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- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT02243592
Profilage moléculaire dans des échantillons de tissus de patients atteints de cancer qui répondent exceptionnellement au traitement
Étude pilote sur les répondeurs exceptionnels : profilage moléculaire des tumeurs de patients cancéreux qui sont des répondeurs exceptionnels
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
OBJECTIFS PRINCIPAUX:
I. Identifier les indicateurs moléculaires dans les tissus malins de patients qui ont été des répondeurs exceptionnels lors d'essais cliniques ou de traitements systémiques standard utilisant l'exome entier et/ou le séquençage profond ciblé, ainsi que potentiellement d'autres séquençages et d'autres méthodes de caractérisation moléculaire (si le tissu adéquat existe).
II. Explorer les associations entre les indicateurs moléculaires identifiés et le mécanisme d'action putatif du traitement reçu par le patient.
III. Tester la faisabilité d'identifier des "répondeurs exceptionnels", d'obtenir les données tumorales et tissulaires normales et cliniques pertinentes, et d'effectuer un exome entier et/ou un séquençage profond ciblé sur ces échantillons.
CONTOUR:
Les échantillons de tissus précédemment collectés sont analysés via un séquençage de l'exome entier et/ou un séquençage en profondeur par test de séquençage de nouvelle génération (NGS) ciblé. Les cas pour lesquels des quantités suffisantes d'acide nucléique sont disponibles subiront des analyses supplémentaires, notamment le séquençage du génome entier, le séquençage de l'acide ribonucléique messager (ARN) (ARNm), le séquençage des micro (miARN), l'analyse de la méthylation du promoteur et l'analyse du polymorphisme d'un seul nucléotide (SNP).
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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California
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Duarte, California, États-Unis, 91010
- City of Hope Comprehensive Cancer Center
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Fresno, California, États-Unis, 93720
- Kaiser Permanente-Fresno
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Oakland, California, États-Unis, 94611
- Kaiser Permanente-Oakland
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Richmond, California, États-Unis, 94801
- Kaiser Permanente-Richmond
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San Francisco, California, États-Unis, 94158
- UCSF Medical Center-Mission Bay
-
Santa Clara, California, États-Unis, 95051
- Kaiser Permanente Medical Center - Santa Clara
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Santa Rosa, California, États-Unis, 95403
- Kaiser Permanente-Santa Rosa
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Stockton, California, États-Unis, 95210
- Kaiser Permanente-Stockton
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Walnut Creek, California, États-Unis, 94596
- Kaiser Permanente-Walnut Creek
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-
Colorado
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Aurora, Colorado, États-Unis, 80045
- UCHealth University of Colorado Hospital
-
Fort Collins, Colorado, États-Unis, 80524
- Poudre Valley Hospital
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Connecticut
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Greenwich, Connecticut, États-Unis, 06830
- Greenwich Hospital
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-
Delaware
-
Newark, Delaware, États-Unis, 19713
- Helen F Graham Cancer Center
-
Newark, Delaware, États-Unis, 19713
- Medical Oncology Hematology Consultants PA
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-
District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, États-Unis, 20016
- Sibley Memorial Hospital
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-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, États-Unis, 30322
- Emory University Hospital/Winship Cancer Institute
-
Columbus, Georgia, États-Unis, 31904
- John B Amos Cancer Center
-
Valdosta, Georgia, États-Unis, 31602
- South Georgia Medical Center/Pearlman Cancer Center
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-
Idaho
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Boise, Idaho, États-Unis, 83706
- Saint Alphonsus Cancer Care Center-Boise
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-
Illinois
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Chicago, Illinois, États-Unis, 60631
- Presence Resurrection Medical Center
-
Chicago, Illinois, États-Unis, 60612
- Rush MD Anderson Cancer Center
-
Decatur, Illinois, États-Unis, 62526
- Decatur Memorial Hospital
-
Decatur, Illinois, États-Unis, 62526
- Cancer Care Specialists of Illinois - Decatur
-
Evanston, Illinois, États-Unis, 60201
- NorthShore University HealthSystem-Evanston Hospital
-
Peoria, Illinois, États-Unis, 61615
- Illinois CancerCare-Peoria
-
Springfield, Illinois, États-Unis, 62702
- Springfield Clinic
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-
Iowa
-
Cedar Rapids, Iowa, États-Unis, 52402
- Physicians' Clinic of Iowa PC
-
-
Maine
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York Village, Maine, États-Unis, 03909
- York Hospital
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, États-Unis, 20892
- NCI - Center for Cancer Research
-
Bethesda, Maryland, États-Unis, 20892
- National Cancer Institute Developmental Therapeutics Clinic
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Michigan
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Ann Arbor, Michigan, États-Unis, 48109
- University of Michigan Rogel Cancer Center
-
Ann Arbor, Michigan, États-Unis, 48106
- Trinity Health Saint Joseph Mercy Hospital Ann Arbor
-
Brighton, Michigan, États-Unis, 48114
