-
-
Ohio
-
Columbus, Ohio, Yhdysvallat, 43214
- Riverside Methodist Hospital
-
-
Oklahoma
-
Lawton, Oklahoma, Yhdysvallat, 73505
- Cancer Centers of Southwest Oklahoma Research
-
Oklahoma City, Oklahoma, Yhdysvallat, 73104
- University of Oklahoma Health Sciences Center
-
-
Oregon
-
Portland, Oregon, Yhdysvallat, 97227
- Kaiser Permanente Northwest
-
-
Pennsylvania
-
Phoenixville, Pennsylvania, Yhdysvallat, 19460
- Reading Hospital McGlinn Cancer Institute at Phoenixville
-
West Chester, Pennsylvania, Yhdysvallat, 19380
- Chester County Hospital
-
West Reading, Pennsylvania, Yhdysvallat, 19611
- Reading Hospital
-
-
South Carolina
-
Greenville, South Carolina, Yhdysvallat, 29605
- Prisma Health Cancer Institute - Faris
-
Greenville, South Carolina, Yhdysvallat, 29605
- Prisma Health Cancer Institute - Butternut
-
Seneca, South Carolina, Yhdysvallat, 29672
- Prisma Health Cancer Institute - Seneca
-
-
South Dakota
-
Sioux Falls, South Dakota, Yhdysvallat, 57117-5134
- Sanford USD Medical Center - Sioux Falls
-
Sioux Falls, South Dakota, Yhdysvallat, 57104
- Sanford Cancer Center Oncology Clinic
-
-
Tennessee
-
Kingsport, Tennessee, Yhdysvallat, 37660
- Wellmont Holston Valley Hospital and Medical Center
-
-
Texas
-
Houston, Texas, Yhdysvallat, 77030
- Baylor College of Medicine/Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center
-
Houston, Texas, Yhdysvallat, 77030
- Ben Taub General Hospital
-
San Antonio, Texas, Yhdysvallat, 78229
- University of Texas Health Science Center at San Antonio
-
-
Utah
-
Salt Lake City, Utah, Yhdysvallat, 84112
- Huntsman Cancer Institute/University of Utah
-
-
Virginia
-
Charlottesville, Virginia, Yhdysvallat, 22908
- University of Virginia Cancer Center
-
-
West Virginia
-
Martinsburg, West Virginia, Yhdysvallat, 25401
- WVUH-Berkely Medical Center
-
-
Wisconsin
-
Madison, Wisconsin, Yhdysvallat, 53792
- University of Wisconsin Carbone Cancer Center - University Hospital
-
Summit, Wisconsin, Yhdysvallat, 53066
- Aurora Medical Center in Summit
-
Waukesha, Wisconsin, Yhdysvallat, 53188
- UW Cancer Center at ProHealth Care
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
Dokumentoitu poikkeuksellinen vaste, joka määritellään potilaiksi, jotka täyttävät seuraavat kriteerit:
- Täydellinen vaste hoito-ohjelmalle, jossa täydellisen vasteen odotetaan olevan < 10 %:lla samalla tavalla hoidetuista potilaista
- Osittainen vaste (PR) > 6 kuukautta hoito-ohjelmassa, jossa PR:n odotetaan olevan > 6 kuukautta < 10 %:lla potilaista, joilla on samanlainen sairaus ja joita hoidetaan samalla tai samankaltaisella hoito-ohjelmalla
Täydellinen vastaus (CR) tai PR, jonka kesto on epätavallinen siten, että sisäinen arviointikomitea pitää sitä poikkeuksellisena vastauksena; esimerkkejä alla:
- PR, jonka kesto on > 3 x odotettu PR-keston mediaani (tapauksissa, joissa PR on odotettavissa > 10 %:lla potilaista, joilla on sama sairaus ja joita hoidetaan samalla hoito-ohjelmalla)
- CR tai kesto > 3 x odotetun CR-keston mediaani (tapauksissa, joissa CR voidaan havaita > 10 %:lla potilaista, joilla on sama sairaus ja joita hoidetaan samalla hoito-ohjelmalla)
- CR:n (tai PR) havaittu kesto on odotettua pidempi 90 %:lla potilaista, joilla on sama sairaus ja joita hoidetaan samalla hoito-ohjelmalla
- Huomautus: potilaan ei tarvitse olla mukana kliinisessä tutkimuksessa, kun havaittiin poikkeuksellinen vaste
- Radiologisten skannausten raportit tai muut vastaukset dokumentoivat todisteet toimitetaan tarkistettavaksi; tapaukset, joissa vastausta ei voida arvioida (esim. adjuvanttihoito) eivät ole kelvollisia, koska lopputulosta ei voida katsoa tietyn hoidon ansioksi
- Hoitohistoria on oltava saatavilla aikaisemmasta hoidosta ja lääkkeestä, jolle poikkeuksellinen vaste saavutettiin
