Biomarkkerin kehittäminen selkäydinlipoomaa sairastavien lasten kliinisten tulosten seurantaan.

Kliininen tutkimus, jossa etsitään massaspektrometrialla havaittavia aineenvaihdunnan biomarkkereita, joita voidaan käyttää oireettoman lipoomapotilaiden "kerrostamiseen". Alhaiseen selkäytimeen liittyvien lipoomien usein laajan luonteen vuoksi oletamme, että lipidikomponentit tai niistä johdetut aineenvaihduntatuotteet voivat päästä lapsen verenkiertoon. Mitä enemmän infiltratiivisilla lipoomilla on suurempi riski oireiden heikkenemisestä, ja väitämme, että niillä pitäisi olla myös suurempi mahdollisuus luoda lipidin "allekirjoitus" vereen ja/tai virtsaan. Vaihe 1 – Selkäydinneste-, veri- ja virtsanäytteet otetaan potilailta, joilla on selkäydinlipooma, jolle tehdään leikkaus (n = 3-5). Tietoinen suostumus toteutetaan asianmukaisen eettisen komitean hyväksynnän jälkeen. Veri- ja virtsanäytteet otetaan ennen leikkausta, ja leikkauksen aikana otetaan aivo-selkäydinnestenäytteet. Massaspektrometria-analyysi tunnistaa näiden potilaiden aivo-selkäydinnesteessä olevat lipidilajit ja sen, missä määrin ne ovat havaittavissa myös potilaan veressä ja/tai virtsassa. Kaikki sekä aivo-selkäydinnesteestä että verestä/virtsasta havaitut lipidilajit edustavat mahdollisia biomarkkereita ja muodostavat tutkimuksen seuraavan vaiheen painopisteen. Vaiheessa 2 arvioidaan näiden potentiaalisten biomarkkerien erotteleva arvo vertaamalla niiden profiileja veressä ja/tai virtsassa kolmesta kliinisestä ryhmästä: (i) Potilaat, joilla on selkäydinlipooma, joilla on neurologisia oireita/merkkejä ja jotka ovat sairaalassa leikkauksessa (ts. samanlaiset potilaat kuin vaiheessa 1). Veri-/virtsanäytteet otetaan ennen leikkausta edustamaan "korkean riskin" ryhmää. (ii) Potilaat, joilla on selkärangan lipooma ja jotka ovat pysyneet oireettomana usean vuoden seurannan jälkeen.

Nämä edustavat "pienen riskin" ryhmää; (iii) Potilaat, joilla on selkärangan sairaudet, joihin ei liity lipoomaa. Nämä edustavat "negatiivista" kontrolliryhmäämme. Ryhmäkoot määritetään teholaskelmilla käyttäen vaiheen 1 potilaan mittauksista saatuja varianssitietoja. Tilastollinen analyysi tehdään 1-suuntaisella ANOVA:lla tai ei-parametrisella ekvivalentilla, jotta voidaan testata merkittäviä eroja kolmen ryhmän välillä. Massaspektrometria (kuva 2) suoritetaan Lastenterveyslaitoksen Proteomiikan, Metabolomiikan ja Lipidomiikan keskuksessa käyttäen nano ultraperformanssinestekromatografiaa ja ultraperformanssikonvergenssikromatografiaa - kvadrupolin lentoaikamassaspektrometria, uusi massaspektriteknologia lipidomiselle ja metabolomiselle. analyysi. Ultra suorituskykyinen konvergenssikromatografia on kromatografiatekniikka, joka käyttää erittäin kriittisessä nestetilassa olevaa hiilidioksidia liikkuvana faasina ja mahdollistaa metaboliittien ja lipidien fraktioinnin niiden luokan mukaan, ei hydrofobisuutta. Se mahdollistaa kaikkien kudoksessa olevien tärkeimpien lipidiluokkien kvantifioinnin, mukaan lukien fosfolipidit, vapaat rasvahapot, esteröidyt rasvahapot, kolesteroliesterit ja sterolit. Ei-lipidimolekyylit (esim. koliini) saattaa myös osoittaa muuttunutta runsautta lipoomapotilailla, joten myös yleisempi metabolomiikkaanalyysi suoritetaan, jos aika sallii.