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对治疗有特殊反应的癌症患者组织样本的分子谱分析

2024年4月3日 更新者：National Cancer Institute (NCI)

异常反应者试点研究：来自异常反应者的癌症患者的肿瘤分子谱分析

这项试点研究试验研究了癌症患者组织样本的分子谱分析，这些患者接受了对大多数其他患有相同疾病的患者无效的治疗后病情好转。 在实验室研究癌症患者的组织样本可能有助于医生更多地了解脱氧核糖核酸 (DNA) 中发生的变化，并确定与患者对治疗的反应程度相关的生物标志物。

研究概览

地位

主动，不招人

条件

干预/治疗

详细说明

主要目标：

I. 使用全外显子组和/或靶向深度测序，以及潜在的其他测序和其他分子表征方法（如果存在足够的组织），从临床试验或标准系统治疗中反应异常的患者中识别恶性组织中的分子指标。

二。 探索已识别的分子指标与患者接受的治疗的推定作用机制之间的关联。

三、 测试识别“异常反应者”，获取相关肿瘤和正常组织及临床数据，并对这些样本进行全外显子组和/或靶向深度测序的可行性。

大纲：

以前收集的组织样本通过全外显子组测序和/或靶向下一代测序 (NGS) 检测深度测序进行分析。 有足够核酸量的病例将进行额外的分析，包括全基因组测序、信使核糖核酸 (RNA) (mRNA) 测序、微 (miRNA) 测序、启动子甲基化分析和单核苷酸多态性 (SNP) 分析。

研究类型

观察性的

注册 (实际的)