- Trinity Health Medical Center - Brighton
-
Detroit, Michigan, États-Unis, 48201
- Wayne State University/Karmanos Cancer Institute
-
Grand Rapids, Michigan, États-Unis, 49503
- Corewell Health Grand Rapids Hospitals - Butterworth Hospital
-
Marquette, Michigan, États-Unis, 49855
- UP Health System Marquette
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Marquette, Michigan, États-Unis, 49855
- UP Health System Hematology Oncology Marquette
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Southfield, Michigan, États-Unis, 48075
- Henry Ford Health Providence Southfield Hospital
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-
Missouri
-
Cape Girardeau, Missouri, États-Unis, 63703
- Saint Francis Medical Center
-
Springfield, Missouri, États-Unis, 65807
- CoxHealth South Hospital
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Springfield, Missouri, États-Unis, 65804
- Mercy Hospital Springfield
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St Louis, Missouri, États-Unis, 63110
- Washington University School of Medicine
-
St Louis, Missouri, États-Unis, 63131
- Missouri Baptist Medical Center
-
St Louis, Missouri, États-Unis, 63141
- Mercy Hospital Saint Louis
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-
Montana
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Great Falls, Montana, États-Unis, 59405
- Benefis Sletten Cancer Institute
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New Hampshire
-
Portsmouth, New Hampshire, États-Unis, 03802
- Portsmouth Regional Hospital
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-
New Mexico
-
Albuquerque, New Mexico, États-Unis, 87106
- University of New Mexico Cancer Center
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-
New York
-
Rochester, New York, États-Unis, 14642
- University of Rochester
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North Carolina
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Durham, North Carolina, États-Unis, 27710
- Duke University Medical Center
-
Winston-Salem, North Carolina, États-Unis, 27157
- Wake Forest University Health Sciences
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-
North Dakota
-
Fargo, North Dakota, États-Unis, 58122
- Sanford Roger Maris Cancer Center
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-
Ohio
-
Columbus, Ohio, États-Unis, 43214
- Riverside Methodist Hospital
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-
Oklahoma
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Lawton, Oklahoma, États-Unis, 73505
- Cancer Centers of Southwest Oklahoma Research
-
Oklahoma City, Oklahoma, États-Unis, 73104
- University of Oklahoma Health Sciences Center
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-
Oregon
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Portland, Oregon, États-Unis, 97227
- Kaiser Permanente Northwest
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Pennsylvania
-
Phoenixville, Pennsylvania, États-Unis, 19460
- Reading Hospital McGlinn Cancer Institute at Phoenixville
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West Chester, Pennsylvania, États-Unis, 19380
- Chester County Hospital
-
West Reading, Pennsylvania, États-Unis, 19611
- Reading Hospital
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South Carolina
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Greenville, South Carolina, États-Unis, 29605
- Prisma Health Cancer Institute - Faris
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Greenville, South Carolina, États-Unis, 29605
- Prisma Health Cancer Institute - Butternut
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Seneca, South Carolina, États-Unis, 29672
- Prisma Health Cancer Institute - Seneca
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-
South Dakota
-
Sioux Falls, South Dakota, États-Unis, 57117-5134
- Sanford USD Medical Center - Sioux Falls
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Sioux Falls, South Dakota, États-Unis, 57104
- Sanford Cancer Center Oncology Clinic
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Tennessee
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Kingsport, Tennessee, États-Unis, 37660
- Wellmont Holston Valley Hospital and Medical Center
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Texas
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Houston, Texas, États-Unis, 77030
- Baylor College of Medicine/Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center
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Houston, Texas, États-Unis, 77030
- Ben Taub General Hospital
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San Antonio, Texas, États-Unis, 78229
- University of Texas Health Science Center at San Antonio
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Utah
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Salt Lake City, Utah, États-Unis, 84112
- Huntsman Cancer Institute/University of Utah
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-
Virginia
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Charlottesville, Virginia, États-Unis, 22908
- University of Virginia Cancer Center
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-
West Virginia
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Martinsburg, West Virginia, États-Unis, 25401
- WVUH-Berkely Medical Center
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Wisconsin
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Madison, Wisconsin, États-Unis, 53792
- University of Wisconsin Carbone Cancer Center - University Hospital
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Summit, Wisconsin, États-Unis, 53066
- Aurora Medical Center in Summit
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Waukesha, Wisconsin, États-Unis, 53188
- UW Cancer Center at ProHealth Care
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