- Potilaan on täytettävä suostumuskriteerit; tämä edellyttää: (i) nykyisen poikkeuksellisen reagoijan (ER) suostumuksen elävältä osallistujalta, joka ei ole menetetty seurantaan, (ii) ennakkosuostumusta tulevaa tutkimusta varten osallistujalta, jonka ei tiedetä olevan kuollut, mutta joka on kadonnut seurantaan, tai ( iii) jos potilas on kuollut eikä kieltäytynyt osallistumasta tutkimukseen kudoksen poiston yhteydessä minkään tässä tutkimuksessa käytettävän kudoksen osalta, suostumusta ei tarvita
- Saatavilla tutkimusvaatimukset täyttävä kasvainnäyte
Vaaditut kasvainnäytteet TÄYTYY olla olemassa ja ne on voitava toimittaa; tutkijat, jotka haluavat toimittaa näytteitä, eivät saa olla tehneet sopimuksia, jotka kieltäisivät tällaisista näytteistä saatujen tietojen vapaan käytön; National Cancer Institute (NCI) toimittaa tutkijoille kirjeen yhteistyökumppanille, jolla muutetaan heidän nykyistä sopimustaan, jotta tapaus voidaan toimittaa
- Tarvitaan kasvainkudosta ennen lääkkeen antamista, johon poikkeuksellinen vaste tapahtui; ihannetapauksessa tämä näyte on kerätty juuri ennen hoitoa, mutta muut aikaisemmat kudokset otetaan huomioon; kudos voi olla tuoretta pakastettua tai formaliinilla kiinnitettyä parafiinia
- Kasvainkudoksen määrän on vastattava vähintään ydinbiopsiaa ja täytettävä vähimmäisnäytteen vaatimukset
- Kannustettu: normaali kudosnäyte: (valinnainen): veri tai muu näytelähde ituradan sekvensointiin
- Genotyypit ja fenotyypit (dbGaP) -tietokannassa olevaan Exceptional Responder Database -tietokantaan toimitetuilla kasvainnäytteillä ja kliinisillä tiedoilla on oltava asianmukaiset sopimukset toimittamisen mahdollistamiseksi. Exceptional Responders -tietokanta voi hyväksyä kliinisiä tietoja ja näytteitä tapauksista, jotka on rekisteröity Cancer Therapy Evaluation Program (CTEP) -sponsoroituun kliiniseen tutkimukseen, ja tapauksista, joita ei ole rekisteröity mihinkään kliiniseen tutkimukseen; jos vastaus tapahtui tutkimuksessa, joka ei ollut CTEP-sponsoroima, lähetyspaikan ja lääkeyhtiön välillä on olemassa sopimuksia; jos olemassa olevat sopimukset eivät salli näytteiden ja kliinisten tietojen toimittamista, NCI toimittaa tutkijoille kirjeen, joka sallii kudoksen käytön poikkeuksellisten vasteiden tutkimuksessa, jos asianmukainen yhteistyökumppani on allekirjoittanut sen; kirje muuttaa nykyistä sopimusta sisällyttämällä siihen CTEP Intellectual Property (IP) Option -kielen, jonka avulla tapaus voidaan toimittaa Exceptional Responders -tietokantaan; jos olemassa olevaa sopimusta ei voida muuttaa eikä kirjettä voida allekirjoittaa, ehdotettua tapausta ei hyväksytä; Huomautus: kuten yllä todettiin, potilaan ei tarvitse olla mukana kliinisessä tutkimuksessa voidakseen osallistua poikkeuksellisten vasteiden tutkimukseen
Poissulkemiskriteerit:
- Potilaan vaste ei täyttänyt poikkeuksellisen vasteen kriteerejä
- Potilaan hoito-ohjelman odotetaan johtavan CR:ään tai kestävään PR:iin > 10 %:lla potilaista
- Potilaan vasteen kesto ei ole > 3 kertaa odotettu vasteen pituus
- Vastetta ei voida arvioida tai sitä ei voida katsoa johtuvan systeemisestä hoidosta (esim. adjuvanttihoito)
- Potilas kieltäytyi antamasta suostumusta kudoksen käyttöön poikkeuksellisten vasteiden tutkimukseen sisältyviin tutkimustoimiin
- Poikkeuksellista vastetta edeltävä kasvainnäyte ei ole saatavilla tai se ei täytä laatumittareita
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Case-Control
- Aikanäkymät: Takautuva
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Apukorrelaatio (molekyyliprofilointi)
Aikaisemmin kerätyt kudosnäytteet analysoidaan koko eksomin sekvensoinnilla ja/tai kohdistetulla NGS-määrityksen syväsekvensoinnilla.