170

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

  • 美国
    • California
      • Duarte、California、美国、91010
        • City of Hope Comprehensive Cancer Center
      • Fresno、California、美国、93720
        • Kaiser Permanente-Fresno
      • Oakland、California、美国、94611
        • Kaiser Permanente-Oakland
      • Richmond、California、美国、94801
        • Kaiser Permanente-Richmond
      • San Francisco、California、美国、94158
        • UCSF Medical Center-Mission Bay
      • Santa Clara、California、美国、95051
        • Kaiser Permanente Medical Center - Santa Clara
      • Santa Rosa、California、美国、95403
        • Kaiser Permanente-Santa Rosa
      • Stockton、California、美国、95210
        • Kaiser Permanente-Stockton
      • Walnut Creek、California、美国、94596
        • Kaiser Permanente-Walnut Creek
    • Colorado
      • Aurora、Colorado、美国、80045
        • UCHealth University of Colorado Hospital
      • Fort Collins、Colorado、美国、80524
        • Poudre Valley Hospital
    • Connecticut
      • Greenwich、Connecticut、美国、06830
        • Greenwich Hospital
    • Delaware
      • Newark、Delaware、美国、19713
        • Helen F Graham Cancer Center
      • Newark、Delaware、美国、19713
        • Medical Oncology Hematology Consultants PA
    • District of Columbia
      • Washington、District of Columbia、美国、20016
        • Sibley Memorial Hospital
    • Georgia
      • Atlanta、Georgia、美国、30322
        • Emory University Hospital/Winship Cancer Institute
      • Columbus、Georgia、美国、31904
        • John B Amos Cancer Center
      • Valdosta、Georgia、美国、31602
        • South Georgia Medical Center/Pearlman Cancer Center
    • Idaho
      • Boise、Idaho、美国、83706
        • Saint Alphonsus Cancer Care Center-Boise
    • Illinois
      • Chicago、Illinois、美国、60612
        • Rush University Medical Center
      • Chicago、Illinois、美国、60631
        • Presence Resurrection Medical Center
      • Decatur、Illinois、美国、62526
        • Decatur Memorial Hospital
      • Decatur、Illinois、美国、62526
        • Cancer Care Specialists of Illinois - Decatur
      • Evanston、Illinois、美国、60201
        • NorthShore University HealthSystem-Evanston Hospital
      • Peoria、Illinois、美国、61615
        • Illinois CancerCare-Peoria
      • Springfield、Illinois、美国、62702
        • Springfield Clinic
    • Iowa
      • Cedar Rapids、Iowa、美国、52402
        • Physicians' Clinic of Iowa PC
    • Maine
      • York、Maine、美国、03909
        • York Hospital
    • Maryland
      • Bethesda、Maryland、美国、20892
        • NCI - Center for Cancer Research
      • Bethesda、Maryland、美国、20892
        • National Cancer Institute Developmental Therapeutics Clinic
    • Michigan
      • Ann Arbor、Michigan、美国、48109
        • University of Michigan Comprehensive Cancer Center
      • Ann Arbor、Michigan、美国、48106
        • Saint Joseph Mercy Hospital
      • Brighton、Michigan、美国、48114
        • Saint Joseph Mercy Brighton
      • Detroit、Michigan、美国、48201
        • Wayne State University/Karmanos Cancer Institute
      • Grand Rapids、Michigan、美国、49503
        • Spectrum Health at Butterworth Campus
      • Marquette、Michigan、美国、49855
        • UP Health System Marquette
      • Marquette、Michigan、美国、49855
        • UP Health System Hematology Oncology Marquette
      • Southfield、Michigan、美国、48075
        • Ascension Providence Hospitals - Southfield
    • Missouri
      • Cape Girardeau、Missouri、美国、63703
        • Saint Francis Medical Center
      • Saint Louis、Missouri、美国、63110
        • Washington University School of Medicine
      • Saint Louis、Missouri、美国、63131
        • Missouri Baptist Medical Center
      • Saint Louis、Missouri、美国、63141
        • Mercy Hospital Saint Louis
      • Springfield、Missouri、美国、65807
        • CoxHealth South Hospital
      • Springfield、Missouri、美国、65804
        • Mercy Hospital Springfield
    • Montana
      • Great Falls、Montana、美国、59405
        • Benefis Healthcare- Sletten Cancer Institute
    • New Hampshire
      • Portsmouth、New Hampshire、美国、03802
        • Portsmouth Regional Hospital
    • New Mexico
      • Albuquerque、New Mexico、美国、87102
        • University of New Mexico Cancer Center
    • New York
      • Rochester、New York、美国、14642
        • University of Rochester
    • North Carolina
      • Durham、North Carolina、美国、27710
        • Duke University Medical Center
      • Winston-Salem、North Carolina、美国、27157
        • Wake Forest University Health Sciences
    • North Dakota
      • Fargo、North Dakota、美国、58122
        • Sanford Roger Maris Cancer Center
    • Ohio
      • Columbus、Ohio、美国、43214
        • Riverside Methodist Hospital
    • Oklahoma
      • Lawton、Oklahoma、美国、73505
        • Cancer Centers of Southwest Oklahoma Research
      • Oklahoma City、Oklahoma、美国、73104
        • University of Oklahoma Health Sciences Center
    • Oregon
      • Portland、Oregon、美国、97227
        • Kaiser Permanente Northwest
    • Pennsylvania
      • Phoenixville、Pennsylvania、美国、19460
        • Phoenixville Hospital
      • West Chester、Pennsylvania、美国、19380
        • Chester County Hospital
      • West Reading、Pennsylvania、美国、19611
        • Reading Hospital
    • South Carolina
      • Greenville、South Carolina、美国、29605
        • Prisma Health Cancer Institute - Faris
      • Greenville、South Carolina、美国、29605
        • Prisma Health Cancer Institute - Butternut
      • Seneca、South Carolina、美国、29672
        • Prisma Health Cancer Institute - Seneca
    • South Dakota
      • Sioux Falls、South Dakota、美国、57117-5134
        • Sanford USD Medical Center - Sioux Falls
      • Sioux Falls、South Dakota、美国、57104
        • Sanford Cancer Center Oncology Clinic
    • Tennessee
      • Kingsport、Tennessee、美国、37660
        • Wellmont Holston Valley Hospital and Medical Center
    • Texas
      • Houston、Texas、美国、77030
        • Baylor College of Medicine/Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center
      • Houston、Texas、美国、77030
        • Ben Taub General Hospital
      • San Antonio、Texas、美国、78229
        • University of Texas Health Science Center at San Antonio
    • Utah
      • Salt Lake City、Utah、美国、84112
        • Huntsman Cancer Institute/University of Utah
    • Virginia
      • Charlottesville、Virginia、美国、22908
        • University of Virginia Cancer Center
    • West Virginia
      • Martinsburg、West Virginia、美国、25401
        • WVUH-Berkely Medical Center
    • Wisconsin
      • Madison、Wisconsin、美国、53792
        • University of Wisconsin Carbone Cancer Center
      • Summit、Wisconsin、美国、53066
        • Aurora Medical Center in Summit
      • Waukesha、Wisconsin、美国、53188
        • UW Cancer Center at ProHealth Care

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 及以上 (成人、年长者)

接受健康志愿者

不

取样方法

非概率样本

研究人群

参与特殊病例计划的癌症患者

描述

纳入标准：

  • 记录在案的异常反应，定义为符合以下标准的患者：

    • 对一种治疗方案的完全反应，其中预期完全反应在 < 10% 的接受类似治疗的患者中
    • 部分反应 (PR) > 6 个月的治疗方案，其中预计 PR > 6 个月的患者有 < 10% 的相似疾病接受相同或相似的治疗方案

    • 完全缓解 (CR) 或异常持续时间的 PR，以至于内部审查委员会认为这是例外的反应；下面的例子：

      • 持续时间的 PR > 3 x 中位预期 PR 持续时间（在预期 PR 在 > 10% 患有相同疾病且接受相同方案治疗的患者中）
      • CR 或持续时间 > 3 x 中位预期 CR 持续时间（在 > 10% 患有相同疾病且接受相同方案治疗的患者中可能出现 CR 的情况下）
      • 观察到的 CR（或 PR）持续时间长于 90% 患有相同疾病且接受相同方案治疗的患者的预期
    • 注意：当观察到异常反应时，不需要患者参加临床试验
  • 将提交放射扫描报告或其他记录反应的证据以供审查；反应不可评估的情况（例如 辅助治疗）将不符合条件，因为结果不能归因于特定治疗
  • 必须提供治疗史，用于之前的治疗和发生异常反应的药物
  • 患者必须符合同意标准；这需要：(i) 未失访的在世参与者的当前特殊响应者 (ER) 同意，(ii) 未知已故但失访的参与者对未来研究的事先同意，或 ( iii) 如果患者已故且在移除组织时未拒绝参与本研究中将使用的任何组织的研究，则无需同意
  • 可提供符合研究要求的肿瘤样本

  • 所需的肿瘤样本必须存在并且能够提交；希望提交样本的调查人员不得达成禁止免费使用此类样本数据的协议；美国国家癌症研究所 (NCI) 将向调查人员提供一封信，供合作者修改现有协议以允许提交案例

    • 需要发生异常反应的药物给药前的肿瘤组织；理想情况下，该样本将在治疗前采集，但也会考虑其他先前的组织；组织可以是新鲜冷冻的或福尔马林固定石蜡包埋的
    • 肿瘤组织量必须至少为核心活检，并满足最低标本要求
  • 鼓励：正常组织样本：（可选）：用于种系测序的血液或其他标本来源
  • 提交给基因型和表型数据库 (dbGaP) 中的特殊反应者数据库的肿瘤样本和临床数据需要有适当的协议才能提交；特殊反应者数据库可以接受来自参加癌症治疗评估计划 (CTEP) 赞助的临床试验的病例和未参加任何临床试验的病例的临床数据和样本；如果响应发生在非 CTEP 赞助的试验中，则提交站点与制药公司之间存在现有协议；如果现有协议不允许提交样本和临床数据，NCI 将向研究人员提供一封信，如果由适当的合作者签署，则允许将组织用于特殊反应者研究；这封信修改了现有协议，以包括 CTEP 知识产权 (IP) 选项语言，该语言允许将案例提交给特殊响应者数据库；如果无法修改现有协议且无法签署信件，则建议的案件将不予受理；注意：如上所述，患者不需要参加临床试验就有资格参加特殊反应者研究

排除标准：

  • 患者的反应不符合异常反应的标准
  • 患者的治疗方案预计会在 > 10% 的患者中导致 CR 或持久 PR
  • 患者的反应持续时间不 > 3 x 预期的反应中位长度
  • 反应不可评估或不能归因于全身治疗（例如 辅助治疗）
  • 患者拒绝同意将组织用于特殊反应者研究中的研究活动
  • 异常反应之前的肿瘤样本不可用，或不符合质量指标

学习计划

本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的？

设计细节

  • 观测模型：病例对照
  • 时间观点：追溯

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
辅助相关（分子谱分析）
以前收集的组织样本通过全外显子组测序和/或靶向 NGS 测定深度测序进行分析。 有足够核酸量的病例将进行额外的分析，包括全基因组测序、mRNA 测序、miRNA 测序、启动子甲基化分析和 SNP 分析。
其他：实验室生物标志物分析
进行测序和 SNP 分析

研究衡量的是什么？

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
来自反应异常的患者的组织样本的分子特征
大体时间：基线
通过与 (i) 来自同一患者正常组织的样品和 (ii) 正常和其他肿瘤类型的相似数据的数据库进行比较，患者肿瘤的分子特征将可辨别为不同于肿瘤。
基线
患者在经历异常反应时接受的治疗的推定作用机制
大体时间：基线
将探讨已识别的分子特征与患者在经历异常反应时接受的治疗的推定作用机制之间的关联。 统计分析将主要是描述性的。
基线
确定为潜在特殊响应者的案例数
大体时间：基线
统计分析将主要是描述性的。
基线
确认为特殊响应者的已识别潜在病例的百分比
大体时间：基线
统计分析将主要是描述性的。
基线
在适当的知情同意下获得足够组织的已确认异常反应者的百分比
大体时间：基线
统计分析将主要是描述性的。
基线
至少成功获得最小分子特征的组织获得性病例的百分比
大体时间：基线
统计分析将主要是描述性的。
基线
分子特征报告确定（不参考患者接受的药物）至少一个被认为具有潜在治疗相关性的特征的分子特征病例的百分比
大体时间：基线
将针对成功获得最小分子特征的一组案例总结有希望的发现。 对于每个此类案例，分子数据将由专家小组（“小组”）进行审查，以确定有趣的特征。 所有估计的比例都将附有精确的 95% 置信区间。
基线
分子表征报告中具有 >= 1 个特征的病例百分比，这些特征被判断为与患者在经历异常反应时实际接受的特定药物类别具有潜在的治疗相关性
大体时间：基线
将针对成功获得最小分子特征的一组案例总结有希望的发现。 对于每个此类案例，专家组将审查分子数据以确定有趣的特征。 所有估计的比例都将附有精确的 95% 置信区间。
基线
在进一步分析相关分子异常的分子概况数据后发现，具有 >= 1 个特征的病例百分比与发生异常反应的特定资助的作用机制相关
大体时间：基线
将针对成功获得最小分子特征的一组案例总结有希望的发现。 对于每个此类案例，专家组将审查分子数据以确定有趣的特征。 所有估计的比例都将附有精确的 95% 置信区间。
基线

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

赞助

National Cancer Institute (NCI)

调查人员

  • 首席研究员：S. P Ivy、National Cancer Institute (NCI)

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

一般刊物

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2014年9月24日

初级完成 (实际的)

2021年3月4日

研究完成 (估计的)

2025年4月2日

研究注册日期

首次提交

2014年9月16日

首先提交符合 QC 标准的

2014年9月16日

首次发布 (估计的)

2014年9月18日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2024年4月4日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2024年4月3日

最后验证

2024年4月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他相关的 MeSH 术语

其他研究编号

  • NCI-2014-01585 (注册表标识符：CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
  • UM1CA186704 (美国 NIH 拨款/合同)
  • 9671 (其他标识符：CTEP)

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