Réponse exceptionnelle documentée, définie comme les patients répondant aux critères suivants :
- Réponse complète à un régime dans lequel une réponse complète est attendue chez < 10 % des patients traités de manière similaire
- Réponse partielle (RP) > 6 mois dans un régime dans lequel des RP > 6 mois sont attendus chez < 10 % des patients atteints d'une maladie similaire traités avec le même régime ou un régime similaire
Réponse complète (RC) ou RP d'une durée inhabituelle, telle que le comité d'examen interne considère qu'il s'agit d'une réponse exceptionnelle ; exemples ci-dessous :
- RP de durée > 3 x la durée médiane de RP attendue (dans les cas où une RP est attendue chez > 10 % des patients atteints de la même maladie traités avec le même schéma thérapeutique)
- RC ou durée > 3 x la durée médiane attendue de la RC (dans les cas où la RC peut être observée chez > 10 % des patients atteints de la même maladie traités avec le même régime)
- La durée observée de la RC (ou de la RP) est plus longue que prévu pour 90 % des patients atteints de la même maladie traités avec le même régime
- Remarque : il n'est pas nécessaire que le patient soit inscrit à un essai clinique lorsque la réponse exceptionnelle a été observée
- Les rapports d'examens radiologiques ou d'autres preuves documentant la réponse seront soumis pour examen ; les cas où la réponse n'est pas évaluable (par ex. traitement adjuvant) ne seront pas éligibles car le résultat ne peut être attribué à un traitement spécifique
- Les antécédents de traitement doivent être disponibles, pour le traitement antérieur et pour le médicament auquel la réponse exceptionnelle s'est produite
- Le patient doit répondre aux critères de consentement ; cela nécessite : (i) le consentement actuel d'un répondeur exceptionnel (ER) par un participant vivant non perdu de vue, (ii) le consentement préalable pour une recherche future par un participant dont on ne sait pas qu'il est décédé, mais perdu de vue, ou ( iii) si le patient est décédé et n'a pas refusé de participer à la recherche au moment du prélèvement de tissu pour tout tissu qui serait utilisé dans cette étude, aucun consentement n'est requis
- Échantillon de tumeur disponible qui répond aux exigences de l'étude
Les échantillons de tumeur requis DOIVENT exister et pouvoir être soumis ; les enquêteurs souhaitant soumettre des échantillons ne doivent pas avoir conclu d'accords interdisant la libre utilisation des données de ces échantillons ; le National Cancer Institute (NCI) fournira aux enquêteurs une lettre pour le collaborateur modifiant son accord existant pour permettre la soumission du cas
- Le tissu tumoral d'avant l'administration du médicament auquel la réponse exceptionnelle s'est produite est requis ; idéalement, cet échantillon aura été prélevé juste avant le traitement, mais d'autres tissus antérieurs seront pris en considération ; le tissu peut être frais congelé ou fixé au formol inclus dans de la paraffine
- La quantité de tissu tumoral doit être au moins une biopsie au trocart et répondre aux exigences minimales en matière d'échantillons
- Recommandé : échantillon de tissu normal : (facultatif) : sang ou autre source d'échantillon pour le séquençage de la lignée germinale
- Les échantillons de tumeurs et les données cliniques soumis à la base de données des répondeurs exceptionnels dans la base de données sur les génotypes et les phénotypes (dbGaP) devront avoir des accords appropriés en place pour permettre la soumission ; la base de données des répondeurs exceptionnels peut accepter des données cliniques et des échantillons de cas inscrits à un essai clinique parrainé par le programme d'évaluation de la thérapie anticancéreuse (CTEP) et de cas qui n'étaient inscrits à aucun essai clinique ; si la réponse s'est produite dans le cadre d'un essai qui n'était pas parrainé par le CTEP, il existe des accords entre le site demandeur et la société pharmaceutique ; si les accords existants ne permettent pas la soumission d'échantillons et de données cliniques, le NCI fournira aux investigateurs une lettre autorisant l'utilisation du tissu pour l'étude des répondeurs exceptionnels si elle est signée par le collaborateur approprié ; la lettre modifie l'accord existant pour inclure le libellé de l'option CTEP sur la propriété intellectuelle (PI) qui permettrait de soumettre le cas à la base de données des répondants exceptionnels ; si l'accord existant ne peut pas être modifié et la lettre ne peut pas être signée, le cas proposé ne sera pas accepté ; Remarque : comme indiqué ci-dessus, le patient n'a pas besoin d'avoir été inscrit à un essai clinique pour être éligible à l'étude sur les répondeurs exceptionnels
Critère d'exclusion:
- La réponse du patient ne répondait pas aux critères d'une réponse exceptionnelle
- Le schéma thérapeutique du patient devrait entraîner une RC ou une RP durable chez > 10 % des patients
- La durée de réponse du patient n'est pas > 3 x la durée médiane de réponse attendue
- Réponse non évaluable ou non attribuable à un traitement systémique (par ex. traitement adjuvant)
- Le patient a refusé son consentement à l'utilisation de tissus pour les activités de recherche incluses dans l'étude sur les répondeurs exceptionnels
- L'échantillon de tumeur antérieur à la réponse exceptionnelle n'est pas disponible ou ne répond pas aux critères de qualité
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cas-témoins
- Perspectives temporelles: Rétrospective
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
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Ancillaire-Corrélatif (profilage moléculaire)
Les échantillons de tissus précédemment collectés sont analysés via un séquençage de l'exome entier et/ou un séquençage profond par dosage NGS ciblé.
Les cas pour lesquels des quantités suffisantes d'acide nucléique sont disponibles subiront des analyses supplémentaires, notamment le séquençage du génome entier, le séquençage de l'ARNm, le séquençage des miARN, l'analyse de la méthylation du promoteur et l'analyse des SNP.
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Subir un séquençage et une analyse SNP
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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Caractéristiques moléculaires dans les échantillons de tissus de patients qui étaient des répondeurs exceptionnels
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Les caractéristiques moléculaires des tumeurs chez les patients seront discernables comme distinctes de la tumeur par comparaison avec (i) des échantillons de tissu normal chez le même patient et (ii) des bases de données de données similaires pour des types de tumeurs normales et autres.
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Ligne de base
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Mécanismes d'action putatifs des traitements que les patients ont reçus lorsqu'ils ont connu leurs réponses exceptionnelles
Délai: Ligne de base
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Les associations entre les caractéristiques moléculaires identifiées et les mécanismes d'action putatifs des traitements que les patients ont reçus lorsqu'ils ont connu leurs réponses exceptionnelles seront explorées.
Les analyses statistiques seront essentiellement descriptives.
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Ligne de base
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Nombre de cas identifiés comme répondeurs exceptionnels potentiels
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Les analyses statistiques seront essentiellement descriptives.
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Ligne de base
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Pourcentage de cas potentiels identifiés confirmés comme étant des répondeurs exceptionnels
Délai: Ligne de base
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Les analyses statistiques seront essentiellement descriptives.
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Ligne de base
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Pourcentage de répondeurs exceptionnels confirmés pour lesquels un tissu adéquat avec un consentement éclairé approprié est acquis
Délai: Ligne de base
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Les analyses statistiques seront essentiellement descriptives.
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Ligne de base
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Pourcentage de cas acquis avec des tissus pour lesquels au moins la caractérisation moléculaire minimale est obtenue avec succès
Délai: Ligne de base
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Les analyses statistiques seront essentiellement descriptives.
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Ligne de base
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Pourcentage de cas caractérisés moléculairement pour lesquels un rapport de caractérisation moléculaire a identifié (sans référence au médicament reçu par le patient) au moins une caractéristique jugée comme ayant une pertinence thérapeutique potentielle
Délai: Ligne de base
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Des découvertes prometteuses seront résumées pour le groupe de cas pour lesquels la caractérisation moléculaire minimale a été obtenue avec succès.
Pour chacun de ces cas, les données moléculaires seront examinées par un panel d'experts ("Panel") afin d'identifier les caractéristiques intéressantes.
Toutes les proportions estimées seront accompagnées d'intervalles de confiance exacts à 95 %.
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Ligne de base
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Pourcentage de cas avec >= 1 caractéristique sur le rapport de caractérisation moléculaire qui a été jugée comme ayant une pertinence thérapeutique potentielle pour la classe spécifique de médicament que le patient a effectivement reçu lorsque la réponse exceptionnelle a été ressentie
Délai: Ligne de base
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Des découvertes prometteuses seront résumées pour le groupe de cas pour lesquels la caractérisation moléculaire minimale a été obtenue avec succès.
Pour chacun de ces cas, les données moléculaires seront examinées par le groupe scientifique afin d'identifier les caractéristiques intéressantes.
Toutes les proportions estimées seront accompagnées d'intervalles de confiance exacts à 95 %.
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Ligne de base
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Pourcentage de cas avec >= 1 caractéristique en corrélation avec le mécanisme d'action de la subvention spécifique à laquelle la réponse exceptionnelle s'est produite et qui a été trouvée après une analyse plus approfondie des données de profil moléculaire pour les anomalies moléculaires pertinentes
Délai: Ligne de base
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Des découvertes prometteuses seront résumées pour le groupe de cas pour lesquels la caractérisation moléculaire minimale a été obtenue avec succès.
Pour chacun de ces cas, les données moléculaires seront examinées par le groupe scientifique afin d'identifier les caractéristiques intéressantes.
Toutes les proportions estimées seront accompagnées d'intervalles de confiance exacts à 95 %.
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Ligne de base
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: S. P Ivy, National Cancer Institute (NCI)
Publications et liens utiles
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Estimé)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- NCI-2014-01585 (Identificateur de registre: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- UM1CA186704 (Subvention/contrat des NIH des États-Unis)
- 9671 (Autre identifiant: CTEP)
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