Tapauksille, joissa on saatavilla riittävästi nukleiinihappomääriä, tehdään lisäanalyysejä, mukaan lukien koko genomin sekvensointi, mRNA-sekvensointi, miRNA-sekvensointi, promoottorin metylaatioanalyysi ja SNP-analyysi.
|
Käy läpi sekvensointi ja SNP-analyysi
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Molekyyliominaisuudet kudosnäytteissä potilailta, jotka olivat poikkeuksellisen reagoivia
Aikaikkuna: Perustaso
|
Potilaiden kasvainten molekyyliominaisuudet ovat erotettavissa kasvaimesta verrattuna (i) saman potilaan normaalikudoksesta otettuihin näytteisiin ja (ii) samankaltaisten tietojen tietokantoihin normaaleille ja muille kasvaintyypeille.
|
Perustaso
|
|
Niiden hoitojen oletetut vaikutusmekanismit, joita potilaat saivat, kun he kokivat poikkeuksellisen vasteensa
Aikaikkuna: Perustaso
|
Selvitetään tunnistettujen molekyyliominaisuuksien ja niiden hoitojen oletettujen vaikutusmekanismien välisiä yhteyksiä, joita potilaat saivat, kun he kokivat poikkeuksellisen vasteensa.
Tilastolliset analyysit ovat ensisijaisesti kuvailevia.
|
Perustaso
|
|
Tapausten määrä, jotka tunnistettiin mahdollisiksi poikkeuksellisiksi toimijoiksi
Aikaikkuna: Perustaso
|
Tilastolliset analyysit ovat ensisijaisesti kuvailevia.
|
Perustaso
|
|
Prosenttiosuus tunnistetuista mahdollisista tapauksista vahvisti olevan poikkeuksellisia reagoijia
Aikaikkuna: Perustaso
|
Tilastolliset analyysit ovat ensisijaisesti kuvailevia.
|
Perustaso
|
|
Niiden vahvistettujen poikkeuksellisten vasteiden prosenttiosuus, joille on hankittu riittävä kudos asianmukaisella tietoon perustuvalla suostumuksella
Aikaikkuna: Perustaso
|
Tilastolliset analyysit ovat ensisijaisesti kuvailevia.
|
Perustaso
|
|
Niiden kudosten hankittujen tapausten prosenttiosuus, joille on saatu onnistuneesti vähintään vähimmäismolekyylien karakterisointi
Aikaikkuna: Perustaso
|
Tilastolliset analyysit ovat ensisijaisesti kuvailevia.
|
Perustaso
|
|
Niiden molekyylien karakterisoitujen tapausten prosenttiosuus, joissa molekyylien karakterisointiraportissa tunnistettiin (ilman viittausta potilaan vastaanottamaan lääkkeeseen) vähintään yksi ominaisuus, jolla arvioitiin mahdollisesti olevan terapeuttista merkitystä
Aikaikkuna: Perustaso
|
Lupaavista löydöistä tehdään yhteenveto tapausryhmästä, jolle saavutettiin onnistuneesti vähimmäismolekyylien karakterisointi.
Jokaisessa tällaisessa tapauksessa asiantuntijapaneeli ("paneeli") tarkastelee molekyylitiedot kiinnostavien ominaisuuksien tunnistamiseksi.
Kaikkiin arvioituihin suhteisiin liittyy tarkat 95 %:n luottamusvälit.
|
Perustaso
|
|
Niiden tapausten prosenttiosuus, joissa oli >= 1 ominaisuus molekyylien karakterisointiraportissa ja joilla arvioitiin olevan potentiaalista terapeuttista merkitystä tietylle lääkeryhmälle, jota potilas todella sai, kun poikkeuksellinen vaste koettiin
Aikaikkuna: Perustaso
|
Lupaavista löydöistä tehdään yhteenveto tapausryhmästä, jolle saavutettiin onnistuneesti vähimmäismolekyylien karakterisointi.
Jokaisessa tällaisessa tapauksessa paneeli tarkistaa molekyylitiedot kiinnostavien ominaisuuksien tunnistamiseksi.
Kaikkiin arvioituihin suhteisiin liittyy tarkat 95 %:n luottamusvälit.
|
Perustaso
|
|
Niiden tapausten prosenttiosuus, joissa on >= 1 ominaisuus, joka korreloi sen erityisen apurahan vaikutusmekanismin kanssa, jolle poikkeuksellinen vaste tapahtui ja joka havaittiin, kun molekyyliprofiilitietoja oli analysoitu tarkemmin merkityksellisten molekyylipoikkeavuuksien varalta
Aikaikkuna: Perustaso
|
Lupaavista löydöistä tehdään yhteenveto tapausryhmästä, jolle saavutettiin onnistuneesti vähimmäismolekyylien karakterisointi.
Jokaisessa tällaisessa tapauksessa paneeli tarkistaa molekyylitiedot kiinnostavien ominaisuuksien tunnistamiseksi.
Kaikkiin arvioituihin suhteisiin liittyy tarkat 95 %:n luottamusvälit.
|
Perustaso
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: S. P Ivy, National Cancer Institute (NCI)
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- NCI-2014-01585 (Rekisterin tunniste: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- UM1CA186704 (Yhdysvaltain NIH-apuraha/sopimus)
- 9671 (Muu tunniste: CTEP)
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .